| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 491,048 | T→G | F56C (TTT→TGT) | ybaN → | DUF454 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 491,048 | 0 | T | G | 98.9% | 288.9 / NA | 92 | F56C (TTT→TGT) | ybaN | DUF454 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (51/40); total (52/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
AAGACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTGAAGCACAACAATCGCAGTTGCAA > NC_000913/490816‑491281 | aaGACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTGGtgtg > 1:553799/1‑235 (MQ=255) gACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTTGTGTGGCa > 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aTGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTTACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGTCAGCTATCt > 2:474360/1‑236 (MQ=255) tGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTTCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTTCTGTACCGCTCATGGAGTGGCTGCTCTCTa > 1:762618/1‑236 (MQ=255) gATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCGGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATACCGCTGGCGGCCTGGCGCTTTGCACGTTCTTCCTCGCGATTTCACACCTGGTCGCTGTACTGATCATGGTGTGGCTGGTACCTACGtcta > 2:180620/1‑232 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |