Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 762,485 | 0 | A | C | 28.2% | 202.2 / 12.0 | 85 | T322P (ACC→CCC) | sucB | dihydrolipoyltranssuccinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/13); new base C (0/24); total (48/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.98e-12 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TGAAGCCCTGAAACGTTACCCGGAAGTGAACGCTTCTATCGACGGCGATGACGTGGTTTACCACAACTATTTCGACGTCAGCATGGCGGTTTCTACGCCGCGCGGCCTGGTGACGCCGGTTCTGCGTGATGTCGATACCCTCGGCATGGCAGACATCGAGAAGAAAATCAAAGAGCTGGCAGTCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTT‑GAAGATCTG‑ACCGGTGGTAACTTCACCATCACCAACGGTGGTGTGTTCGGTTCCCTGATGTC‑TACGCCGATCATCAACCCGCCGCAGAGCGCAATTCTGGGTATGCACGCTATCAAAGATCGTCCGATGGCGGTGAATGGTCAGGTTGAGATCCTGCCGATGATGTACCTGGCGCTGTCCTACGATCACCGTCTGATCGATGGTCGCGAATCCGTGGGCTTCCTGGTAACGATCAAAGAGTTGCTGGAAGATCCGACGCGTCT > NC_000913/762250‑762723 | ggAAGCCCTGAAACGTTACCCGGAAGTGAACGCTTCTATAGACGGCGATGACGGGGTTTACCCCAACTATTTCGACGTCAGCATGGCGGTTTCTACGCCGCGCGGCCTGGTGACGCCGGTTCTGCGTGATGTCGATACCCTCGGCATGGCAGACATCGAGAAGAAAATCAAAGAGCTGGCAGTCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTT‑GAAGATCTG‑ACCGGTGGTAACTtcacca < 1:576817/238‑1 (MQ=255) 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TGAAGCCCTGAAACGTTACCCGGAAGTGAACGCTTCTATCGACGGCGATGACGTGGTTTACCACAACTATTTCGACGTCAGCATGGCGGTTTCTACGCCGCGCGGCCTGGTGACGCCGGTTCTGCGTGATGTCGATACCCTCGGCATGGCAGACATCGAGAAGAAAATCAAAGAGCTGGCAGTCAAAGGCCGTGACGGCAAGCTGACCGTT‑GAAGATCTG‑ACCGGTGGTAACTTCACCATCACCAACGGTGGTGTGTTCGGTTCCCTGATGTC‑TACGCCGATCATCAACCCGCCGCAGAGCGCAATTCTGGGTATGCACGCTATCAAAGATCGTCCGATGGCGGTGAATGGTCAGGTTGAGATCCTGCCGATGATGTACCTGGCGCTGTCCTACGATCACCGTCTGATCGATGGTCGCGAATCCGTGGGCTTCCTGGTAACGATCAAAGAGTTGCTGGAAGATCCGACGCGTCT > NC_000913/762250‑762723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |