| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3089263 = | 90 (1.060) | 3 (0.040) | 3/556 | 9.9 | 3.0% | coding (980/1395 nt) | galP | D‑galactose transporter |
| ? | NC_000913 | 3089461 = | 107 (1.270) | coding (1178/1395 nt) | galP | D‑galactose transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGACCATGCTCAACACGCTGGGTAACGCCAACACCTTCTGGGTGTATGCGGCTCTGAACGTACTGTTTATCCTGCTGACATTGTGGCTGGTACCGGAAACCAAACACGTTTCGCTGGAACATATTGAACGTAATCTGATGAAAGGTCGTAAACTGCGCGAAATAGGCGCTCACGATTAATCTCCCCAAGCTTCCTCCCATCGCGGAGGAAGCCACCTCTTGCAGTCATCTTTTCTTCGCTCTATCCTCT > NC_000913/3089183‑3089748 | cGTACTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGAtt > 1:534399/1‑289 (MQ=255) aCTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGc < 1:561555/288‑1 (MQ=255) cTTGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACATTGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCa < 1:65747/289‑1 (MQ=255) ttGCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCa > 1:658145/1‑288 (MQ=255) gCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCaa < 1:717718/287‑1 (MQ=255) gCCACCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACa > 2:468702/1‑289 (MQ=255) aCCTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGa > 1:509189/1‑289 (MQ=255) cTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATc > 1:704939/1‑289 (MQ=255) cTTTATCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCCCCACTGCCACCAACTTGATTGCCAACATGacc > 2:365087/1‑287 (MQ=255) tCGCAATCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTgg > 1:74475/1‑289 (MQ=255) aagcGGCCTGGTTGACCGGTGGGGACGTAAACCAACGCGAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGGGGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTAGTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCAGGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCa < 2:699194/286‑1 (MQ=255) aaccgggcgtgttgtGCGCTGGGAACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCGTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATGGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCAACACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCa < 1:132887/280‑1 (MQ=255) aaTCGGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGTGCGTACTCGGGACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCa < 2:428299/289‑1 (MQ=255) aaTCGGCCTTGTGGATGGCTGGGTACGGAACCCAACGCTAGAGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGCGCGTACTAGGTACAATGATGCATTTCGGTATTCGCTCGCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTATATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGATACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCa < 1:320444/289‑1 (MQ=255) aTCCGCCTTGTTGACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGCTGGCTCCTGGCATGGGCGCACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCAGTCGCCGCGGCCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGCTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCTGTCCGCTGATTTGGGTAATGTGCTCCGACATTCCGCCGCTGAAAGGCTCCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACTAACTGGATTTCCAACATGATCGTTGgcgcca > 2:225232/1‑287 (MQ=255) cTTGTTGAGGGCGTGGTACGTAAACCAACGCTAAGGCTGGGCTGCCTGGGGATGGCTGCGGGCATGTGCGTACTCGGTAGAATAAGGGATAGCGGTAGTCACTCTCCGTCGGCGCAGGATTGCGCCAGCGCCAGGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTGTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTTGGTACTGTGCTCCGAAATTCCGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTcc < 2:307619/289‑1 (MQ=255) gttgACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGa > 2:240529/1‑289 (MQ=255) ttgACCGCTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCCCTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGa < 1:382119/288‑1 (MQ=255) gACCGCTGGGGACGTAAGCCAACGCTACCGCTGGGCTTTCTGGTGGTGGCTGCTGGCAGTGGCGTACTCGGGACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGGCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCGCCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGAcc < 1:389688/288‑1 (MQ=255) gACCGCTGGGAACGTAAGCAAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCGGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCTCTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGAcc < 1:621590/288‑1 (MQ=255) cTGGGGACGTAAACCAACGCTAACGCTGGGCTTCCTGGTGATGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGACCATGCTc < 1:745304/289‑1 (MQ=255) aCCAGCGCTAAGGCTGAGGTTCCTTGTGATCGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGACCATGCTCAACACGCTGGGt < 2:658145/289‑1 (MQ=255) 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ggagtggctggcGGCATGCGCGTACACAGTGCACGGATGCAAATAGTGATTTACTCACCGGGGGGTCATTATTTCGCCGTCCCCTTGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTTATTTGGGGACTGTGCTCCGAAATTCAACCGCTGAAAGGCCGCGATGTTGGCATCGCCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGACCATGCTCAACACGCTGGGTAACGCCAACACCTTCTGGGTGTATg < 2:444799/285‑1 (MQ=255) aTGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTGCCAACATGATCGTTGGCGCAACGTTCCTGACCATGCTCAACACGCTGGGTAACGCCAACACCTTCTGGGTGTATGCgg > 1:13415/1‑289 (MQ=255) tGGCTGCTGGCATGGGCGTACTCGGTACAATGATGCATATCGGTATTCACTCTCCGTCGGCGCAGTATTTCGCCATCGCCATGCTGCTGATGTTTATTGTCGGTTTTGCCATGAGTGCCGGTCCGCTGATTTGGGTACTGTGCTCCGAAATTCAGCCGCTGAAAGGCCGCGATTTTGGCATCACCTGCTCCACTGCCACCAACTGGATTTCCAACATGATCGTTTGCGCAACGTTCCTGACCATGCCCAAAACGCTGGGTAACGCCCACACCTTCTGGGTTTATGCGGc > 2:74175/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |