| Predicted mutation | ||||||
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| * | NC_000913 | 394,041 | 0 | T | G | 100.0% | 229.1 / NA | 65 | pseudogene (1072/1449 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
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TTCTGGTCAGGTGGATCAAGACAGCCAGACTGCCTACATCTACTCTTCTGCTCACTTCGCGAACAACGTCTTTGTTGATGGTAGCTTGAGCTACTCTCACTTCAACAACGACCTGTCTGCAACCATGAGCAACGGTACTTACGTTGACGGTAGCACCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTTACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCGATTCCATCGATAA > NC_000913/393809‑394267 | ttCTGGTCAGGTGGATCAAGACAGCCAGACTGCCTACATCTACTCTTCTGCTCACTTCGCGAACAACGTCTTTGTTGATGGTAGCTTGAGCTACTCTCACTTCAACAACGACCTGTCTGCAACCATGAGCAACGGTACTTACGTTGACGGTAGCACCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTGACg > 1:293005/1‑236 (MQ=255) ggTCAGGTGGATCAAGACAGCCAGACTGCCTACATCTACTCTTCTGCTCACTTCGCGAACAACGTCTTTGTTGATGGTAGCTTGAGCTACTCTCACTTCAACAACGACCTGTCTGCAACCATGAGCAACGGTACTTACGTTGACGGTAGCACCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTGACGGCAg < 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gCTGGTTACGTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCGAtt < 1:21395/235‑1 (MQ=255) gTTACGTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTacgac > 1:545500/1‑197 (MQ=255) gTTACGTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTacgac < 2:545500/197‑1 (MQ=255) gTTACGTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCGATTCCATc > 2:92275/1‑236 (MQ=255) tACGTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTg > 2:559906/1‑114 (MQ=255) tACGTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTg < 1:559906/114‑1 (MQ=255) gTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCGATTCCATCGATaa < 1:252396/236‑1 (MQ=255) gTGACTCCTGACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCGATTCCATCGATaa < 1:292726/236‑1 (MQ=255) | TTCTGGTCAGGTGGATCAAGACAGCCAGACTGCCTACATCTACTCTTCTGCTCACTTCGCGAACAACGTCTTTGTTGATGGTAGCTTGAGCTACTCTCACTTCAACAACGACCTGTCTGCAACCATGAGCAACGGTACTTACGTTGACGGTAGCACCAACTCCGACGCTTGGGGCTTCGGTTTGAAAGCCGGTTACGACTTCAAACTGGGTGATGCTGGTTACGTGACTCCTTACGGCAGCGTTTCTGGTCTGTTCCAGTCTGGTGATGACTACC‑‑‑‑‑AGCTGAGCAACGACATGAAAGTTGACGGTCAGTCTTACGACAGCATGCGTTATGAACTGGGTGTAGATGCAGGTTATACCTTCACCTACAGCGAAGATCAGGCTCTGACTCCGTACTTCAAACTGGCTTACGTCTACGACGACTCTAACAACGATAACGATGTGAACGGCGATTCCATCGATAA > NC_000913/393809‑394267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |