Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,159,837 | 0 | A | G | 31.0% | 110.5 / 14.3 | 58 | I572T (ATC→ACC) | fhuE | ferric‑rhodotorulic acid outer membrane transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/38); new base G (18/0); total (20/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.22e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CCACCGCCGACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACACCAGACCAGCGTAAGGCG > NC_000913/1159600‑1160074 | ccaccGCCGACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGAt < 2:1134944/239‑1 (MQ=255) ccaccGCCGACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGAt < 2:200054/239‑1 (MQ=255) ccaccGCCGACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTCCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGAt < 1:1389954/239‑1 (MQ=255) gccgACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGgt‑g < 1:546931/239‑1 (MQ=255) gccgACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGgt‑g < 2:351616/239‑1 (MQ=255) gccgACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGgt‑g < 2:662242/239‑1 (MQ=255) aaCTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGa < 1:824695/239‑1 (MQ=255) tGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAg < 2:535022/239‑1 (MQ=255) gACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCCCCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAg < 1:375071/233‑1 (MQ=255) cAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATc < 1:489624/237‑1 (MQ=255) cGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGGTTTGCCCTTGTTGCCGGGGGTAGGG‑GTAACGGGGGGCTGAGG‑GACATTATTCCGCt > 2:375071/1‑238 (MQ=255) tAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCt < 1:266063/235‑1 (MQ=255) tAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCt < 2:437600/235‑1 (MQ=255) gCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTTCTGCCGGGGGTAGGT‑GTACCGGGGGACTGGGC‑GACATTATTCTGCT‑CAATAc > 2:266063/1‑239 (MQ=255) gTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCTCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCt > 1:1378161/1‑229 (MQ=255) gTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCt < 2:1378161/229‑1 (MQ=255) tttAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTa < 1:753083/239‑1 (MQ=255) tttAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACAGAAGATGGCTa < 1:1363198/239‑1 (MQ=255) ccGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGAc < 1:879971/197‑1 (MQ=255) ccGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGAc < 1:1293475/197‑1 (MQ=255) gtgCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCGTTGCTGCCGGGGGTAGGG‑GTACCGGGGGGCTTGGCGGACATT‑TTCTGCTCCAATA‑GGGAGATGGCCaaagggggggg > 2:1363198/1‑230 (MQ=255) tgCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGgt‑g < 1:287496/180‑1 (MQ=255) tGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCCTTGCTGCCGGGGGTAGGG‑GGACCGGGGGGCTGAGC‑gccct > 2:1293475/1‑193 (MQ=255) tGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTCCCGCTGCTGCCGGGGGTAGGT‑GTACCGGGGGACTGAGC‑GACac > 2:879971/1‑196 (MQ=255) aTTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGCTTCTGCCGGGGGGAGGG‑GTACCGGTGGa > 2:287496/1‑180 (MQ=255) ttAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATcc < 1:214473/238‑1 (MQ=255) aaCGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGGTAGGG‑GTACCGGTGGGCTGAGC‑GACATTATCCTGCC‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGGGGGCCGACgggcatttat > 1:1110411/1‑226 (MQ=255) aCGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTc < 2:849374/239‑1 (MQ=255) tttCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCGTTGCTGCCGGGGGTAAGG‑GGTCCGGTGGCCTGAGC‑GACGTTATCCTGCT‑CAATACGGAGAATGGCGGAAGGGGGGGTCAGACGGCGATTCATCCAGACCGAttt > 2:145576/1‑239 (MQ=255) tttCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCCCTTCTGCCGGGGGGAGGG‑GTACCGGGGGGCTGAGC‑GGCATTATTCTTCT‑CCAAACGGGAGAGGGGTAAAGGGGGGGTCAGGAGGGTATTCGTCCACGCCGAttt > 2:965603/1‑239 (MQ=255) ttCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGAc < 1:17502/239‑1 (MQ=255) tCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCCCTTCTGCCGGGGGTAGGTGGGACGGGGGGAC‑GGGG‑GGCATTATCCTCGC‑CCATAAGGAAGAAGGGTAACGGGGGGGGGTGGCGGCTTCTTATCCCGTCCGAatttcgaa > 2:1171302/1‑233 (MQ=255) tCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGAcc < 1:145576/239‑1 (MQ=255) tCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAACTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTc < 1:921605/227‑1 (MQ=255) tataGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGAt < 1:687793/127‑1 (MQ=255) cgTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAg < 2:117836/140‑1 (MQ=255) cgTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAg > 1:117836/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCCTTTCTGCCGGGGGTAGGG‑GTACCg > 2:687793/1‑127 (MQ=255) tGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCCTTGCTGCCGGGGGTAGGT‑GTACCGGTGGGCTGAGC‑GACCATTTCCTTCT‑CCATACGGAAGATGGGTAACGTGGGGGTCAGACGGGTATTTATCCCGTCCGATTTTAGAACCCGCCCGGAGTTGTTTCCgggggttt > 2:487662/1‑233 (MQ=255) cgcCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTTCCGTTTCTGCCGGGGGTAggg > 2:274863/1‑118 (MQ=255) gaaaTGCCACCTGCCAGTGGTCGGTAATTGCCCCGTTGAGTCCAAATGCCCCCCCTTGACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTTCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGGCTGAGA‑GGCATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGcc < 2:960777/238‑1 (MQ=255) cAAATGTCAGCTGCCAGTTCTCGTTACTGTCGCCGTTGAGTTCAAATTCCTCCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGACAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGGCCGATTGCAGACCCAGCTCGTAGTTATTACCGGTGATTGGGGcc < 2:1079007/239‑1 (MQ=255) ttCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGgt‑g < 1:1061960/77‑1 (MQ=255) tCCACCCCTTTACTGGCTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCt < 1:664329/100‑1 (MQ=255) tttACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGata < 1:514074/189‑1 (MQ=255) ttACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACgtg < 1:914203/114‑1 (MQ=255) tACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGGTAGGT‑GTACCGGGGGGCTGGGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACggga > 2:664329/1‑98 (MQ=255) tACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACg < 1:856538/124‑1 (MQ=255) tgTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCCTTGCTGCCGGGGGTAGGG‑GTACCCGGGGGCTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGGGGGGGGCAGACGGCTATTTATCCAGTCCGATTTTCGAACCCACGCGCAGTTGTTACCCGTGGTTGGGGCCAGGAATTTGCCTGAAATTTCACGATCATTTTTGCGCTGGAAAAAAATGGTATTGCTGGCggtgg > 2:1132592/1‑235 (MQ=255) gTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCGTTTCTGCCGGGGGTAGGG‑GTACCGGGGGACTGAGC‑GACATTATCCTTCT‑CCATACGGAAGATGGGTAACGGGGGGGGCAGACGGCTTTTCATCCAGTCCGATTTTAGACCCAGCTCGGAGTTGTTTCCGCGGATTGGGGCCAGATATTTTCCTGaa > 2:514074/1‑189 (MQ=255) tCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGGTAGGG‑GGACCGGGGGACTGGGG‑GGCATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGGTAACGGGGGGGGGAGAc > 2:914203/1‑114 (MQ=255) cccATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTTGCCGTTGCTGCCGGGGGTAGGG‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAAAACGGGAGATGGCTAACGTGGGGGTCAGACGGCTATTCATc > 2:856538/1‑124 (MQ=255) ccATCCACCGCTTTATAGGCGGGTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTAGCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCGGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCg < 1:457652/238‑1 (MQ=255) tCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAg < 1:815796/61‑1 (MQ=255) tttATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCAt < 1:1132592/239‑1 (MQ=255) cGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTc < 1:421893/238‑1 (MQ=255) gTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACaccagac < 1:4045/239‑1 (MQ=255) gTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACaccagac < 1:630641/239‑1 (MQ=255) aTAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACACCAGACCAGCGTAAGGCg < 1:487662/238‑1 (MQ=255) | CCACCGCCGACCGTCAACTCTGGCATGACAGGCAACCGATAGCTGGTGAACATTTTAACCGTGGTGCGTGGCAGATTAGGATTAACGGCGTTTCCTTCGTTATCCTCTGCAATATAGCGCGTTGCGCCAAATGTCAGCTGCCAGTTGTCGGTAATTGCGCCGTTGAGTTCAAATTCCACCCCTTTACTGACTGTCCCATCCACCGCTTTATAGGCGGTTTCGCCGTTGCTGCCGGGGATAGGT‑GTACCGGTGGACTGAGC‑GACATTATCCTGCT‑CAATACGGAAGATGGCTAACGTGGTGGTCAGACGGCTATTCATCCAGTCCGATTTCAGACCCAGCTCGTAGTTGTTACCGGTGATTGGAGCCAGATATTTGCCTGAACTGTCACGATCATTTTGCGGCTGGAAAATAGAGGTATAGCTGGCGTAGGTCGACCAGTTGTCATTGATGTCAAACACCAGACCAGCGTAAGGCG > NC_000913/1159600‑1160074 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |