| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,656,000 | T→G | E120A (GAA→GCA) | pepB ← | aminopeptidase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,656,000 | 0 | T | G | 99.1% | 426.3 / ‑3.9 | 114 | E120A (GAA→GCA) | pepB | aminopeptidase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (57/55); total (58/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGACCGTCAATCTTGCGCGCCGCACGCTGGATCAGC > NC_000913/2655770‑2656233 | tACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGc < 2:35020/238‑1 (MQ=255) ccTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCgg < 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aCGCGTACCCTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCa < 2:1063114/239‑1 (MQ=255) gcgTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACg < 1:176675/239‑1 (MQ=255) cgTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGc > 1:698865/1‑239 (MQ=255) 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cGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACAt > 1:270604/1‑237 (MQ=255) atcaACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCTGCCgg < 1:558812/48‑1 (MQ=255) atcaACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGa > 2:534901/1‑238 (MQ=255) atcaACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGa > 1:204145/1‑238 (MQ=255) tcaACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAg < 1:799105/236‑1 (MQ=255) caACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCAcacca < 2:326845/135‑1 (MQ=255) caACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCAcacca > 1:326845/1‑135 (MQ=255) gCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAgg < 2:901742/81‑1 (MQ=255) gCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAgg > 1:901742/1‑81 (MQ=255) 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gCGATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGTGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGACCGTCAATCTTGCGCGCCGCACGc < 1:967174/239‑1 (MQ=255) gATGGTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGACCGTCAATCTTGCGCGCCGCAc > 1:256327/1‑235 (MQ=255) ggTCCCAATGCTTCTGCCGGTGCTTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGACCGTCAATCTTGCGCGCCGCACGCTGGAt < 2:627357/239‑1 (MQ=255) 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tCCCAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCcag > 2:777367/1‑154 (MQ=255) ccAATGCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGACCGTCAATCTTGCGCGCCGCACGCTGGATCAGc < 1:419887/239‑1 (MQ=255) | TACCTTTACCTACCAGGCACGCGTACACTGGCGCTTCTTTATCGCCAGTTGGGTTGTAATCCAGCGCCAGCAATACCGGAGAACGTTCTGAACCGCGTCCGACTGTGTGCAGCCCCATATAACCTTGCTCACGCAGATCTTCGCCTTTGGTGATCCGATAAGTCACACGATCGCCCGCGACGTTGCTGATCAGATCAACAGCACGCTGTGCCAGTTGCGATGGTCCCAATTCTTCTGCCGGTGCGTTGATGGTGTCACGCACCCAGTCGATGATCATCAGGCGGTTATCCAGTTCCTGGCGCTGGGCATCGTCCAGATCCGGCCACACCACTTTACGCGTGCCTTTCGGGGCTTTGTAACCTTGCCAGAATGCCCAGCAGCGATCCGCATCCCAGCCTTCACCGCTTAACTGAACATGCTTGATGCCCAGACCGTCAATCTTGCGCGCCGCACGCTGGATCAGC > NC_000913/2655770‑2656233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |