| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,589,778 | T→G | D728E (GAT→GAG) | acrD → | aminoglycoside/multidrug efflux system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,589,778 | 0 | T | G | 100.0% | 281.8 / NA | 80 | D728E (GAT→GAG) | acrD | aminoglycoside/multidrug efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (34/46); total (34/46) | |||||||||||
AGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCG > NC_000913/2589549‑2590003 | agccGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCTTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 2:194511/233‑1 (MQ=255)aGGCGTTTACCAAAATGAAAGAAGCTCGCGTTAGCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTGGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 1:561585/236‑1 (MQ=255)aGGCGTTTAACCAAATTAAAGATGCTCGCTTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 1:317277/236‑1 (MQ=255)aGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGGGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 2:422186/236‑1 (MQ=255)aGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 1:642222/236‑1 (MQ=255)aGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 1:371807/236‑1 (MQ=255) ccGTTAAACCAAATGAAAGGAGTTCGCGTTATCGACAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTGGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 2:614390/233‑1 (MQ=255) tttAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCg > 1:424510/1‑236 (MQ=255) aCCAAATTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTaaa > 1:614390/1‑236 (MQ=255) aTTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGTCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGGTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCa > 2:485983/1‑236 (MQ=255) aagaagCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGgcg < 1:567337/236‑1 (MQ=255) cTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGc > 2:163837/1‑236 (MQ=255) cgcgTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGCCGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAgcggccgtgc > 1:115986/1‑225 (MQ=255) cagcagCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATcgacg < 2:727553/236‑1 (MQ=255) cagcagCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTGGCGAtggtcg > 2:314943/1‑231 (MQ=255) cagcCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGCGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGata > 1:205409/1‑236 (MQ=255) ccAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGa > 1:307412/1‑236 (MQ=255) gactaTTAGCGTTCTTGGTAGTTATGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCGGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGaca < 2:618244/232‑1 (MQ=255) cagaaTTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACG‑GATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGacac < 2:345524/233‑1 (MQ=255) gCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCaa < 1:739762/236‑1 (MQ=255) tccgCAGTTTTTGATAGGGAGTTGCAGGTCCCAGCTGGGGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGtt < 2:481127/232‑1 (MQ=255) tCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc < 2:250615/165‑1 (MQ=255) tCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGAc > 1:250615/1‑165 (MQ=255) tCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGtt > 2:123060/1‑235 (MQ=255) tGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGat > 1:734546/1‑202 (MQ=255) tGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGat < 2:734546/202‑1 (MQ=255) gCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAg < 1:123060/236‑1 (MQ=255) gCAGGTTGTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAg < 1:473975/236‑1 (MQ=255) aGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCt < 1:163837/236‑1 (MQ=255) tttGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTc < 1:371334/227‑1 (MQ=255) tttGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTc > 2:371334/1‑227 (MQ=255) tttGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAAACGCCTGGGGTTCGAGCTAtgt > 1:411249/1‑236 (MQ=255) ttGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTAtgtg > 1:557942/1‑236 (MQ=255) tGATAGGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTAt < 1:131675/232‑1 (MQ=255) gATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGaa > 2:208631/1‑236 (MQ=255) atatGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTAACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAAt < 2:605726/236‑1 (MQ=255) ggAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGGGAATGACt > 2:307876/1‑236 (MQ=255) gTTGCGGAACCGCGCGGGAGCGGTTCACGATGCGCTGATGGAAGCACGTAATCGGTTGCTGGCGCTGGCAGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTa < 2:115986/236‑1 (MQ=255) gCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATgg > 1:622999/1‑236 (MQ=255) ccACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAg < 1:530097/210‑1 (MQ=255) ccACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAg > 2:530097/1‑210 (MQ=255) ccACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACAGCCTGGGGTTCGAGCTATGGGAATGAATTTATGGATccag > 2:226638/1‑233 (MQ=255) ccACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAAAGACACACTGCAAACAGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGTATGACTTTATGGactgcg > 2:469615/1‑231 (MQ=255) aCGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACCCTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGt > 2:583296/1‑236 (MQ=255) aCGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACAAACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGACcg > 1:616886/1‑232 (MQ=255) cGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACATTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCCATGTGAAAGAAGTTATGGATCGCGGta > 2:37875/1‑235 (MQ=255) gTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGaca < 2:343844/171‑1 (MQ=255) gTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGaca > 1:343844/1‑171 (MQ=255) gATGCGCTGATGGCAGGCAGTAAGCAGTGGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAGCCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATAAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCt < 2:605138/235‑1 (MQ=255) tGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTAt < 2:307412/235‑1 (MQ=255) gcTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCCTTTGGAATGACTTATTGGAACGCGGTCCCGTGACGAAAGCCAAtgtta > 2:552915/1‑234 (MQ=255) gagggCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTgca < 1:740619/231‑1 (MQ=255) aTGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGaa > 1:482629/1‑191 (MQ=255) aTGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGaa < 2:482629/191‑1 (MQ=255) ggCAGCCCGTAAACCGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTgcaggcag < 2:186083/236‑1 (MQ=255) agcaCGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTCTGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGGCTATGTGCAGGCAGCt > 2:543231/1‑235 (MQ=255) aCGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTCTATGGATCGCGGTCCCGTGAAGAAAGTGTATGTGCAGGCGGCTgcgc > 2:214113/1‑236 (MQ=255) gTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGa > 1:616662/1‑180 (MQ=255) gTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGa < 2:616662/180‑1 (MQ=255) tAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTgcg < 2:622999/232‑1 (MQ=255) gctggcgctggcGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTa < 2:578098/179‑1 (MQ=255) gctggcgctggcGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTa > 1:578098/1‑179 (MQ=255) ctggaggacaaaagCCAGGAGCACACCCGTGTGCGCCAGAAGGGCCACGACGAAATTCCGCAGTTGCGGATGGAGCTCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCAtgctgc < 2:424510/222‑1 (MQ=255) ttgggacggAAACCGCGGAGCAAGCCCGTGTGGGCCGTAACGGCCGCGACGACAGTACGCATGTGGAGGTTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCATGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACAGTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGa < 2:428785/229‑1 (MQ=255) tggcgGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGa < 1:624903/235‑1 (MQ=255) ggAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATACCGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTTCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATc < 1:226638/235‑1 (MQ=255) ggAAAACCCGGAGCTAACCCGTGGTCGGCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATc < 1:552915/235‑1 (MQ=255) aCCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAAtct < 2:302622/235‑1 (MQ=255) tgtgCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATcgacg < 2:463956/89‑1 (MQ=255) tgtgCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATcgacg > 1:463956/1‑89 (MQ=255) tgCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCa > 2:453711/1‑213 (MQ=255) tgCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCa > 2:723200/1‑213 (MQ=255) tgCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCa < 1:723200/213‑1 (MQ=255) tgCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCa < 1:453711/213‑1 (MQ=255) tagacgCCTCGGCGACAGTCCGCAGTTACAGAGTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATggcg < 2:313107/231‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAg < 1:519063/116‑1 (MQ=255) aaCGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAg > 2:519063/1‑116 (MQ=255) cGGCCTGGGCGACAGTCCGGAGTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCa < 2:557942/236‑1 (MQ=255) gTTGCAGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACTCACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTcg < 1:469615/236‑1 (MQ=255) aGATTGAGATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTcgcg < 1:307876/233‑1 (MQ=255) | AGGCGTTTAACCAAATTAAAGAAGCTCGCGTTATCGCCAGCAGCCCGCCAGCAATTAGCGGTCTTGGTAGTTCTGCAGGTTTTGATATGGAGTTGCAGGACCACGCTGGAGCGGGTCACGATGCGCTGATGGCAGCACGTAATCAGTTGCTGGCGCTGGCGGCGGAAAACCCGGAGCTAACCCGTGTGCGCCATAACGGCCTCGACGACAGTCCGCAGTTGCAGATTGATATCGACCAGCGTAAAGCTCAGGCGCTGGGCGTTGCTATCGACGATATTAACGACACACTGCAAACCGCCTGGGGTTCGAGCTATGTGAATGACTTTATGGATCGCGGTCGCGTGAAGAAAGTCTATGTGCAGGCAGCTGCGCCGTATCGCATGCTGCCAGATGACATCAATCTCTGGTATGTCCGAAATAAAGATGGCGGCATGGTGCCCTTCTCTGCTTTCGCG > NC_000913/2589549‑2590003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |