| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3905048 = | 90 (1.060) | 3 (0.040) | 3/552 | 9.9 | 3.2% | coding (550/1878 nt) | bglF | fused beta‑glucoside‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component |
| ? | NC_000913 | 3905536 = | 94 (1.130) | coding (62/1878 nt) | bglF | fused beta‑glucoside‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCGCCATCAAACCGATCAGAGGCGTAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAACTTGCCCTCTACCGCTTTGCGGCAAAACTCCAAAAAAAAACCTG‑AAAAAAACGGCCTGACGTGAATCAAGCAATTTTTTTCAGGTTTTGCCCGCTTAGTGCGGTAACAATCCTTTACTCAGTAATAATATTTCAGTGTTCTTTGCGCACGCGCTCTATATTTATGGCTAAAAACATAATCTCTGCGGGTGAAATTTTACGTTGATACTGCAAACCAATAAAAAT > NC_000913/3905249‑3905823 | ccgccATCAAACCGATCAGAGGCGTAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCa < 1:311831/288‑1 (MQ=255) cgccATCAAACCGATCAGAGGCGTAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGa < 1:584438/289‑1 (MQ=255) cATCAAACCGATCAGAGGCGTAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCC‑GCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTca < 1:602369/289‑1 (MQ=255) aTCAGAGGCGTAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACACTGTTAt > 1:353283/1‑289 (MQ=255) agagGCGTAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTg < 1:527140/289‑1 (MQ=255) tAAAAATACCTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGccccc < 1:389239/289‑1 (MQ=255) cTGAAATAACATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGc > 1:47260/1‑289 (MQ=255) cATAAACAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTAtttt > 1:63584/1‑289 (MQ=255) aCAAAGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTgg > 1:105763/1‑289 (MQ=255) aGCGGTTTAGCAGATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTa > 2:379525/1‑288 (MQ=255) 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aGCAGTTTACCTTTATCATCAGTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTc < 1:411309/288‑1 (MQ=255) gATTGCCTGTATCATCATTTTCGCTTGCCTGTTCAGCTTTTCCTTCAATGCCTGCCACACTGTCAACCGCCAGGAAGACATCAGCAACATGGTTACCTATGCCCACCTGAAACTGACCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTCTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAAc < 2:424177/289‑1 (MQ=255) gATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAAc < 1:132891/289‑1 (MQ=255) gATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAAc < 1:735205/289‑1 (MQ=255) gATTACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAAc > 2:88708/1‑289 (MQ=255) tACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATACCTTg > 2:181302/1‑289 (MQ=255) tACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAACTTg > 1:73114/1‑289 (MQ=255) tACCTTTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTCAATTTAAAACGTA‑ATCGCCTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACCCCTCCATAACTTg > 2:312619/1‑289 (MQ=255) aCCTGTATCATCATTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCAACCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAACTTg < 1:678597/288‑1 (MQ=255) 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tcatcaTTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGGGGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTg > 2:553348/1‑232 (MQ=255) catTTTCCGGTGCCTGTTGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTCTGACCACCTGAACCTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCGACGGTCTTTTTCAGTACCTCTGCTTGCGCTTTGCTTTCCTCCCTCAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTCCCCAATCCCTCAGACTCACCATGTTATCTGCCCCCCCCCCTCCCTCCACCCTTTCTCTGGCTAACCCCGTACTCACTTGccccgttccccc > 2:706396/1‑280 (MQ=255) gTGCCTGTGGCGCTTTTTCGTCAAGGCCTGCCACACTGTTAACCGCCAGGAAGACATCGGCCACATGGTTACCTATGACCACCTGAAACTGGCCACCGCTTTCCACCACCATAATAATACCTGGGGTCTTTTTCAGTACCTCGGCTTGCGCTTTGCTTTCATCCTTTAATTTAAAACGTA‑ATCGCGTTGCGCAATGCATCAGACTCACAATGTTATCTGCGCCCCCGACTCCTGCGACTATTTTTCTGGCTAACTCCGTCATAACTTGCCCTCTACCGCTTTGCGGCaa < 2:442308/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |