Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 4,172,437 | 0 | A | C | 67.3% | 110.0 / 132.6 | 113 | V127V (GTA→GTC) | murB | UDP‑N‑acetylenolpyruvoylglucosamine reductase, FAD‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (21/16); new base C (40/36); total (61/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CTTTTTCTGGAGGACTATCGCGGCACGGTGATCATCAACCGGATCAAAGGTATCGAAATTCATGATGAACCTGATGCGTGGTATTTACATGTAGGAGCCGGAGAAAACTGGCATCGTCTGGTAAAATACACTTTGCAGGAAGGTATGCCTGGTCTGGAAAATCTGGCATTAATTCCTGGTTGTGTCGGCTCATCACCTATCCAGAATATTGGTGCTTATGGCGTAGAATTACAGCGAGTTTGCGCTTATGTTGATTCTGTTGAACTGGCGACAGGCAAGCAAGTGCGCTTAACTGCCAAAGAGTGCCGTTTTGGCTATCGCGACAGTATTTTTAAACATGAATACCAGGACCGCTTCGCTATTGTAGCCGTAGGTCTGCGTCTGCCAAAAGAGTGGCAACCTGTACTAACGTATGGTGACTTAACTCGTCTGGATCCTACAACAGTAACGCCACAGCAA > NC_000913/4172213‑4172671 | cTTTTTCTGGAGGACTATCGCGGCACGGTGATCATCAACCGGATCAAAGGTATCGAAATTCATGATGAACCTGATGCGTGGTATTTACATGTAGGAGCCGGAGAAAACTGGCATCGTCTGGTAAAATACACTTTGCAGGAAGGTATGCCTGGTCTGGAAAATCTGGCATTAATTCCTGGTTGTGTCGGCTCATCACCTATCCAGAATATTGGTGCTTATGGCGTCGAATTACAGCGAGt > 2:381025/1‑239 (MQ=255) tttCTGGAGGACTATCGCGGCACGGTGATCATCAACCGGATCAAAGGTATCGAAATTCATGATGAACCTGATGCGTGGTATTTACATGTAGGAGCCGGAGAAAACTGGCATCGTCTGGTAAAATACACTTTGCAGGAAGGTATGCCTGGTCTGGAAAATCTGGCATTAATTCCTGGTTGTGTCGGCTCATCACCTATCCAGAATATTGGTGCTTATGGCGTCGAATTACAGCGAGttt > 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |