Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,403,148 | A→C | N371H (AAC→CAC) | hflK → | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,403,148 | 0 | A | C | 99.1% | 357.2 / NA | 106 | N371H (AAC→CAC) | hflK | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (50/55); minor base T (1/0); total (51/55) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCCAGACCATCCTGGAAGCTCAGGGTGAAGTGGCGCGCTTTGCTAAACTTCTGCCGGAATATAAAGCCGCGCCGGAAATTACTCGCGAGCGTCTGTATATCGAGACGATGGAAAAAGTG‑TTGGGTAACACCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGGACCAACGCCGCGCCAACGCGCAGCGTAACGACTACCAGCGTCAGGGGGAATAACGATGCGTAAGTCAGTTATCGCGATTATCATCATCGTGCTGGTAGTGCTTTACATGTCTGTCTTTGTCGTCAAAGAAGGT > NC_000913/4402921‑4403377 | cccAGACCATCCTGGAAGCTCAGGGTGAAGTGGCGCGCTTTGCTAAACTTCTGCCGGAATATAAAGCCGCGCCGGAAATTACTCGCGAGCGTCTGTATATCGAGACGATGGAAAAAGTG‑TTGGGTAACACCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGcc > 2:122907/1‑236 (MQ=255) ttcTGGAAGCCTAGGGTGAAGTGGCAGGTTTTGCTAAACTTCTGCCGGAATATAAAGCCGCGCCGGAAATTACTCGCGAGCGTCTGTATATCGAGACGATGGAAAAAGTG‑TTGGGTAACACCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCa < 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |