| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,168,327 | A→C | intergenic (‑21/‑385) | yegR ← / → yegS | uncharacterized protein/phosphatidylglycerol kinase, metal‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,168,327 | 0 | A | C | 100.0% | 393.4 / NA | 101 | intergenic (‑21/‑385) | yegR/yegS | uncharacterized protein/phosphatidylglycerol kinase, metal‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (45/56); total (45/56) | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AGTTGCATCATTTTTTACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCT > NC_000913/2168094‑2168526 | aGTTGCATCATTTTTTACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAAc > 2:254399/1‑239 (MQ=255) gCATCATTTTTTACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca < 2:937616/239‑1 (MQ=255) gCATCATTTTTTACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca < 2:35916/239‑1 (MQ=255) tttttACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTa < 1:436895/239‑1 (MQ=255) tttttACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACCTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTa < 1:803583/239‑1 (MQ=255) ttttACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAg < 1:254399/239‑1 (MQ=255) tatTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTaaa > 2:1139306/1‑239 (MQ=255) tGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTTGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATataata > 1:589427/1‑239 (MQ=255) gCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca < 2:534625/215‑1 (MQ=255) gCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca > 1:534625/1‑215 (MQ=255) aGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTaaa > 2:243432/1‑226 (MQ=255) aGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTaaa < 1:243432/226‑1 (MQ=255) tatTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc < 1:1139306/235‑1 (MQ=255) tatTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc < 1:622514/235‑1 (MQ=255) atTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATACTGGCATGat < 2:698091/239‑1 (MQ=255) atTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGat < 1:290172/239‑1 (MQ=255) tAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa < 1:232047/238‑1 (MQ=255) tAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa < 1:147283/238‑1 (MQ=255) tAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAAt < 2:290655/239‑1 (MQ=255) cggTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGt > 1:236191/1‑239 (MQ=255) gtaTTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTac > 1:1155269/1‑239 (MQ=255) gTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACAct < 1:501381/164‑1 (MQ=255) gTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACAct > 2:501381/1‑164 (MQ=255) gTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACAtt > 1:575758/1‑239 (MQ=255) tATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACAttt > 2:576955/1‑238 (MQ=255) aTCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTcc < 2:589427/239‑1 (MQ=255) aCGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGt < 1:1140966/239‑1 (MQ=255) gCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAg < 2:575758/239‑1 (MQ=255) atTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTAc < 1:1147160/239‑1 (MQ=255) tACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACgg > 1:782854/1‑239 (MQ=255) ttATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGac > 1:1111342/1‑133 (MQ=255) ttATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGac < 2:1111342/133‑1 (MQ=255) atatGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa < 1:1073539/178‑1 (MQ=255) atatGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa > 2:1073539/1‑178 (MQ=255) atGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAgg < 2:1155269/239‑1 (MQ=255) atGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACAAAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAgg < 1:448868/239‑1 (MQ=255) aGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCtt < 2:782854/239‑1 (MQ=255) aaTTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa < 1:322907/165‑1 (MQ=255) aaTTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa > 2:322907/1‑165 (MQ=255) aCCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg < 2:1041677/111‑1 (MQ=255) aCCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg > 1:1041677/1‑111 (MQ=255) tACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATgg > 1:326777/1‑239 (MQ=255) ttGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATggggg < 2:236191/239‑1 (MQ=255) gTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc > 2:25257/1‑132 (MQ=255) gTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc < 1:25257/132‑1 (MQ=255) ctcATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCtt < 2:1031436/238‑1 (MQ=255) tcatcaTTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTa < 1:576955/239‑1 (MQ=255) atcatTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa < 2:1154918/145‑1 (MQ=255) atcatTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa > 1:1154918/1‑145 (MQ=255) tATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca > 2:52121/1‑94 (MQ=255) tATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAAGGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca < 1:52121/94‑1 (MQ=255) aTGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca < 1:919900/93‑1 (MQ=255) aTGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca > 2:919900/1‑93 (MQ=255) tGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg > 2:225800/1‑89 (MQ=255) tGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg < 1:225800/89‑1 (MQ=255) acagcacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAatata < 1:1062389/232‑1 (MQ=255) acagcacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAatata > 2:1062389/1‑232 (MQ=255) cagcacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTg > 1:1192897/1‑239 (MQ=255) agcacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTaa < 1:635886/102‑1 (MQ=255) agcacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTaa > 2:635886/1‑102 (MQ=255) ctcaACGAGACATAATAAAAACCCTAATTAATGATATACCAGATATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCCTTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATACTGGCATGGTTCTTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGATCTGTACAACATTTCCTACATACGTAGGAATTACGGACACTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTATTATATGATATTGAAg > 2:355845/3‑239 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACActctct < 2:619809/91‑1 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACActctct > 1:619809/1‑91 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACAct < 1:498406/87‑1 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACAct > 2:498406/1‑87 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc > 1:861802/1‑113 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc < 2:861802/113‑1 (MQ=255) cacaACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAg > 2:1008648/1‑239 (MQ=255) aaCCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg < 2:597240/79‑1 (MQ=255) aaCCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg > 1:597240/1‑79 (MQ=255) ccAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATccc < 1:204619/73‑1 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg > 1:105090/1‑74 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACg < 2:105090/74‑1 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca > 1:447416/1‑77 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGaca < 2:447416/77‑1 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATaa < 1:396735/164‑1 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATaa > 2:396735/1‑164 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTa > 1:343058/1‑215 (MQ=255) gACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTa < 2:343058/215‑1 (MQ=255) aCATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGcc > 2:912484/1‑235 (MQ=255) cATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGt < 2:867457/164‑1 (MQ=255) taaAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACAct > 1:394266/1‑72 (MQ=255) taaAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACAct < 2:394266/72‑1 (MQ=255) taaAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGt < 1:1008648/239‑1 (MQ=255) aaaaaTACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt < 1:912484/239‑1 (MQ=255) cTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAggg < 2:225665/181‑1 (MQ=255) cTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAggg > 1:225665/1‑181 (MQ=255) tGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATggg < 1:754286/185‑1 (MQ=255) tGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATggg > 2:754286/1‑185 (MQ=255) taGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa < 2:32438/95‑1 (MQ=255) taGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGaa > 1:32438/1‑95 (MQ=255) cagcTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTa > 1:979271/1‑184 (MQ=255) aTCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATtat < 2:381429/96‑1 (MQ=255) aTCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATtat > 1:381429/1‑96 (MQ=255) tttttCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc > 2:132987/1‑66 (MQ=255) tttttCATCTCACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGc < 1:132987/66‑1 (MQ=255) tcACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt < 2:1029002/199‑1 (MQ=255) tcACCTTCCCCCATTAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt > 1:1029002/1‑199 (MQ=255) tAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGctct < 2:464215/205‑1 (MQ=255) tAAATCCCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGctct > 1:464215/1‑205 (MQ=255) | AGTTGCATCATTTTTTACTATATTTTCTGCACCAGATATTCTACCCCTGGCTAAAGAAGCTTCGGCTTCGGTGTAGTATTGGTTATCGAGTTTACGCTGAATATTACTTTTATATGCAAGACCAAATTTACCGATACTTGTCTCATCATTATGCACAGCACAACCAGACATAATAAAAATACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCT > NC_000913/2168094‑2168526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |