| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,052,652 | T→G | Q289H (CAA→CAC) | ubiH ← | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol hydroxylase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,052,652 | 0 | T | G | 96.8% | 197.2 / ‑1.9 | 62 | Q289H (CAA→CAC) | ubiH | 2‑octaprenyl‑6‑methoxyphenol hydroxylase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (28/32); total (29/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.06e-01 | |||||||||||
GTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCAGACATCGGC > NC_000913/3052421‑3052880 | gTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTgcg < 1:385360/236‑1 (MQ=255) gcgcCTGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGcgcc < 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cATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGa > 1:213086/1‑232 (MQ=255) gAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACaccaga < 2:203052/236‑1 (MQ=255) gAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACaccaga < 1:63391/236‑1 (MQ=255) aGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACaccaga > 2:499164/1‑235 (MQ=255) ttGCCCGGAAATCGGGTGCAGGGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTACCGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGc < 1:721974/236‑1 (MQ=255) cAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCCGACATCGGc > 1:618015/1‑235 (MQ=255) cAGAGTGTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCAGACATCGGc < 1:499164/235‑1 (MQ=255) | GTTGCGCCCGACAACCAGCGGTGCCCAACGGTTGGCAAAAAGATGTACAAGGCTGTCCGTGACGCCAATGGTTGCTTCGCGATCGCTCTGTCGACGCTGCTGATAACGGCACAATACGCCGTAATCCCCCATGTCTTCTCCGCGCTCCTGCGCCTGAGTCAGGGTTTCCGCAAGACTCATCACATCTCGCATACCGAGGTTAAACCCTTGCCCGGCAATCGGGTGCAGAGTTTGCGCCGCATTGCCCACCAGCACGGTACGATGGGTAATAGATCTGGC‑GGCGTGGGTTAACGCCAGCGGATAAGCACTGCGTTTACCAGCGTGGGTAATTTTCCCAAGTCGCCAGCCAAAGGCCGACTGGAGTTCACGGCAAAACTTCTCGTCACTCCACGACAACA‑CCTCTTCGCGCCGTTCCAGTGGATGACACCAGACCAGCGAACAGCGTCCGTCAGACATCGGC > NC_000913/3052421‑3052880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |