Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,540,754 | T→G | I116M (ATT→ATG) | feoB → | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,540,754 | 0 | T | G | 96.8% | 216.1 / ‑0.8 | 63 | I116M (ATT→ATG) | feoB | ferrous iron transporter protein B and GTP‑binding protein; membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (27/34); total (28/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.01e-01 |
TAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCC > NC_000913/3540526‑3540984 | tAAAGAAGGGCAATTCCCCACCCCCGTTCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCCCCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa < 2:720758/235‑1 (MQ=255) gaatGGCAATTCTCCCCCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGGGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa < 2:396162/231‑1 (MQ=255) cAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGa < 2:226666/229‑1 (MQ=255) cAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGa > 1:226666/1‑229 (MQ=255) ccGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa > 1:33370/1‑212 (MQ=255) ccGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCa < 2:33370/212‑1 (MQ=255) atcatcAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAg > 1:225307/1‑236 (MQ=255) cGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATAtt < 1:246786/233‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCCAGCAGCAAAATATTCgg > 2:265089/1‑235 (MQ=255) gCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTa > 2:209974/1‑236 (MQ=255) gCTGGTCGCCCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGCCCTCGCTCGATGGGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTa < 2:563291/236‑1 (MQ=255) gtggACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGa < 1:665299/236‑1 (MQ=255) gtggACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGa > 2:522268/1‑236 (MQ=255) gCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATg < 1:598156/236‑1 (MQ=255) tattccacgACCACCATCTCGTCGCGAGCCTCGCTCGATGAGCAAATCCCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGCCGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 2:225307/227‑1 (MQ=255) tATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 1:209974/235‑1 (MQ=255) tATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 1:173590/235‑1 (MQ=255) accaccATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGaa > 2:412046/1‑170 (MQ=255) accaccATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGaa < 1:412046/170‑1 (MQ=255) caTCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAACATATTCGGATTTAAATTGATGCTCTTTCGGACCGTCTGGGCTGTc > 2:147548/1‑236 (MQ=255) caTCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTc > 1:181422/1‑236 (MQ=255) cAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGAt > 1:724598/1‑233 (MQ=255) gACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc < 1:530427/236‑1 (MQ=255) gACCTCGCTCAATGAGCAAATCGCATGTCACTACATTTTGAGGTGAGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGTTGCGTCTAACCTTGCGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc < 2:265907/236‑1 (MQ=255) aCCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGCGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGTGGCGCCTGGGCGGTCCGCGGATCCCGCt > 2:80814/1‑236 (MQ=255) aTGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCG‑‑GCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAAccc > 2:588911/1‑235 (MQ=255) aaTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGt < 1:714658/235‑1 (MQ=255) aaTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGt < 1:147548/235‑1 (MQ=255) aTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg < 2:583680/200‑1 (MQ=255) aTCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg > 1:583680/1‑200 (MQ=255) tCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTcg < 1:640447/235‑1 (MQ=255) tCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTcg < 1:522268/235‑1 (MQ=255) cTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGTTCGCggaa > 2:743551/1‑234 (MQ=255) tCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTg < 1:617004/236‑1 (MQ=255) cATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCACGGTATTGAAgcgc > 2:12422/1‑236 (MQ=255) tGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCTCGGTATTGATgcgcg > 1:290470/1‑231 (MQ=255) cGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGAt < 1:80814/235‑1 (MQ=255) gctgATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCtata < 2:724598/236‑1 (MQ=255) gctgATTAACGTGATGGATGCATCTACCCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCtata < 2:152124/236‑1 (MQ=255) tAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTa > 1:500845/1‑236 (MQ=255) aCGGGGTGGAGTCGTCTAACCTTGAGCGAAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAAc < 2:181422/236‑1 (MQ=255) tggATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc > 2:605730/1‑165 (MQ=255) tggATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGc < 1:605730/165‑1 (MQ=255) gATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAAtgt > 2:16673/1‑236 (MQ=255) tAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 2:760333/128‑1 (MQ=255) tAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg > 1:760333/1‑128 (MQ=255) tAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACt > 1:740531/1‑234 (MQ=255) gAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg > 2:88566/1‑121 (MQ=255) gAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCgg < 1:88566/121‑1 (MQ=255) aGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGTGGCATTaa > 2:342348/1‑235 (MQ=255) tggTACCAGACGCTACAACTGCTGGAACTGGGCATTCCCTGAATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGc < 2:500845/233‑1 (MQ=255) 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aCCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCgctg < 1:514502/236‑1 (MQ=255) aCGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGGGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGGTCaa > 1:179366/1‑236 (MQ=255) aCGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCaa > 2:209941/1‑236 (MQ=255) cGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAAc < 1:342348/236‑1 (MQ=255) tACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGGGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGaa > 1:201348/1‑236 (MQ=255) ctgGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg < 2:234136/101‑1 (MQ=255) ctgGAACTCGGCATTCCCTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTggg > 1:234136/1‑101 (MQ=255) ccTGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATg < 1:298169/236‑1 (MQ=255) tGCATGGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTGCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGcc < 2:151600/236‑1 (MQ=255) | TAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCC > NC_000913/3540526‑3540984 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |