Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,745,019 | 0 | C | G | 38.5% | 79.8 / 26.4 | 78 | G72G (GGC→GGG) | yiaN | 2,3‑diketo‑L‑gulonate TRAP transporter large permease protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/29); new base G (21/9); total (40/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAT‑G‑GCGAGCCTTTC‑TGGTTCTGC‑CGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGG‑TCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCC > NC_000913/3744784‑3745255 | ccACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAACATTGATgc‑gggcg > 1:2923663/1‑237 (MQ=255) ccACCGAAAGATGCTTAATCATAGCTGGTCTGATTTGTCTGCTCTGTCTGTTTGGTGGTATTGCTCCCGGTTCG‑CCGATTGCCTGGGCAG‑TGTTTTTGTCCGGTGCGGCGTTAAGTTTCTGGCTGGACATTTTTGATGTCCAGATCTTGGCACATGCGCTGGTGAACGGAGCCGATAACTTCTCCCTTCTGGCGGTTCCTTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATgc‑gggcgtc < 2:1841663/239‑3 (MQ=255) aCCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑tt < 1:1172586/239‑1 (MQ=255) aaGGAGTTTAAGCATGGGTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTGTTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCa < 2:2299218/238‑1 (MQ=255) gCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑Cg < 1:1006075/238‑1 (MQ=255) cTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCGC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGCGAAAACATGAATGC‑GGGGGGC‑CT‑G‑TTAACA‑CCCa > 1:2883988/1‑239 (MQ=255) cTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGCGGGGGGAAATATTAAATGG‑GGGCGCC‑TG‑T‑TCaaaaa > 1:1904051/1‑236 (MQ=255) ttAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑c < 1:531373/235‑1 (MQ=255) ttAACCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑t < 1:3366795/239‑1 (MQ=255) tGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAACATGAATGC‑GGGCGGC‑GT‑G‑TCAAAA‑AGCA‑TTGTTGa > 1:738012/1‑238 (MQ=255) ggcttgtgCTGTTTTTTGGGGTGTGTCTGTTGGTTGGTTTTGCTAGGGTTTGG‑CTTTTTGCCGGGGCCC‑TTTTGTTGTGGGGGGGGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTGGATGTCAAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCGGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCTTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTAAAATCATGAATGC‑GGGCGGT‑TT‑G‑TAAAAA‑CGCA‑TTGTTGAc < 2:1499406/235‑1 (MQ=255) gCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCCCAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAGCAGTAATGG‑GGGGCGG‑TT‑G‑TTTAAA‑AGCA‑ctgttgtgcg > 2:1991764/1‑235 (MQ=255) gCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGAAAACAAGAATGC‑GGGGGGC‑GT‑G‑TTCAAA‑CGCATTTGTTGAcc > 1:783630/1‑239 (MQ=255) cTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCt < 1:839214/238‑1 (MQ=255) tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATTAATGC‑GGGCGGG‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTTAGCTGCCg > 1:1499406/1‑239 (MQ=255) tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAATTATTAATTG‑GGGGGGC‑CT‑G‑TTCAAA‑CGGT‑ATGTTGTCCt > 1:1808567/1‑235 (MQ=255) tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAACATGAAAGC‑GGGGGGG‑TTGG‑TCAAAA‑‑GAA‑ttgttgt > 1:1882147/1‑231 (MQ=255) tgCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAACATGAAAGC‑GGGCGGG‑TT‑G‑TCAAAA‑AGCA‑ATGTTGACCTGCCg > 1:1956399/1‑239 (MQ=255) gCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGCGGAATCTAGAATGC‑GGGGGGG‑CT‑G‑TCCAAA‑ACCA‑TTGTTGActgtgc > 2:1155205/1‑232 (MQ=255) ttttCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAATCATGAATGC‑GGGGGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑AGCA‑ATGTTTACCTGCCggttaa > 1:735258/1‑232 (MQ=255) tttggtGGGCTGTTTGTGGGGTGTTA‑TGCTTTTGGTTTGCCCTATGGCCTGGGCAT‑TGTTGTTGTGCGGGGGGGCTTTAATGTACTGGCTGGACATGTTTGATGCCCAGTTCATGGCACAAACGCGGGTGAAGGGGGCCGATAGCTTCCCCCTGCGGGCGTTTCCTTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAAGGG‑GGGCGGT‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGCCCTGCCGATGAAAc < 2:3044269/234‑1 (MQ=255) ttCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCa < 1:1291083/209‑1 (MQ=255) 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ggTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑CT‑G‑TCAAAA‑AGCA‑TTGTTGTCCCGCCGATGaaa > 1:2290703/1‑204 (MQ=255) g‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAATCATGAATGC‑GGGGGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTTGCCTGCCGATGAAACAGGGGGGGGATAAACCAGGCGGGCTGGGGCTACg‑cggcg > 1:1177167/1‑239 (MQ=255) g‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGAAATCATGAATGC‑GGGGGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTTTTTGCCTGCCGATGAAACTTGTGGGGGCTAAAACAGACGGGGT‑GGGGTACGTCGGCg > 2:3004155/1‑239 (MQ=255) ggctgtggCTC‑TTTTGTGGTGCGGGGTGGTTTTAATGTCCTGCGTGCACTGTTTTGTTGCCCATCTTATGCCTCAACGGCTGGGAAAGGGGGCCATAAGCTTCTCCCTGCGGGCGATGCCTTTTTTTGTGGTGGC‑GGGGGAAACCAGGAGTGC‑GGGCGAT‑TG‑G‑ACAAAC‑CGGG‑TTGTGGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTACTgg < 2:2893050/233‑1 (MQ=255) ggggcgtttgtgtggtGCGGGGGGTCGTTAATGTTGTGGCTGGACATGTGTGCTGGCGAGATCAGGCCACAAACGCTGGTGAACAGGTCCGATCGTTTCTCCCTGGGGGCTGTTCCGTTTTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TGGTGGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGc < 2:2211680/229‑1 (MQ=255) gggCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACACACGCTGGTGAACGGAGCCGCTCGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGATCAATCCCGTATAC‑GGGGGGC‑TT‑G‑TCCCAA‑CGCC‑TTTTTTTCCTGCCCCTCACACTCGTCGGGCGTCAACCACGCGGGCG‑TGGCCACGTCTgcgcgcgtggccc > 2:2941064/1‑231 (MQ=255) 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tgtgCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGTAATCATGAATGG‑TGGCGGC‑TC‑G‑CTAAAA‑CACA‑TTGTTGGCCCTACCATGGAAATGGGGGGGCATAAAACCGGCGCGGC‑GGGCTTCGTGTGCGGGCTGGGACGGATGATTAT‑G‑Gc > 2:2571549/1‑238 (MQ=255) tgggCGGGGCGGCGTTAATGTTCGGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCCCAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTTTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGGGGC‑TT‑G‑TAAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAT‑G‑GCg < 1:3004155/236‑1 (MQ=255) cGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAACATGAATTC‑GGGGGGG‑TT‑G‑t > 2:1106892/1‑143 (MQ=255) gggCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAATCATGAAAGCGGGGGGGC‑TG‑G‑TAAAAC‑CGCA‑tttttgc > 2:3509276/1‑157 (MQ=255) cgTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGTTTCCGTTCTTTGTGCTGGG‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGAc < 1:1527705/152‑1 (MQ=255) cgTCAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑Gggcggc < 1:3259541/131‑1 (MQ=255) tAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAT‑G‑GCGAGCCTTTC‑TGGTTc < 1:2770190/238‑1 (MQ=255) ctggctggACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGGAAATAAGAAAGA‑GGGCGGC‑TT‑G‑GCAAAA‑c > 2:3259541/1‑131 (MQ=255) ctggctggACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGAAATTATTAATGC‑GGGGGGC‑TT‑G‑TCCAAA‑CACC‑TTTTTTTCCTGCCGATGa > 2:1527705/1‑152 (MQ=255) gctggACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGTTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCCCCCTGCTGGCGATTCCTTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACtggtg < 1:1277581/157‑1 (MQ=255) tggACATGTTTGATGTCCAGATCAAGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCCCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAGAACAAGAAAGC‑GGGGGGCGCT‑G‑TCACAA‑‑GCC‑CTGTTTGCCCTCCGATGAAACCGGTGAGGCACAAAACAGGCGGGTC‑GGGCCACCGCGGCGGTGTGGCAGCTATGAGTAT‑GTGTGCGCC‑TTC‑TCGGTCTGC‑CGttcaggg > 2:713391/1‑233 (MQ=255) aTGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGGGAAATCATGAATTG‑GGGGGGC‑CT‑G‑TCAAAA‑CCAC‑ATGTTGAGCGTCGGGTGAAAATGGGGGGGCCGAAACCACGCGGGGT‑GGGCGACGTCGGCGGGCTGGGGGCGACGATTAA‑G‑GCGAGGCTCTC‑TGGGTCTTG‑CGTTTCGGGTAcggccgc > 2:2667264/1‑235 (MQ=255) aTCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGGGCCGATAGCTTCTCCCTGCGGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCa < 1:3074727/177‑1 (MQ=255) 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gcggt‑TT‑G‑AAAAAC‑CGCT‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAT‑G‑GCGAGCCTTTC‑TGGTTCTGC‑CGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGG‑TCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTcc < 1:410277/238‑1 (MQ=255) | CCACCGCAAGGAGCTTAATCATGGCTGTGCTGATTTTTCTGGGCTGTCTGTTGGGTGGTATTGCTATCGGTTTG‑CCTATTGCCTGGGCAC‑TGTTGTTGTGCGGGGCGGCGTTAATGTTCTGGCTGGACATGTTTGATGTCCAGATCATGGCACAAACGCTGGTGAACGGAGCCGATAGCTTCTCCCTGCTGGCGATTCCGTTCTTTGTGCTGGC‑GGGTGAAATCATGAATGC‑GGGCGGC‑TT‑G‑TCAAAA‑CGCA‑TTGTTGACCTGCCGATGAAACTGGTGGGGCATAAACCAGGCGGGCT‑GGGCTACGTCGGCGTGCTGGCAGCTATGATTAT‑G‑GCGAGCCTTTC‑TGGTTCTGC‑CGTTGCGGATACCGCCGCCGTTGCCGCTCTACTGGTGCCGATGATGCGCAGCGCCAACTATCCGG‑TCAACCGGGCGGCGGGGCTGATTGCCTCTGGCGGCATTATCGCGCCAATTATTCC > NC_000913/3744784‑3745255 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |