Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,759,227 | 0 | A | T | 20.9% | 97.6 / 10.8 | 43 | V212E (GTA→GAA) | selB | selenocysteinyl‑tRNA‑specific translation factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/20); new base T (9/0); total (23/20) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
CGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTAT > NC_000913/3758994‑3759457 | cggcgTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTac < 1:49649/235‑1 (MQ=255) ggcgTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTacac < 1:18375/236‑1 (MQ=255) aaTATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCCCCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCa < 1:371449/229‑1 (MQ=255) aGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTTTGTTGGTTGGGTTTTGGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTTCACCAGTCAGCCACAGTGa > 1:505251/1‑236 (MQ=255) aGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGCTGGCTGGTTTTGTGCAGTCCGCGCCCGTGCACGCGTCGGGTTATTTTTACCAGTCAGccccagac > 2:371449/1‑229 (MQ=255) gCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTTTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGaa < 1:91246/236‑1 (MQ=255) gCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTTTTTGCTGGTTTTGCGCCTGCACGCCACGTACACGCATCCGGTTATTTTCACCAGTCAGCCAGAGTGa > 1:12441/1‑235 (MQ=255) gCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTTCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGGTTATTTTCACCAGTCAGTCAGAGTGa > 1:62366/1‑235 (MQ=255) tGCCACTGGGTCCGGGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCCCCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGcc < 1:231144/236‑1 (MQ=255) tGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGcc < 1:458428/236‑1 (MQ=255) ccACTGGGTCAGCGGTTGTGGGGTTTGAAGCCCGACAATCCCCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCCAATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCATAGTGAATCGCCt < 2:464950/235‑1 (MQ=255) tGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGGTTTGCGCATGCAACGCACGTACACGCATCGGGTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAAACGCCTACCTTCAC‑TTCCCCCCTTAAccacgt > 1:487795/1‑231 (MQ=255) aaGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTTTTTTGGGTGGGTTTTTGCACGCAGGCCACCTACCCCCACTGGGTTTTTTTTACCCGTCAGCCCCAGGGAAACGCCCACCTCTAC‑TTTCCCGCTTGacgacggaa > 2:311265/1‑233 (MQ=255) aGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTAGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTAc < 1:362723/235‑1 (MQ=255) gACAATCCCCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTaa < 1:762592/222‑1 (MQ=255) aCCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTTGCTGGGTTTTCGCATGCAGCGCACGTACACCCATCGGGTTATTTTACCCAATCAGCCCGAGGGAAAGTCCTCCCTTCCA‑TTTCCCGCCTAACAcccgac > 2:762592/1‑219 (MQ=255) aCCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTcc < 1:365081/207‑1 (MQ=255) tgtgAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTTTGTTGGCGGGTTTTTCGCATGCCGCGCACGGACACGCCTCGGGTTTTTTTTACCAGGCAGCCCCAGTGAATCGCCTACATTCAC‑TTCCCCGCTTCATGCCCTACCAGTGCCGTAC‑A‑GCCCg > 2:757115/1‑235 (MQ=255) tgtgAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGGTTTTCGCATGCAGCGCACGTACACGCCTCGGGTTTTTTTCAcc > 2:278710/1‑168 (MQ=255) ggCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGGTTTGCGCATGGAGCGCCCCGACACCCCTCGGGTTATTTTAACCAGTCAACCCGAGTGAAACGCCCCACCTCCC‑TTTCCCGCCTCAAGCCCGAACGGCGGAGACC‑A‑GCCCCGcggccgt > 2:356325/1‑230 (MQ=255) ctctGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTTTTTTGGCTGGTTTTGCGGCTGCAGCGCACCGAACCCCATCGGTTTTTTTAAACCAATCAGCCCGAGTGAAACGCCCACCTTCACTTTCCCCCCTTAA‑GCCGTAACAGTGACGACC‑ACGCCCgcgccc > 2:629379/1‑227 (MQ=255) acaTCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTTGGTGGGTTTTCGCATGCAGCCCCCGTACACGCCTCGGGTTTTTTATACCAGTCCACCAGAGGGAATCGCCCACCCTCAC‑TTTCCCGCCTTACACCCTTCCGGTGACGACCAA‑CCCCGCCACTTTTTACgtgaaaac > 2:585224/1‑229 (MQ=255) aggcGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAgg < 1:585224/233‑1 (MQ=255) cACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGc < 1:484379/231‑1 (MQ=255) cACGGTTAATCTGCTCTTTTGCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGaaa < 1:178390/236‑1 (MQ=255) tCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTTCGCCTGCAGCGCCCGGACACCCCTCGGGTTTTTTACCCCAGTCCGCCAGAGTGGAACGCCCTCCTTCAC‑CTTCCCGCCTAACGCCGTACCCGTTGCGACC‑A‑GCCCGGCACCACTTTCGGTAAATTCCCGGGCAATCGCGCAGCGGCAACTAtagttg > 2:156989/1‑231 (MQ=255) tctgagattatAAGCGCGATGCGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCgg < 2:669574/226‑1 (MQ=255) tAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAg < 1:14305/235‑1 (MQ=255) tACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTTCGCATGCAGCGCACGGACAAGCCTCGGTTTTTTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGGGACGACC‑A‑ACCCCGCACCCTTTTCGGTCAATGCGCGGGCAATCGCGAGGCGGGAACTATGTTTGGTTGGGGGCTTGCGGTCCGGGGACCGcagcaggagcgtg > 2:533728/1‑229 (MQ=255) cccGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAggg < 1:113964/236‑1 (MQ=255) ccGGCATTGGCGGTTTCGGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAggg < 1:629379/235‑1 (MQ=255) gCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATc < 1:533728/236‑1 (MQ=255) gCATTGGCGGTTTCTGGTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATc < 1:504912/236‑1 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCA‑TCCCCGACCTTCGGTtgc > 2:494855/1‑236 (MQ=255) cTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCACGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGCtg > 1:562105/1‑236 (MQ=255) cATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCA‑TCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATaa < 1:494855/236‑1 (MQ=255) cgcACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCgg < 2:169980/121‑1 (MQ=255) cgcACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCgg > 1:169980/1‑121 (MQ=255) cGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGtt < 1:156989/232‑1 (MQ=255) cATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCa > 2:488842/1‑235 (MQ=255) aTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCcaa > 2:729769/1‑236 (MQ=255) aTCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCaca > 1:634890/1‑234 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCTAAAc > 1:146293/1‑236 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAAc > 2:26928/1‑236 (MQ=255) cGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAAc > 1:330204/1‑236 (MQ=255) atttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGAAt > 1:411958/1‑235 (MQ=255) ttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTtgctg < 2:550071/198‑1 (MQ=255) ttaCACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTtgctg > 1:550071/1‑198 (MQ=255) | CGGCGTGGTGAATATGCAGCGGCTGCCACTGGGTCAGCGGTGTATGGGTTTGAAGCTCGACAATCACCCGTGTGAACGGCTCTGGCGGCACATCGGCAAGCAGCCAGTCGCCACGGTTAATCTGCTCTTTTTCCGCATCACCCGCGATGTTAAGCGCGATACGCTGCCCGGCATTGGCGGTTTCTGTTGGCTGGTTTTGCGCATGCAGCGCACGTACACGCATCGGTTTATTTACACCAGTCAGCCAGAGTGAATCGCCTACCTTCAC‑TTCCCCGCTTAACGCCGTACCGGTGACGACC‑A‑GCCCGGCACCTTTTACGGTAAATGCGCGGTCAATCGCGAGGCGGAAACTATGTTGGCTGGCGTGCTCGCGTTCCGGCAACTGAAGCAGATGCTCGCGCAGGGCATCCATTCCCCGACCTTCGGTTGCTGCGGTGATAAACAGTTTTGCCTCAGCAAAACCGTAT > NC_000913/3758994‑3759457 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |