| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,273,796 | A→C | D478A (GAC→GCC) | yejA → | microcin C ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,273,796 | 0 | A | C | 98.3% | 191.0 / ‑3.5 | 59 | D478A (GAC→GCC) | yejA | microcin C ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (29/29); total (29/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
TGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGACTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACATGCTGCCA > NC_000913/2273563‑2274028 | tGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCt > 1:353160/1‑236 (MQ=255)tGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGCGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAGCATGGCCATTCGCAAGGTGGATCACTCGGAAATCACTCACCGCATACGCACACGCGCCt > 2:486524/1‑236 (MQ=255) aCAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGCTAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTAt > 1:234258/1‑236 (MQ=255) aaaaGCCGACACACTTCGCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGc < 1:736115/236‑1 (MQ=255) ttCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATg < 1:504758/213‑1 (MQ=255) ctcAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATggcg > 1:758373/1‑233 (MQ=255) aaCGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATCACTCGCAAATCACTAACCGCATTCGCAGTCGCGCCTATGACATGATTACGCGCGGATTGCGGTCGAt > 2:39321/1‑236 (MQ=255) cGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTa < 2:756830/204‑1 (MQ=255) cGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTa > 1:756830/1‑204 (MQ=255) aaGCGGGCTGGGTGCTTAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCg < 1:521874/236‑1 (MQ=255) aaGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCg < 2:331384/236‑1 (MQ=255) cGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCg < 2:353160/233‑1 (MQ=255) 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aGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGCTGCCGGGGCCCAGTTCCCACTTTCAgc > 2:654449/1‑233 (MQ=255) cgcgTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTg < 2:625726/236‑1 (MQ=255) gcgTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGGGATGGCGTGGTCCAGGTTCGCATTACAGATATcacgg > 2:232462/1‑232 (MQ=255) gcgTTAATGCCACAACGGGTAAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTg < 1:323479/235‑1 (MQ=255) tCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAAtt < 1:654449/236‑1 (MQ=255) tCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAAtt > 1:480113/1‑228 (MQ=255) tCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTtat < 2:758373/236‑1 (MQ=255) tCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCAGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAAtt < 2:480113/228‑1 (MQ=255) caaTTAGTGCTTCCCTCAAGCAGCAAGAGTCAGTGGGTACTCCCGTTCAAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACAGTATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATaa < 2:203505/229‑1 (MQ=255) 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tATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGACTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTg < 1:67900/230‑1 (MQ=255) aTTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGGC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCCGCG‑TGCAAAGCCCGGCTATCGACTCGCTGATCAccc > 1:454789/1‑236 (MQ=255) ttGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCa > 1:336794/1‑236 (MQ=255) 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aCATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑GGCAAAGCCCGGTTTTCGACTCGCTGCTCAACCAAATTATTGCCGCGCC‑GGGAAATAAAGAAAAATTACtt > 2:220670/1‑235 (MQ=255) cGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACt < 2:685711/175‑1 (MQ=255) cGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACt > 1:685711/1‑175 (MQ=255) cGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGc < 1:675387/235‑1 (MQ=255) 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tGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCCGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGGC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCCCTGATCAACCAAATTATTGCCGCCGC‑GGGACATAAAGAAAAATAAATGCCGTTAGGGCGCGCACTGGAACGCGGATTAACCCGGAAttatta > 2:259968/1‑235 (MQ=255) tGCGCAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATGTATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAAttatta > 2:626465/1‑235 (MQ=255) gcgcAGTCGCGCCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACa < 1:232462/236‑1 (MQ=255) gcgcCTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACATGCTGCCa < 1:220670/236‑1 (MQ=255) | TGACAACCTGTTAAAAGCCGACAAACTTCTCAACGAAGCGGGCTGGGTGCTGAAGGGTCAGCAACGCGTTAATGCCACAACGGGTCAGCCACTCAGCTTTGAATTATTGCTTCCCGCAAGCAGCAATAGTCAGTGGGTATTGCCGTTCCAGCACAGCCTGCAACGGCTGGGTATCAACATGGACATTCGCAAGGTGGATAACTCGCAAATCACTAACCGCATGCGCAGTCGCGACTATGACATGATGCCGCGCGTATGGCGGGCGATGCCGTGGCCCAGTTCCGATTTACAGATTTCCTGGTC‑ATCGGAATATATCAATTCCACTTATAATGCCCCCGGCG‑TGCAAAGCCCGGTTATCGACTCGCTGATCAACCAAATTATTGCCGCGCA‑GGGAAATAAAGAAAAATTACTGCCGTTGGGGCGAGCACTGGATCGCGTATTAACGTGGAATTATTACATGCTGCCA > NC_000913/2273563‑2274028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |