| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2753972 = | 73 (0.860) | 3 (0.040) | 3/536 | 9.7 | 4.1% | intergenic (+26/+36) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein |
| ? | NC_000913 | 2754001 = | 70 (0.860) | intergenic (+55/+7) | bamE/ratB | lipoprotein component of BamABCDE OM biogenesis complex/UPF0125 family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCTCAACGGCAATT > NC_000913/2753723‑2754287 | cTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGttat > 2:555997/1‑289 (MQ=255)cTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAAC‑‑‑TAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGttattta > 1:515894/1‑289 (MQ=255)cTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGCTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACACTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGttat > 1:166456/1‑289 (MQ=255) aTCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCt > 1:34070/1‑288 (MQ=255) tCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCAGTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGa < 1:354763/289‑1 (MQ=255) ttGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCACAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGt > 1:707482/1‑289 (MQ=255) caacaacaaGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAg < 1:231868/289‑1 (MQ=255) gTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCg > 1:64074/1‑288 (MQ=255) ttGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGa < 1:440935/289‑1 (MQ=255) tACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGTCGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCgg > 1:664923/1‑288 (MQ=255) tGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATga > 2:266714/1‑287 (MQ=255) acgccTGATGTCGGATCCAGTTGATACGAATACCTGCTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGAt < 2:759284/285‑1 (MQ=255) acCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGAt < 1:9088/289‑1 (MQ=255) acCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTAAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTGGGATCGGCAATGAGAGGCCGa > 2:592598/1‑288 (MQ=255) ccGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGAt > 1:11462/1‑288 (MQ=255) ccGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGAt > 2:123191/1‑288 (MQ=255) cGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGTCCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAACAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATa > 1:259493/1‑288 (MQ=255) tGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCCCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAAtc > 1:726842/1‑289 (MQ=255) cGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGGAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAACCTCCAccc > 2:677067/1‑289 (MQ=255) cGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGAACAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATCTTTCTGCTCGTTGCCTGCGACGCTCTTTCGGATCGGCCATGAGAGGGCGATACAcctctcacc > 1:129367/1‑284 (MQ=255) aTCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGa > 1:94684/1‑289 (MQ=255) tttGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGcc < 1:393685/289‑1 (MQ=255) tttGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTACTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGcc < 2:131812/289‑1 (MQ=255) gtgcGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTTACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcatc < 2:4291/285‑1 (MQ=255) gTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCcatca < 2:329543/289‑1 (MQ=255) gAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATGAATCTCCACCCGATCGCCATCATGca < 1:544572/289‑1 (MQ=255) gAATACCTGGATCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATTAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGATTGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGca < 2:621914/289‑1 (MQ=255) ttCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTACCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTACATCCGAACGCCATCATGCCCACTACCGCt > 2:107902/1‑289 (MQ=255) ttCCGCCAGCAACCAGGTCCTGAAGGTGTAACCCAGCAAACGCTCACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGGGTGTTGACCAATATTGATGACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTCATTTAGTCGCTGATGTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTCTCGGACCGGCAACGAGAGGGCGATAAGTCTCCACCCGATCGCCACCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTCGc > 2:189190/1‑289 (MQ=255) tCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCCTCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGcc > 1:446507/1‑289 (MQ=255) tCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGATGTGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGGACCTTTTCTATGTCTGTAATTTATTCGCTGATTTTTTTTCCCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGTCATCATGCACACTCTCGCTTATGtttt > 2:690711/1‑287 (MQ=255) 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gctgacCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCgg < 2:617014/289‑1 (MQ=255) acCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTa < 1:629827/287‑1 (MQ=255) tAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCa < 1:266714/289‑1 (MQ=255) 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tatTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAACAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCCCCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTCCCGGACTGCTGTAAATGCAGAATTTGTTTTTAGTTAAACCGATATCGGTACGAAATTCCAGCAAGCTATCTGCGCTAATAg > 2:290264/1‑289 (MQ=255) tatTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAg > 1:59277/1‑289 (MQ=255) aTAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTTCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACTCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGcttct > 2:74872/1‑289 (MQ=255) aTAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGcttct > 1:163880/1‑289 (MQ=255) aTAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGcttct > 1:642915/1‑289 (MQ=255) aaaCCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGcc > 2:140505/1‑172 (MQ=255) aaaCCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGcc < 1:140505/172‑1 (MQ=255) aCCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCg > 1:161951/1‑289 (MQ=255) tGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTcg < 2:163880/289‑1 (MQ=255) cgcTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTTCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACTCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTcgcg < 1:74872/289‑1 (MQ=255) aataataaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTc > 2:419945/1‑289 (MQ=255) taataaAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATTGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCAACTGGCGCGAATAGCTTCCTCAACCGTCCCGCCCCCCCGCAGCCTccc > 2:653443/1‑287 (MQ=255) aaaGTTGATTACACAGTCGTTAAAAAAGATGATGAATTGGAACATTTTGTCTTTCTGTTATTTATTCGCACATTTTTCCGCTCGTTGCCTGCGATCCTCTTCCGGATCGGCAATAAGAGGGCTATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATTAACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAGTGCCTGCTTTGTTTTTAGTTAAATCGTTATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGc < 2:525922/289‑1 (MQ=255) gTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGc > 1:450920/1‑289 (MQ=255) gTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCATTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGatat > 1:158429/1‑212 (MQ=255) gTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCATTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGatat < 2:158429/212‑1 (MQ=255) ctctCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGCATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCCgg > 1:551246/1‑288 (MQ=255) ctctCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCAGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAgg > 1:291929/1‑288 (MQ=255) ctctAAATGACATTAAAAAATGTTCTCATTGAGTCCCTTTTTTCTGTCTTTTATTTATGCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACTCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAgg < 2:188008/288‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACt < 1:677615/287‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACt < 1:490318/287‑1 (MQ=255) aCGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACTTTTTGTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCGGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATCAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAAGGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTtct < 1:455421/289‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTGCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTa < 1:62118/289‑1 (MQ=255) tGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCAt > 2:543896/1‑288 (MQ=255) aaTGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGc < 1:123191/287‑1 (MQ=255) aGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCt > 1:103755/1‑288 (MQ=255) gCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTTAACCGTCCCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGTTTCTCAGGTAGCGCATAATCCAcccc > 1:748616/1‑286 (MQ=255) tctgtctgTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCTCAACGGCAAtt < 2:94684/288‑1 (MQ=255) | CTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTCTCAAAGACGTTAAAAAAGGTGCTCAATGAGCACCTTTTTTCTGTCTGTTATTTATTCGCTGATTTTTCTGCTCGTTGCCTGCGAAGCTCTTTCGGATCGGCAATGAGAGGGCGATAAATCTCCACCCGATCGCCATCATGCACACTATCGCTTA‑GTTTTGCCGGACGGCTGTAAATGCCGACTTTGTTTTTAGTTAAATCGATATCGGTACGCAATTCCAGCAAGCCACTGGCGCGAATAGCTTCTTCAACCGTCGCGCCCTCCTGCAGCGTCACTCGCTGCAGGTACTGCTTCTCAGGTAGCGCATAAGCCACCTCAACGGCAATT > NC_000913/2753723‑2754287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |