| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,291,339 | T→G | I288M (ATT→ATG) | nrfD → | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,291,339 | 0 | T | G | 98.3% | 201.7 / NA | 60 | I288M (ATT→ATG) | nrfD | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (32/27); total (32/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACACCGTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCAT > NC_000913/4291125‑4291564 | tACACCGGTTGGAAATCCCTGGGGTATGGGTTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 2:688562/235‑1 (MQ=255) gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGc < 1:670105/214‑1 (MQ=255) gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGc > 2:670105/1‑214 (MQ=255) gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 1:568691/1‑229 (MQ=255) gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 2:568691/229‑1 (MQ=255) gTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGtgtg > 1:268639/1‑231 (MQ=255) aTGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGTTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCTTGCCTGCCGTGCTGGCGTCCTGTGGGGc > 2:313717/1‑233 (MQ=255) tGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTgggg < 2:589803/231‑1 (MQ=255) tCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:233774/220‑1 (MQ=255) tCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 2:233774/1‑220 (MQ=255) ccTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTgg > 1:436489/1‑232 (MQ=255) ccTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCG‑‑GGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATGGCAGTTCCGGCATGCCGTCCGTGCTGGCGTGGTGTGGGGCCAGTCTGATTGGCg > 2:635082/1‑236 (MQ=255) tgtgGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTACTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCg > 1:537883/1‑236 (MQ=255) tCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGGGTTGATGCTGCGCctttt > 1:126546/1‑235 (MQ=255) gctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGGGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGGGCctt > 2:381901/1‑229 (MQ=255) ctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGACTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:696845/191‑1 (MQ=255) ctgGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCCGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGACTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 2:696845/1‑191 (MQ=255) ggtggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCGGCCGTGCTGGCGGCGGGTGGGGCCAGGCTGGTCGGCGGGTTGTGGCTGCGGCTTTTCAtgact > 2:92672/1‑231 (MQ=255) tggCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGGGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTAc > 1:303783/1‑236 (MQ=255) tCTGGCGGTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACgg < 1:92672/236‑1 (MQ=255) tGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGGGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTTGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTa < 1:326497/235‑1 (MQ=255) ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCg < 2:104978/231‑1 (MQ=255) ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCg > 1:104978/1‑231 (MQ=255) ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGGTGATGCTTCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGCCAGGTGACGGGGGCGTATGc > 2:21484/1‑236 (MQ=255) ggCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGCGTGGGGCCAGTCGGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATGCTCTACCCCCGACAGTTGCCgtgtgtgtaagc > 2:377677/1‑225 (MQ=255) gCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGc < 1:431877/235‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcgg < 2:406542/147‑1 (MQ=255) gTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcgg > 1:406542/1‑147 (MQ=255) aaaGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAgg < 2:436489/235‑1 (MQ=255) cGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGCAAAGAGGTGGTTTc > 1:4437/1‑236 (MQ=255) cGTGCGCGGGTGGCGGCATTAGGGGGCGGTTTCTGGCCGTGGTGTTTGTGGCTTGGTTTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTACTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTc < 2:537883/236‑1 (MQ=255) tGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCt < 1:518257/235‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGtt > 2:12579/1‑236 (MQ=255) cGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgtt < 1:293899/236‑1 (MQ=255) tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTa > 1:102061/1‑205 (MQ=255) tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTa < 2:102061/205‑1 (MQ=255) tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgttg < 1:381901/235‑1 (MQ=255) ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGGGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgttgtt > 1:8828/1‑236 (MQ=255) gtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGGTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTAGTCCTTACTGAAGTCGGTGTTCTTGGgttgttg > 2:262504/1‑236 (MQ=255) gtTCTGGCTTGGGGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCgttgttgtt < 1:313717/235‑1 (MQ=255) gCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGtctc > 1:111903/1‑236 (MQ=255) gCTTGGTGTCGCAGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGtct < 2:211997/235‑1 (MQ=255) cTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCg < 1:618878/236‑1 (MQ=255) gtttCGCCGGGCTGGGCCTTATTGTGCCAATGCTGCTCAAGCCGGGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCgggg < 1:421436/232‑1 (MQ=255) tgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTc < 1:49054/236‑1 (MQ=255) gtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCa < 1:17125/236‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGCAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGGTAAGTCTCGTGGTCAACg > 2:259574/1‑236 (MQ=255) 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gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGTCGTAAGCCAGAAAAGGGGTGGTTTCTGGACGGATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGTAGTTGTTGCTAAGGCCAGGGGTCAACGTGTTGAACCCGTTGTCGGCCTTcgatgc > 2:392365/1‑231 (MQ=255) ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTAtt < 2:333347/156‑1 (MQ=255) ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTAtt > 1:333347/1‑156 (MQ=255) gggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCTGGAGTGCGGt > 1:72999/1‑232 (MQ=255) 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aTCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTgcgc > 1:531786/1‑231 (MQ=255) cAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGcc < 2:268639/236‑1 (MQ=255) ttCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCat > 1:135808/1‑235 (MQ=255) | TACACCGTATGGAAATCCCTGTGGTATGGGGTGAAATCTTCCTGCTGGTGGCGTTTTTTGTCGGTCTGGCGCTGGGCGATGACGGTAAAGTTCGTGCGCTGGTGGCGGCATTAGGTGGCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAAGCCAGAAAAGAGGTGGTTTCTGGACGTATTCCTTCCTGAAGTCGGTTTTCTGGCGTTGTTGTTAAGTCTCGGGGTCAACGTGTTGACCCCGTTGACGGCCTTCGCGGGAGTGCGGTTGCGCTGGCCTGCCAT > NC_000913/4291125‑4291564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |