| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,239,823 | 0 | T | G | 34.7% | 82.5 / 12.0 | 50 | G315G (GGT→GGG) | dadX | alanine racemase, catabolic, PLP‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/27); new base G (17/0); total (23/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.05e-09 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GAGATTATTGGTGTCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCC > NC_000913/1239590‑1240050 | gagaTTATTGGTGTCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAAAGCCTTGCCCGCAGGCGGGGAt > 1:98132/1‑236 (MQ=255) tgtCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTTGTGGAGGGGGGGGGGACCATGCCGGTGGGGTCCCTCCCCGTTGGTATGCTCGCGGTGCGTTTTAGAGCCTTGCCCCCA‑GCGGGGACTGGtgacacgc > 2:370230/1‑229 (MQ=255) tAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACGGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGTGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCt < 1:736509/232‑1 (MQ=255) ggCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATGCTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTGTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGAt < 1:29988/234‑1 (MQ=255) gCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATCCTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATc < 1:598679/235‑1 (MQ=255) aCTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGCATTGGTACGCCGGGTGAGCGTTGGGGCAAGGGGATCAAAATTGATGATG‑TTGCCGCCGCTGc > 1:459410/1‑236 (MQ=255) gcgcgcGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTAAGCCGGGTGAGGCGTGGGGCAAGGGGATCAAAATTGATGATG‑TGGCCGCCGCCGCCgg > 1:526269/1‑236 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGGAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGa < 1:370230/236‑1 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGTTTTGTACGCCGGTTGGGCTTTGGGGCAAGGCGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCTGa > 1:496388/1‑236 (MQ=255) cgcgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGGTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATGATCG‑CGCCGCCGCCGGa > 1:676178/1‑236 (MQ=255) cgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCCAGGAGAGCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAAc > 1:747737/1‑236 (MQ=255) cgcgATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTAAGCCGGTTGAGCTGTGTGGGAAGGAGATCCAAATTGATGATG‑TCGGCGCCGCTGCCGGAAc > 1:34635/1‑236 (MQ=255) aTGAACAGCGAATCGGCATTGTCGGCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCTCCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGt < 1:737758/235‑1 (MQ=255) aCGCCGACGTTTACCGGCGCCACGGGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTAcg < 2:343066/235‑1 (MQ=255) gCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGAAGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAAATGATGATG‑TCGCCGGCGCTGCCGGGACGGGGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGt > 1:493728/1‑236 (MQ=255) cGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTTGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCCAAATTTATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGGACGGTGGGGTCTGAGTTGAAGTGCGCGCTGGGGCTACGCGTCCCg > 1:343066/1‑235 (MQ=255) tATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTAt < 1:597363/198‑1 (MQ=255) ccGCGCCACGCGCTTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCTCCATGACGGTGGGGACCTTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGa < 1:1464/235‑1 (MQ=255) cgcCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTTCGCACCATGACGGTGGGGCCCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGgt < 1:604372/236‑1 (MQ=255) gcCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCTCCGCTGCCGCTGGGATGGTGGGCTATGAGTTGGTGTTCGCGCTGGCGCCACGCGTGCCgcctgt > 2:446163/1‑224 (MQ=255) gcgcTTACCGATCCCCTGGTTTGAGGCGCCGGCGGGCACACCATGGCGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAGCGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACt < 2:345801/236‑1 (MQ=255) gcgcCTACCGGTGCCCCTGTTTTAGTGGACGGCTTGCGGACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAANNGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACt < 1:741936/236‑1 (MQ=255) tACCCCTGTTTGAGTGGACGGCGTGCGCACGATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGcc < 1:604850/236‑1 (MQ=255) cATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTGAGCTGTGGGGGAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGGAAGGGGGGGTATGAGGTGATTGGGGCGCTGGCGGCACGCGTCCCGGTTGTGACGGGGG‑AAATTGTTGTCAGCCGGATCGGAGGCAACGGCTTTCGGGTGGaaa > 2:188180/1‑236 (MQ=255) aTGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGa < 1:585502/184‑1 (MQ=255) cGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGGGCTGTGGGGCAAGGGGATCCAAATTGGTGATG‑TGGCCGCCGCTGGCGGGACGGGGGGGTTTGAGGTTGTGTGCGCGCTTGGGCCACGCGGCCCGGGTGGGACGGGGTGAACTTTGTG‑ATGCCGGACCGGGGGGAAACGCTTCTGGGGGGcaaaaaa > 2:308719/1‑235 (MQ=255) tGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGGACGGTGGGGTATGAGTTTATTTGCGCGCTGGCGCTCCGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑a > 2:585502/1‑184 (MQ=255) gggACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTgcgcgc > 1:545266/1‑151 (MQ=255) gggACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTgcgcgc < 2:545266/151‑1 (MQ=255) gggACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTGGGGGGCCAGGGGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGGGGGGTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGAGGGTGT‑AACTTGTTTTAAGCCCGATCTGAGGCGACGTCTTCTTGGGGCGAAAAAatcata > 2:522604/1‑234 (MQ=255) gTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTcc > 1:588009/1‑160 (MQ=255) gTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTcc < 2:588009/160‑1 (MQ=255) tctcGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGGTGAGCTGTGGGGCCAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGGACGGTGGGCGATGAGTTGATGTGCGCGCCGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGGCGGGGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGGTCGGAAGCCACGGCTTCTGGGTGCCAAAAAATCaaccatcctcc > 2:746826/1‑233 (MQ=255) tctcGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGGACGCCGGGTGAGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATTTATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAAAGGTGGGGCATTGGTTGATGTGGGCGCTGGCGGTACCCCGCCCCGTTGGGGCGGGGT‑TAATTGTTGTAAGGCGGATCGGGGGGTAAGGCGTCCGGGTGGGAAAAAATcattcaatccgc > 2:698638/1‑230 (MQ=255) ttcGATTGATGTGCTAGCTGG‑CGATTTCACTCCTTGCCAGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTGGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGc < 2:34635/234‑1 (MQ=255) cTAGCGTG‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGt < 2:493728/236‑1 (MQ=255) cGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTTGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGGGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCCTGCGCTACGCGGCCCGGTTGGGGCGGCGT‑GACTTGTTGTAAGTTGGATCGGAGGCAACGGCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCATTCCGGCTGGTCAGCA‑AATGTActt > 2:417434/1‑236 (MQ=255) cGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGGACGGGGGGGTATGGGGTGATGTGCGCGCTGGGGCTAACGGGCCCGGTGGTGACGGGGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGGACGGAGGCAACGGCTTCTGGGGGGCAAAACATCATCCATCCCGCTGGGCAGCACACTGTatt > 2:280847/1‑234 (MQ=255) cGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAgt < 1:713752/235‑1 (MQ=255) cGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGGTGTGGCGGGGG‑TACTTGTTGTAAGCCGGGTGGGGGGGAAAGGCTTTTGGGTGCGAAAAAATCATCCATCTAGCCGGTTAGCC‑ACCGTacat > 2:700831/1‑233 (MQ=255) cGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGGATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGGAAGGGGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGGGGGGCATGAGGTGATGTGCGCGCTGGGGCTACGCGTCCCGGGTGTGACGGGGT‑AAACTGTTGTTAGCCGGATCGGGGGGCACGGCTTTTGGGGGCGAAAAAAAAATCAATCCGGCTCGTCa > 2:713752/1‑224 (MQ=255) agtttAACGCTTTGCCCGAAGGCGGGTATTGGTAGCACGGTTGGGGTGTGGGGCAAGGAGATCAAAGTTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTaa < 2:526269/234‑1 (MQ=255) aaCGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGc < 1:443619/216‑1 (MQ=255) cGCCTTGCCCGGAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGGGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACa < 1:243221/236‑1 (MQ=255) cGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACa < 1:746826/236‑1 (MQ=255) gaccGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:446163/234‑1 (MQ=255) gCCCGGAGGCGGGTATGGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:743436/236‑1 (MQ=255) gCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCa < 1:188180/236‑1 (MQ=255) ccGCAGGCGGGTATTGGTACGCGGGTTGAGCTGGGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCAtt < 1:693687/236‑1 (MQ=255) gtggggtttATTGCTACGCCGGTTGGGCTTTGGGGCAAGGAGATCAAAATGGATGATG‑TCGCCGCCACTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGcc < 2:459410/228‑1 (MQ=255) cAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGcc < 1:700831/236‑1 (MQ=255) | GAGATTATTGGTGTCCAGACGCTAAAAGCGGGCGAGCGTGTGGGCTACGGCGGTCGCTATACTGCGCGCGATGAACAGCGAATCGGCATTGTCGCCGCAGGGTACGCCGACGGTTATCCGCGCCACGCGCCTACCGGTACCCCTGTTTTAGTGGACGGCGTGCGCACCATGACGGTGGGGACCGTCTCGATGGATATGCTAGCGGT‑CGATTTAACGCCTTGCCCGCAGGCGGGTATTGGTACGCCGGTTGAGCTGTGGGGCAAGGAGATCAAAATTGATGATG‑TCGCCGCCGCTGCCGGAACGGTGGGCTATGAGTTGATGTGCGCGCTGGCGCTACGCGTCCCGGTTGTGACGGTGT‑AACTTGTTGTAAGCCGGATCGGAGGCAACGTCTTCTGGGTGCAAAAAAATCATCCATCCGGCTGGTCAGCA‑ACTGTAGTTGTTAATGTGACAGAGCCATTGCC > NC_000913/1239590‑1240050 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |