| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,239,823 | 0 | T | G | 32.7% | 116.8 / 10.8 | 56 | G315G (GGT→GGG) | dadX | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/34); new base G (18/0); total (22/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.23e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGTGAGATTATTGGTGTCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTG > NC_000913/1239587‑1240060 | aGTGAGATTATTGGTGTCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGt < 2:349116/237‑1 (MQ=255) gCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGAt < 1:1062377/238‑1 (MQ=255) gAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCa < 1:705633/238‑1 (MQ=255) cGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTAc < 1:499439/188‑1 (MQ=255) gCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCTCCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCt < 1:415480/239‑1 (MQ=255) gcgcgcGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGGTT‑GGGAAGCCGGGTGGGCCTT‑GGGGGAAGGGGATCAAAATTGATGGTGTcgccccccgcgcccgcac > 1:1124867/1‑228 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCCGGCGGGGATT‑GGGACGCCgggttgg > 2:499439/1‑183 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGTACGCCGGTTGGGCTGT‑GGGGCAAGGGGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCTGGCCGGacg > 1:774121/1‑237 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGGACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGCGAGGAGGTCAAAATTGATGTTGTCGCCGCCGCT‑GCCGGGACg > 2:351870/1‑239 (MQ=255) gcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGTACGCCGGTTGTGCTGT‑GGGGCGAGGAGATCACAAATGATGATGTCGCCGCCCCC‑GCCCGAACgg > 2:1152878/1‑239 (MQ=255) gcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGt < 1:1263644/238‑1 (MQ=255) 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cACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGGGGGGGCCGTCTCGATGGACATGCTAGCGGTCGCTTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGGTTGGGTTGTCGGGTCGGGCTAT‑GGGG‑AAGGGGTGGAAAATTGGTGGTTGCGGCCCGGCG‑GCCGGGACGGTGGGCTGTGGGGTGGGGTGGGCGCTgggggtgc > 2:367959/1‑208 (MQ=255) cgcgCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGGTT‑GGTCAGCCGGGTGAg > 2:468205/1‑127 (MQ=255) tACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAAc < 1:1055860/224‑1 (MQ=255) cccTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCg < 1:443990/239‑1 (MQ=255) ttttAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGtt < 1:691932/104‑1 (MQ=255) tGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTAc < 1:1204980/91‑1 (MQ=255) tGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGTAc > 2:1204980/1‑91 (MQ=255) tGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGc < 1:4884/212‑1 (MQ=255) gcACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCaa < 1:1080375/239‑1 (MQ=255) 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tctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGCGATT‑GGGACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCC‑GCCCGGACGGGGGGGCATGTGTTTATGTGGGCGGCGGGGCTACGCGTCCCGGTTGTGGCGGGGTTACTTTTTTGAAGGCGGGTAGGGGGGCACGGCTTTTTGGGGGAAAAAAAACATCCATCCGGCTgg > 2:800465/1‑239 (MQ=255) ctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTAACCCGGTTGAGCTGG‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCCCT‑GCCGGAACGGGGGGGTATGAGTTGGTGTGCGCCCTGGCGCCACGCGTCCCGGTTGTGACGGGGTAACGTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCCACCGCTTCTGGGGGCGAAAAAAATATACATCCCGCTgg > 2:515191/1‑238 (MQ=255) ctcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGTACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTTGCCGCCCCT‑GCCGGGACGGGGGGGTATGGGGTGATGTGGGGCCCGGGGCCACGCGGCCCGGGTGGGGCGGGGGTACTTGTTGTAAGGCGGAGCGGGGGCAACGGCTTTTTGGGGGCAAAAAATCATCCATCCGGCgggg > 2:1363860/1‑238 (MQ=255) atcGATGGATTGGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTGGCCCGCAGGTGGGTATT‑GGTACGGAGGTTGAGGTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACgg < 1:596700/118‑1 (MQ=255) tcGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTc < 1:351870/239‑1 (MQ=255) tGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGc < 1:168444/238‑1 (MQ=255) tatGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGTACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAAATGATGATGTCGCCGCCGCC‑GCCGGGACGGGGGGCTATGa > 2:627099/1‑120 (MQ=255) tatGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGGACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGGAAGGAGATCAAAATtgat > 2:449018/1‑85 (MQ=255) atGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGGTT‑GGGAAGCCGGGTGAACAGC‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTTATGATTGCGCCGCCGCT‑GGCGGGACGGTGGGccgtaa > 2:596700/1‑114 (MQ=255) tggCGGTCGATTTAACGCCTTGCCAGCAGGGGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGGGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAgtt < 2:1284870/237‑1 (MQ=255) gggTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAgttgt < 1:1187706/237‑1 (MQ=255) cGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGGACCCCGGGTGGGCTTT‑GGGGCCAGGGGATCAAAAATGATGATGTCCCCGCCCCT‑GCCGGGACGGGGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCCCCACGCGTCCCCGTTGTGGCGGGGTCACTTGTTGTAAGCCCGGTCGGGGGGAACGTCTTCTCGGGGCAAAAAAAACATCCCTCCGGCCGGCCACCCACCGCAgttgct > 2:472101/1‑237 (MQ=255) cGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAAt < 1:1385626/238‑1 (MQ=255) tttAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGAtgtg < 1:385913/114‑1 (MQ=255) gCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGc < 1:886523/239‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCAGGCGGGTTTT‑GGTACGCGGGTTGAGCTGT‑GGGGAAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 2:1124867/239‑1 (MQ=255) tGCCGGGAGGCGGGTATT‑GGTAGGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAGGGAGATCAAAATTGATGGTGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:686305/239‑1 (MQ=255) tGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTATCCCGGTTTGGGTGT‑GGGGCAAGGAGGTCAAAATTGATGGTGTCCCCCCCGCT‑GCCGGGACGGGGGGCTATGAGTTGAAGTGCGCGCTCGCGCCCCGCGTCCCGGTTGTGTCGGGGGAACTTGTTGTAAGCCGGCTCGGAGGGAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCTGCCGGTCCGTCAATGTTGCTGTTTATGCTACagaaacat > 2:415851/1‑233 (MQ=255) tGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGTACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGGAAGGAGATCAAAATTTGTGCTGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCGATGAGTTGATGGGGGCGCCGgcg > 2:385913/1‑114 (MQ=255) tGCCCGCAGGCGGGGATT‑GGGACGCCGGTTGAGCTGT‑TGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTTGCCCCCCTC‑GGCGGAACGGGGGGGTATGAGTTGATGTGCGCGCCGGCGCCACGCGGCCCGGGTGGGACGGGGGAAATTGTTGGAAAGCGGTTTGGAGGCCACGGCTTTTGGGGGCAAAAAAATCAATCATCCCGCTGGTCAGAAACTGTAAGTGTTAATGGTACAGAGCCCtt > 2:991139/1‑239 (MQ=255) gCCCGCAGGCGGGTGTT‑GGTACGCCGGTTGGGCTGT‑GGGGAAAGGAGATAAAAATTGAGGATGTGTCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTCGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCAGCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 2:548141/238‑1 (MQ=255) cccGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:794812/237‑1 (MQ=255) cGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCGTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAAAGCCATTGccc < 1:1363860/239‑1 (MQ=255) gCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTGCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGGGCCATTGCCCa < 1:1341689/239‑1 (MQ=255) ggTATT‑GGTACGCCGGGTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGGACGGGGGGCTATGAGTTGATGTGGGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGGTGTGACGGGGTAAATTGTTGTAAGCCGGGTCGGGGGCAACGTCCTCTGGGGGGCAAAAAATCATCCATCCGGCTGGGCAGCAAACGGAGGTGGTAAATGGACAAAGCCATTGccccttaaagc > 2:794812/1‑231 (MQ=255) tATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAGGGAGATCAAATTTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAgtg < 2:409161/238‑1 (MQ=255) | AGTGAGATTATTGGTGTCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGTCGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATT‑GGTACGCCGGTTGAGCTGT‑GGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGTCGCCGCCGCT‑GCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGTAACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCAACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCCCATGATAGTG > NC_000913/1239587‑1240060 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |