| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,208,622 | T→G | L219* (TTA→TGA) | yehP → | VMA domain putative YehL ATPase stimulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,208,622 | 0 | T | G | 96.2% | 174.3 / ‑3.1 | 53 | L219* (TTA→TGA) | yehP | VMA domain putative YehL ATPase stimulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (24/27); total (24/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
TTGAAGAAATTATGGCTCGACTGGCAAAGGAAGTTCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTTACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCGTGGAGTATGGTCGGCAACTTATTGAA > NC_000913/2208397‑2208851 | ttgAAGAAATTATGGCCCGACTGGCAAAGGAAGTTCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTgg < 1:140376/231‑1 (MQ=255) taaaTTATGGCTCGACTGGCAAAGGAATTTCGTCCGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGTTCCACGTCCCCCTTCCTTTATTCCCCTGGCCCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCCCGCCAACCTGCCACCCTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAg < 2:167659/235‑1 (MQ=255) gCTCGACTGGAAAGGGAGTTTCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCTTTCATTTATTCCACTGGCGCGAACCTTTGATTCCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCg < 2:509598/229‑1 (MQ=255) gACTGGCAAAGGAAGTTCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGt < 1:641597/235‑1 (MQ=255) aCTGGCAAAAGAAGTTCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAAACTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCCAATCCCCCCGCGTTAACAGCCCCATTTAAAGCCCAAGAGCACAAAGGAAACAGGGCTGACTGGTTTGTCAAAACGGacagaacgtcg > 2:703982/1‑226 (MQ=255) tgcGTCAGGCTTTGTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCAAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGAt < 1:353634/230‑1 (MQ=255) tCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATc > 1:329335/1‑232 (MQ=255) tCGTCAGGCTTTTTCTGGGTTCCGAGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCa < 1:368063/234‑1 (MQ=255) 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2:329335/235‑1 (MQ=255) cTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCTCCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGAt > 2:707029/1‑179 (MQ=255) cTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGAt < 1:707029/179‑1 (MQ=255) cgAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATACCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGc > 1:448675/1‑236 (MQ=255) aCTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGtt < 2:212279/235‑1 (MQ=255) tGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCg > 2:465667/1‑143 (MQ=255) tGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCg < 1:465667/143‑1 (MQ=255) ccTGCAACCCTGGCCCCCGCAACCCGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAg < 2:120584/172‑1 (MQ=255) cacTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCg > 1:120584/1‑172 (MQ=255) cTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCa > 1:555238/1‑218 (MQ=255) 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gCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATTCGGTAGAGt > 1:399869/1‑236 (MQ=255) cAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACGCAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTGTGCGATCCGGTagagcg > 2:550398/1‑234 (MQ=255) aaGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTa < 1:533134/222‑1 (MQ=255) 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aaTCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGAGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTaacgttcgcg > 2:728449/1‑227 (MQ=255) tCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAg > 2:693657/1‑223 (MQ=255) tCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAg < 1:693657/223‑1 (MQ=255) ccccGTTTGAACAGCCGCATTAAACGCCAATGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGcggcgg < 2:399869/236‑1 (MQ=255) gCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGGCGTTGATCTCACGGCAGACGGTGCCGATCCGGTAGAGGTATTAATGAAAGGACAGATGGGCGGCCGGTCCAATATTGCCAGt > 2:226022/1‑236 (MQ=255) aTTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCa < 1:703982/232‑1 (MQ=255) aaaCGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCg < 1:550398/235‑1 (MQ=255) aGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTg > 1:315635/1‑60 (MQ=255) aGCGAACAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTg < 2:315635/60‑1 (MQ=255) aCAATGGCAACTGGTCTGACTGGTTGGTCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCGTGGAGTATGGTCg > 1:641136/1‑234 (MQ=255) attGGCAAGTGGACTTGCTGGTGAGTCAAAGCGGTTCGATGGTCGATTCGTTGATCCAGTCTGCGGTGATGGTGGCCTTTTTGTGGCAGTTCCCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACGCAAGCGTCGTTGATCTCACGGCGGACGTTGACGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCGTGGAGTATGGTCGGCa < 2:376007/233‑1 (MQ=255) ggTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGGTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGGGCCCGGGCGATTGGGTGGCAACTTTTTGaa > 1:20764/1‑235 (MQ=255) gTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCGTGGAGTa < 1:338990/215‑1 (MQ=255) gTCTGACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCGTGGAGTa > 2:338990/1‑215 (MQ=255) | TTGAAGAAATTATGGCTCGACTGGCAAAGGAAGTTCGTCAGGCTTTTTCTGGTGTCCGCGATCGCCGTCGCCGTTCATTTATTCCACTGGCGCGAAACTTTGATTTCAAAAGTACTCTGCGCGCCAACCTGCAACACTGGCACCCGCAACACGGCAAGTTGTATATCGAATCCCCCCGCTTTAACAGCCGCATTAAACGCCAAAGCGAACAATGGCAACTGGTCTTACTGGTTGATCAAAGCGGATCGATGGTCGATTCGGTGATCCACTCTGCGGTGATGGCGGCCTGTTTGTGGCAGTTACCCGGCATTCGTACCCATCTGGTGGCGTTTGACACAAGCGTCGTTGATCTCACGGCAGACGTTGCCGATCCGGTAGAGTTATTAATGAAAGTACAGTTGGGCGGCGGGACCAATATCGCCAGTGCCGTGGAGTATGGTCGGCAACTTATTGAA > NC_000913/2208397‑2208851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |