| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,499,258 | A→C | intergenic (+57/‑190) | cysG → / → yhfL | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase/small lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,499,258 | 0 | A | C | 100.0% | 432.5 / NA | 109 | intergenic (+57/‑190) | cysG/yhfL | fused siroheme synthase 1,3‑dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase/small lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (45/64); total (45/64) | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TGCCAGGCGAAATGCCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGC > NC_000913/3499023‑3499482 | tGCCAGGCGAAATACCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTTATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAAt < 1:128480/239‑1 (MQ=255) aGGCGAAATGCCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTCTATATTCAGCCAATaaa > 1:265102/1‑238 (MQ=255) ggCGAAATGCCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAAc > 2:620292/1‑239 (MQ=255) aaTGCCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAg < 1:1047153/238‑1 (MQ=255) aTGCCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGcc < 1:507726/239‑1 (MQ=255) ggTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTta > 2:949287/1‑239 (MQ=255) ggCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTtaat < 2:1047912/238‑1 (MQ=255) cAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTtaataa < 1:353049/238‑1 (MQ=255) aTTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTaataaata < 2:366898/239‑1 (MQ=255) aTTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTaataaata < 1:949287/239‑1 (MQ=255) cGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAAtattat < 1:129369/238‑1 (MQ=255) aCGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 2:98791/239‑1 (MQ=255) aCGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 2:1016629/239‑1 (MQ=255) aCGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 1:620292/239‑1 (MQ=255) cGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTaa > 2:719026/1‑239 (MQ=255) cACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATAtt < 1:704114/238‑1 (MQ=255) cACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATAtt < 1:1184243/238‑1 (MQ=255) cACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATAtt < 2:735821/238‑1 (MQ=255) cgTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACa > 2:563089/1‑239 (MQ=255) cgTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACa > 2:777786/1‑239 (MQ=255) gTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAg < 1:418136/239‑1 (MQ=255) cTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTtaataa > 2:585210/1‑179 (MQ=255) cTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTtaataa < 1:585210/179‑1 (MQ=255) gagaACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCtt < 1:699059/170‑1 (MQ=255) gagaACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCtt > 2:699059/1‑170 (MQ=255) aCTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATa < 2:47938/152‑1 (MQ=255) aCTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTc > 2:341416/1‑234 (MQ=255) tGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTc > 2:83015/1‑232 (MQ=255) tGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGAc > 1:1168823/1‑238 (MQ=255) tGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACg < 1:563089/239‑1 (MQ=255) cagcaAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAAt > 2:741906/1‑239 (MQ=255) aaaTGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTaaa < 1:209962/239‑1 (MQ=255) aaaTGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTaaa < 1:719026/239‑1 (MQ=255) aTGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAata < 1:83015/239‑1 (MQ=255) gTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATa > 2:393978/1‑132 (MQ=255) gTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATa < 1:393978/132‑1 (MQ=255) gTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTg < 1:926164/161‑1 (MQ=255) gTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTg > 2:926164/1‑161 (MQ=255) ccATCGGTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATGCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTAt < 2:1092880/239‑1 (MQ=255) cATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTtata < 1:367828/171‑1 (MQ=255) cATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTtata > 2:367828/1‑171 (MQ=255) attattattGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATa < 2:862675/121‑1 (MQ=255) attattattGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAata < 1:956649/221‑1 (MQ=255) attattattGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAata > 2:956649/1‑221 (MQ=255) ttattGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAg < 2:757943/239‑1 (MQ=255) ttattGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAg < 1:341416/239‑1 (MQ=255) attGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTtata > 2:565745/1‑157 (MQ=255) attGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTtata < 1:565745/157‑1 (MQ=255) ttGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATGCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATAATCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAg < 1:398855/239‑1 (MQ=255) tGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGt < 1:741906/239‑1 (MQ=255) tGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGt < 2:237556/239‑1 (MQ=255) gTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa > 1:861229/1‑143 (MQ=255) gTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 2:861229/143‑1 (MQ=255) gTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGa > 1:111334/1‑232 (MQ=255) cGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGc < 2:941617/239‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAAt > 1:1027476/1‑141 (MQ=255) ggTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAAt < 2:1027476/141‑1 (MQ=255) gttgttGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTa < 2:1101994/168‑1 (MQ=255) gttgttGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTa > 1:1101994/1‑168 (MQ=255) tgttgGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTtata < 2:1168823/239‑1 (MQ=255) tgGCCTGCGCGATAATCTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTc < 1:483007/239‑1 (MQ=255) ggCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGc > 2:256254/1‑230 (MQ=255) ggCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGc < 1:256254/230‑1 (MQ=255) tGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTc < 1:995849/223‑1 (MQ=255) cgATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa > 1:428990/1‑124 (MQ=255) cgATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 2:428990/124‑1 (MQ=255) aactgGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 1:514088/114‑1 (MQ=255) aactgGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa > 2:514088/1‑114 (MQ=255) tgTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 2:1145504/238‑1 (MQ=255) gTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATAttaattaa > 1:904158/1‑239 (MQ=255) aaCCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATataa < 1:777786/239‑1 (MQ=255) cATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCtt < 1:398265/199‑1 (MQ=255) cATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCtt > 2:398265/1‑199 (MQ=255) tAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTaaa < 2:912203/162‑1 (MQ=255) tAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTaaa > 1:912203/1‑162 (MQ=255) aTTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAgg < 2:904158/239‑1 (MQ=255) aTTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAgg < 2:629672/239‑1 (MQ=255) aCCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAg > 2:438702/1‑179 (MQ=255) aCCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAg < 1:438702/179‑1 (MQ=255) aCCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCa > 2:572648/1‑196 (MQ=255) aCCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCa < 1:572648/196‑1 (MQ=255) aCCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta > 2:636571/1‑218 (MQ=255) aCCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATattaatta < 1:636571/218‑1 (MQ=255) ggCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTtaa > 1:594738/1‑68 (MQ=255) ggCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCg > 1:1142779/1‑109 (MQ=255) ggCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCg < 2:1142779/109‑1 (MQ=255) gCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATg > 2:497458/1‑239 (MQ=255) agagAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 2:259480/80‑1 (MQ=255) cttAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa < 1:680798/64‑1 (MQ=255) cttAATGACTCTTTTTATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTa > 2:680798/1‑64 (MQ=255) tttttATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTtaa < 2:846232/37‑1 (MQ=255) tttATATATTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGc > 1:1085227/1‑239 (MQ=255) tatTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAAt < 1:405852/47‑1 (MQ=255) tatTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTaaa > 2:773957/1‑111 (MQ=255) tatTCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTaaa < 1:773957/111‑1 (MQ=255) ttCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAAtattat > 1:846232/1‑37 (MQ=255) ttCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGt < 1:527835/137‑1 (MQ=255) ttCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGt < 1:515448/137‑1 (MQ=255) ttCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGt > 2:527835/1‑137 (MQ=255) ttCAGCCAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGt > 2:515448/1‑137 (MQ=255) | TGCCAGGCGAAATGCCGGTGGCAATTGTCGAAAACGGTACGGCAGTCACGCAGCGCGTGATTGACGGTACGCTCACACAGCTGGGAGAACTGGCGCAGCAAATGAACAGTCCATCGCTAATTATTATTGGTCGGGTTGTTGGCCTGCGCGATAAACTGAACTGGTTCTCCAACCATTAATTTAACCCGGGCCAGAGAATTCTGGCCTTCTTAATGACTCTTTTTATATATTCAGCAAATAAAACATAGCCCCTTAATAAATATTATCTGCTAATGGGTTATATTCACCGTTACAGCGACTTACAAAATTAAGTCATTCGCTCACTGACGCCAATTAAATATTCCTGTATCGTTCTTAACGAGCAGTCTGCTTATATTCATATAATCAATGAATATTAATTAATATATAATACATAGGGAATGTAAATGAACAAATTTATTAAAGTTGCACTGGTAGGTGC > NC_000913/3499023‑3499482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |