Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,278,251 | A→C | intergenic (‑14/+319) | yejG ← / ← bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,278,251 | 0 | A | C | 98.2% | 399.4 / ‑0.9 | 110 | intergenic (‑14/+319) | yejG/bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (49/59); total (50/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.31e-01 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AACATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTATACATCACCGACCATGCATTATCACCATCCGGGCTAAGCAATTTAAGCGCCACCAGGCTGTTGTCACCGCACGGTCCATTTTGCGGAATCGGTTCAACCTTCGAACCTGCGAAACCAGCAGACCAGCGATAGTTCTGCGGCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACGTTTGCGGGGCTATATGTACCCGTTTCTGCGATCTAACTCAACCTTTTTAACTACAATGATGTGACTTTT > NC_000913/2278021‑2278461 | aaCATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTATACATCACCGACCATGCATTATCACCATCCGGGCTAAGCAATTTAAGCGCCACCAGGCTGTTGTCACCGCACGGTCCATTTTGCGGAATCGGTTCAACCTTCGAACCTGCGAAACCAGCAGACCAGCGATAGTTCTGCGGCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGCAGCACAt > 1:237719/1‑238 (MQ=255) aaCATGGAACTTCGATGTCGCTTAACGCCTGGCTTAGTTTATACATCACCGACCATGCATTATCACCATCCGGGCTAAGCAATTTAAGCGCCACCAGGCTGTTGTCACCGCACGGTCCATTTTGCGGAATCGGTTCAACCTTCGAACCTGCGAAACCAGCAGACCAGCGATAGTTCTGCGGCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGCAGCACAt > 2:467597/1‑238 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |