Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,879,829 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (115‑120/360 nt) | yeaR ← | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1879829 = | 2 (0.020) | 138 (1.050) | 90/192 | 0.1 | 98.5% | coding (120/360 nt) | yeaR | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 1879834 | 2 (0.020) | 86 (0.660) | 65/190 | 1.1 | 97.6% | coding (115/360 nt) | yeaR | DUF1971 family protein, nitrate‑inducible |
? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
GCTTCGATAAGGATCACCTGATCAGGCTCTGCACTGTGTTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1879737‑1879834 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT > NC_000913/2514274‑2514374 GCTTCGATAAGGATCACCTGATCAGGCTCTGCACTGTGTTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACC < 1:3367766/99‑1 CGATAAGGATCACCTGATCAGGCTCTGCACTGTGTTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCAT < 1:2363497/99‑1 GATAAGGATCTCCCGATCAGGCTCTGCACTGTGTTCATCAGCGAAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATA > 1:3054369/1‑99 ATAAGGATCACCTGATCAGGCTCTGCACTGTGTTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAATGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAA > 2:752019/1‑99 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TGTTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC < 2:1931715/99‑1 TTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG > 1:2265550/1‑99 TTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG > 1:2081367/1‑99 TTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG > 2:3319469/1‑99 TTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACAGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG > 1:3305384/1‑99 TCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCCTAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA < 1:3276665/99‑1 TCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGA < 1:205226/99‑1 cagCAGCGTAGCCGAGATACTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 2:3059521/96‑1 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AAACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:1516443/99‑1 ACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCC > 2:1400729/1‑99 ACCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCC > 2:26646/1‑99 CCCATAAGCGCTAACTTGAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGAGTTAACGTGCCGATGAATTAATCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCACAT > 2:428432/1‑99 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCagat > 1:2089114/1‑95 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAT > 1:1411646/1‑99 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATA < 2:2719768/99‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATA > 2:2746226/1‑99 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATA > 1:1970417/1‑99 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGTTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:3237438/99‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTGACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGGCCATAT > 2:3230102/1‑99 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:2290237/99‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT > 2:134975/1‑99 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT > 2:1893683/1‑99 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTAACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:1649490/99‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGACGATGAATTACTCTCACGATATCTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:3109474/99‑1 GCTTCGATAAGGATCACCTGATCAGGCTCTGCACTGTGTTCATCAGCGTAGCCGAGATATTTGACCGCCCCATGCATAACGGAAAGGCGTGGGTAAACccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1879737‑1879834 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT > NC_000913/2514274‑2514374 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |