| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,292,991 | +T :: IS1 (–) +7 bp | intergenic (‑69/‑530) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 19795 = | NA (NA) | 117 (0.890) | 84/192 | 0.2 | 100% | intergenic (+175/+16) | nhaR/insB1 | transcriptional activator of nhaA/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913 | = 1292997 | 0 (0.000) | intergenic (‑75/‑530) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 291401 | NA (NA) | 105 (0.780) | 71/196 | 0.8 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1292991 = | 0 (0.000) | intergenic (‑69/‑536) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
GTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGC > NC_000913/1292893‑1293089 | cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccc < 2:517970‑M2/1‑1 (MQ=255) gctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAg > 1:2654377‑M2/94‑99 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGc > 1:3034284‑M2/93‑99 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGC < 2:3050494‑M2/99‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGC < 2:1684336‑M2/99‑1 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGcc > 2:1929779‑M2/92‑99 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCa > 1:1117455‑M2/91‑99 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCa < 2:439061‑M2/9‑1 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCa > 2:1399840‑M2/91‑99 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtg > 2:2936210‑M2/1‑97 (MQ=255) tacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAg < 1:1530174‑M2/10‑1 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtgg > 1:1965962‑M2/1‑96 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtgg > 1:1988480‑M2/1‑96 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggta < 2:3255464‑M2/99‑6 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGa > 2:1511818‑M2/88‑99 (MQ=255) tttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaa > 2:3120742‑M2/1‑93 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaat > 2:862890‑M2/1‑92 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATg > 2:2487311‑M2/85‑99 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatga > 2:2183353‑M2/1‑90 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATCGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatga > 2:3107772‑M2/1‑90 (MQ=255) gCTTCGATCATTGTAGTACTCTCAGACTGATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGGCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatggctcc > 2:1999339‑M2/1‑86 (MQ=255) cagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGa > 2:2615‑M2/79‑99 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaa < 2:2268679‑M2/99‑16 (MQ=255) gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAAt > 2:2537830‑M2/77‑99 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAAtt > 1:326701‑M2/76‑99 (MQ=255) gCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaactt < 1:1764595‑M2/99‑19 (MQ=255) gatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCa > 1:2572806‑M2/74‑99 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaa > 1:2762663‑M2/72‑99 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaaa < 2:2759745‑M2/29‑1 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattg < 1:2144215‑M2/99‑23 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattg < 1:1866211‑M2/99‑23 (MQ=255) ttGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattga > 1:3224568‑M2/1‑76 (MQ=255) ttGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattga > 2:3024367‑M2/1‑76 (MQ=255) aaacagaagccactggatcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 1:671391‑M2/31‑1 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAtt < 2:2322926‑M2/31‑1 (MQ=255) aacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTg < 2:1565497‑M2/32‑1 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGtt < 1:2933521‑M2/34‑1 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttt < 1:1799248‑M2/99‑32 (MQ=255) aTCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 1:2546397‑M2/1‑68 (MQ=255) tctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATGCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 2:1781127‑M2/1‑67 (MQ=255) ctcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgtttta > 1:2267005‑M2/1‑66 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaccttattgatagtgttttat > 2:333463‑M2/1‑65 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttat < 2:2141365‑M2/99‑35 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt < 2:2307130‑M2/43‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt < 1:1447739‑M2/43‑1 (MQ=255) aaaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgtattatgt < 1:2691591‑M2/99‑37 (MQ=255) aCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc < 1:2032331‑M2/99‑39 (MQ=255) atTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa < 1:133312‑M2/99‑45 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCa > 2:1902467‑M2/48‑99 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCa > 2:2445074‑M2/48‑99 (MQ=255) tGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg < 1:43835‑M2/99‑47 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaat > 1:2506201‑M2/46‑99 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga > 2:563138‑M2/1‑48 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaat < 1:400197‑M2/58‑1 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCaataaat < 1:644046‑M2/58‑1 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTGATAATAGAGCGTTAAATGCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 2:2682411‑M2/1‑47 (MQ=255) ggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 2:2422072‑M2/1‑47 (MQ=255) gtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg < 1:597344‑M2/99‑54 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATc > 2:2794881‑M2/39‑99 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgact > 1:2221077‑M2/1‑43 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATctttg > 1:2781004‑M2/35‑98 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCtttt < 1:312681‑M2/65‑1 (MQ=255) atacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCa < 2:1768006‑M2/67‑1 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:1609732‑M2/99‑62 (MQ=255) aGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc < 1:466246‑M2/99‑62 (MQ=255) ggTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:2964316‑M2/1‑37 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATa > 2:9240‑M2/31‑99 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATa > 1:730903‑M2/31‑99 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttaatgaaagtgttttatgatcagataatccccgatgactttgtcat < 2:2879428‑M2/99‑64 (MQ=255) taataaTAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatg > 2:2545749‑M2/1‑35 (MQ=255) actaaatcagtcagttggcagcatcaccCAATAGCCACGCATGTAAGGACTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAACCTCTTTTCCTaaa > 2:1868411‑M2/29‑99 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaa > 2:798942‑M2/29‑99 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgc < 1:657229‑M2/99‑66 (MQ=255) ataataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 2:111654‑M2/99‑67 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTa > 1:1164431‑M2/25‑99 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc > 1:1360259‑M2/1‑31 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTGGTGCAATAGCtggtaatgcctccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttggtcatgcagg < 2:2063053‑M2/99‑69 (MQ=255) tcagtaagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc < 1:346210‑M2/77‑1 (MQ=255) agagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 1:2952246‑M2/99‑72 (MQ=255) gagCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 1:2434197‑M2/1‑27 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 2:622248‑M2/99‑74 (MQ=255) agCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 1:875438‑M2/1‑26 (MQ=255) taagttggcagcatcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGa > 1:2622441‑M2/19‑99 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacc > 2:43244‑M2/1‑25 (MQ=255) gCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccacc < 1:1269726‑M2/99‑75 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat < 1:2313272‑M2/99‑78 (MQ=255) ttCAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttgga > 2:1845315‑M2/1‑17 (MQ=255) cAGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgaga > 2:2297116‑M2/1‑15 (MQ=255) aGTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 2:1284358‑M2/1‑14 (MQ=255) gTTGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac < 2:2356026‑M2/99‑87 (MQ=255) ttGTGCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacg < 1:996511‑M2/99‑88 (MQ=255) tcaccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCGTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat > 2:530731‑M2/6‑99 (MQ=255) gtgCAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgac > 1:3309595‑M2/1‑10 (MQ=255) accCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCatat > 1:1070775‑M2/4‑99 (MQ=255) ccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata > 1:2973791‑M2/3‑99 (MQ=255) ccCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata < 1:2917112‑M2/97‑1 (MQ=255) cCAATAGCCAGGCATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGCCATATAg > 2:1467624‑M2/2‑99 (MQ=255) cCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATTTCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg > 2:1642092‑M2/2‑99 (MQ=255) cCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg < 2:3129904‑M2/98‑1 (MQ=255) cAATAGCtggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 2:2581569‑M2/99‑93 (MQ=255) | GTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGC > NC_000913/1292893‑1293089 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |