| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 615,736 | A→C | E527A (GAA→GCA) | entF → | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 615,736 | 0 | A | C | 98.5% | 211.5 / ‑6.1 | 65 | E527A (GAA→GCA) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (25/39); minor base G (1/0); total (26/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTT > NC_000913/615504‑615962 | gTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGGCCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGAACCCGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGc > 1:193443/1‑236 (MQ=255) aatcccAGACACCCAGCTTAGCGCGCGTGTGGCAGACAGAGCGGCAAAATCACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTGCCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGa < 2:497385/231‑1 (MQ=255) cAGAACCCGCGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGc < 1:179868/235‑1 (MQ=255) cgctcTTGGCGCGCTGGTGCCACAACGAGCTGCAAAACCACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGGTCGTTCCCAGTTCGTGCT‑GCGGAAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCGGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGCCCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGc < 2:3680/229‑1 (MQ=255) cGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCg < 1:538424/236‑1 (MQ=255) gCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACCCCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGc < 2:220415/236‑1 (MQ=255) ggtggCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGGCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGCTAGTTTGACATGGAGCGGCCTGGCTTCCCCTGGATACCGGc > 1:674666/1‑235 (MQ=255) ggtggCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGCTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCCCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATTCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTTGCTTCCGCTGGGTACCgcc > 1:97238/1‑233 (MQ=255) aaGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGGTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATAACGGCCATCCGGACGa > 1:707580/1‑235 (MQ=255) aaGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGGCTTTTTGAACCTGGCACTCCATGCGATAGATGCACCTGGAGCGGCCTGGGTACCGCCGGGGACCGGCTAGTCGGACGa > 2:197500/1‑235 (MQ=255) gCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGa < 2:514096/165‑1 (MQ=255) gCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGa > 1:514096/1‑165 (MQ=255) agtggcagtttACCTGGTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGGGAGGGCGGCGTTAAACCAGGGGGAAACGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGcgtccgt < 2:344421/227‑1 (MQ=255) gtgTTGCCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGGGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGc < 2:547904/231‑1 (MQ=255) gcgTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCg < 1:515309/232‑1 (MQ=255) gTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTacca > 1:423401/1‑236 (MQ=255) ttC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGGCCGTCCCTGTTAATTacca > 1:614324/1‑235 (MQ=255) gcttacGGGAAATGCGCCGTCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGGGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACcga < 2:579613/230‑1 (MQ=255) gggAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTg > 2:221883/1‑145 (MQ=255) 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cgcgAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCCGCCATCCGGACGATCGCCTTGAAATGATTCTGGAAGCAGCGCGGCCCGCGCTGCTACTTTCCACCGACGATCAAATGcccag > 2:71184/1‑233 (MQ=255) gtggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCcg < 1:549580/222‑1 (MQ=255) tggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGCACAGCGTGGCGGTGGCACTGCCGCGATCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCg < 2:284644/231‑1 (MQ=255) aggCGCTGGGGAATCTGCTGCTGGAGCCGGGCGTTAACCCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCCCTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCg < 2:193443/230‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCATACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGtt < 1:579150/235‑1 (MQ=255) ggCACTGGCGAATCTGCTGCGTTAGCGGGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGGGGCACTACCGCGTTCGGTCTTTTGGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGtt < 2:614324/235‑1 (MQ=255) tgggaaaTCTGCTGCGAGCGCACGGCGTTAAACCAGGGGACTGAGTGGCGTTGGCTCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCaa < 2:199645/230‑1 (MQ=255) tGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGcgtccgt > 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1:250939/235‑1 (MQ=255) acgaGGGGAAAGCATAGCGGTGGCCCTACCGCGCTCGTTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTa < 2:488204/233‑1 (MQ=255) ccAGGGGACAGGGTGGGGGTGGCACTACCGCGGTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTa < 1:199529/235‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGGTGGCACTACCCCGCTCGGTCTTTTTTACCCTGGCACTCCCTGCGGTAGTTGCCGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGCTACCGGCCATCCGGACGAACGCCTGAAAATGATGCTTGAAGATTCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCCTTTGCGATGTTTCCCATTTAACAAGCCCTTGGTATAACACCCCGCGTTCACCGcctgg > 2:69659/1‑232 (MQ=255) gCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGaa > 2:638409/1‑115 (MQ=255) 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tCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTatat < 1:69659/235‑1 (MQ=255) tGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATcac < 2:550039/220‑1 (MQ=255) tGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATcac > 1:550039/1‑220 (MQ=255) gCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCa > 2:719108/1‑182 (MQ=255) gCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCa < 1:719108/182‑1 (MQ=255) cGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCttt < 1:474770/236‑1 (MQ=255) aGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCCCACGGCTTATATCATCttt > 1:263978/1‑232 (MQ=255) | GTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTT > NC_000913/615504‑615962 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |