Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,040,512 | A→C | G104G (GGT→GGG) | cptA ← | toxin of CptAB toxin‑antitoxin pair |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,040,512 | 0 | A | C | 100.0% | 173.3 / NA | 52 | G104G (GGT→GGG) | cptA | toxin of CptAB toxin‑antitoxin pair |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (35/17); total (35/17) |
ACCAGTATGACCTTAGCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCTTTGACGATGCTCCACTCCTGCCCTTGCCAACGCAAACGCCCGTCCATCAACAAGCGAATTTCCCCCTGGCGAGCATTAATACGCCGCTGGCTGCGAACGCAATCAAACACCACCAGCGAAAGTAACACCATCCATAACGGGGTGTAACTGAGTGGCCAGGGCATGAGTAAAAT > NC_000913/3040297‑3040739 | aCCAGTATGACCTTAGCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAAc > 2:400088/1‑235 (MQ=255) aCCAGTATGACCTTAGCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAAc > 1:292489/1‑235 (MQ=255) tATGACCTTAGCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAACgcagca > 1:595268/1‑236 (MQ=255) aGCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAACTGTTGCCGTTTCCCGCCATCCGAACGGAAACGACGCATCATGCCGc > 2:34247/1‑236 (MQ=255) gCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTCAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAACGCAGcatc > 1:359671/1‑228 (MQ=255) 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1:137653/194‑1 (MQ=255) aGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACATAAACg > 2:137653/1‑194 (MQ=255) tCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCCCTTAATCATCCACGGTGCTTTGACGATGCTcc > 1:756724/1‑235 (MQ=255) aaCGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAACgca > 1:509053/1‑185 (MQ=255) aTGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTCCCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCTTTGACGATGCTCCACTCCTGCCCtt > 2:340944/1‑236 (MQ=255) 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(MQ=255) | ACCAGTATGACCTTAGCGACGAGCGTATTCAGAGCTGGTGCGAGCAAATCCTCAACGAAATGGCAGAGCATTACGCCTGATCTCACTGACGGCTTAGCGCATATGCTTTGCCGT‑CATCTTTATCTTTGCGTCTCTTGTTGCAACAAAATCCGCCGTAAATCCCGCCATTCAGCTTCGTCCATGCTGTCGGCTGCCAGCCATAAATGTTGCCGTTTACCGCCATCAGAACGTAAACGCAGCATCATGCCGCTCTTAATCATCCACGGTGCTTTGACGATGCTCCACTCCTGCCCTTGCCAACGCAAACGCCCGTCCATCAACAAGCGAATTTCCCCCTGGCGAGCATTAATACGCCGCTGGCTGCGAACGCAATCAAACACCACCAGCGAAAGTAACACCATCCATAACGGGGTGTAACTGAGTGGCCAGGGCATGAGTAAAAT > NC_000913/3040297‑3040739 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |