| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,602,017 | (C)7→8 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,602,010 | 1 | . | C | 86.7% | 550.2 / 85.6 | 180 | coding (193/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (13/11); new base C (67/89); total (80/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
ATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTC > NC_000913/2601911‑2602104 | aTTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTg > 2:1969269/1‑100 (MQ=255)aTTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTg > 1:2025059/1‑100 (MQ=255)aTTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTg > 1:2523127/1‑100 (MQ=255) ttAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c < 1:2309784/100‑1 (MQ=255) tAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑c < 1:63657/100‑1 (MQ=255) tAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTA‑‑c‑c < 1:5389774/100‑1 (MQ=255) aagttttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑cc < 2:2339430/96‑1 (MQ=255) aaGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑cc > 2:2582244/1‑100 (MQ=255) gCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑cccc > 2:4955702/1‑100 (MQ=255) gCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑cccc > 2:385116/1‑100 (MQ=255) cTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑ccccc < 2:2000980/100‑1 (MQ=255) tttCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑c‑cccccc > 1:641517/1‑100 (MQ=255) ccGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCctt < 1:5511794/100‑1 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCcttt > 1:3370032/1‑100 (MQ=255) ggCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCctttt > 2:699280/1‑99 (MQ=255) ggCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCctttt < 1:786927/100‑2 (MQ=255) ggCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCctttt < 2:275731/100‑2 (MQ=255) gCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTg > 1:2987685/1‑100 (MQ=255) gCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCcttttg < 2:4743679/100‑3 (MQ=255) gCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTGTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTg < 1:4896519/100‑1 (MQ=255) gCATCACATCACTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTg < 1:2893183/100‑1 (MQ=255) aTCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGaa > 1:350057/1‑100 (MQ=255) cacaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAAtt > 1:2932117/1‑100 (MQ=255) acaTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAAttt > 1:4158249/1‑100 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTg < 1:5280515/100‑1 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTg < 1:4368885/100‑1 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTg < 2:3611676/100‑1 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTg > 1:2669031/1‑100 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGc > 1:1600646/1‑100 (MQ=255) aTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGc < 2:4433343/100‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGGGCGGCGTGTTTGGCATCCTCAGCGGAATTGCGGCATTACATGCTCGTGTATCTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGcc < 2:5057650/99‑1 (MQ=255) ngCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCg > 1:907609/2‑100 (MQ=255) cGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCg > 1:3301887/1‑100 (MQ=255) cTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAt < 2:2003281/100‑1 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt > 1:364558/1‑100 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt < 2:1724030/100‑1 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt < 1:707989/100‑1 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt < 2:4146261/100‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc > 2:5394850/1‑100 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc < 2:903029/100‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc < 1:2039681/100‑1 (MQ=255) cgTGTTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 1:4990768/100‑1 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg > 2:5025/1‑100 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 2:2959693/100‑1 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCg < 1:873626/100‑1 (MQ=255) gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGAGAAt < 1:2233116/100‑1 (MQ=255) gATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACCTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAAt > 2:3161373/1‑100 (MQ=255) aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATg < 2:3806400/100‑1 (MQ=255) tGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt < 2:4884410/100‑1 (MQ=255) tGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACCTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGa < 1:3190884/100‑1 (MQ=255) ggCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt > 1:4755935/1‑100 (MQ=255) ggCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt < 1:4226181/100‑1 (MQ=255) ggCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt > 1:998125/1‑100 (MQ=255) gCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATa > 2:4552878/1‑100 (MQ=255) gCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATa < 2:3882082/100‑1 (MQ=255) catcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCct > 1:1852245/1‑100 (MQ=255) atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctc > 1:1183802/1‑100 (MQ=255) tcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc > 2:3619203/1‑100 (MQ=255) aGCGGAATTACGCCATGACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTATCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg < 2:4741341/100‑1 (MQ=255) aGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg < 1:1053103/100‑1 (MQ=255) aGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg < 1:1656835/100‑1 (MQ=255) aGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCg > 2:1312632/1‑100 (MQ=255) gCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCgg < 1:3128928/100‑1 (MQ=255) gCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCgg < 1:5059/100‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAt > 1:5206345/1‑100 (MQ=255) aaTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAtt < 2:2796646/100‑1 (MQ=255) aTTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAttt > 1:1687297/1‑100 (MQ=255) tACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTAt > 2:2244493/1‑100 (MQ=255) tACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCTTTTGGATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCCCTCGGCATTTATg < 1:4063900/100‑1 (MQ=255) aCGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg > 2:3061259/1‑100 (MQ=255) aCGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg < 2:1231685/100‑1 (MQ=255) cGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg < 2:4670312/100‑1 (MQ=255) cGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg < 1:3659980/100‑1 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTg > 1:5073764/1‑100 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 2:4044803/1‑100 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt < 2:1494462/100‑1 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑CACCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTgat > 2:3578625/1‑98 (MQ=255) aCATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt > 2:4812664/1‑100 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa < 1:686955/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa < 1:37736/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa < 2:4401949/100‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCC‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa < 2:157629/100‑1 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCt > 2:1864938/1‑100 (MQ=255) gtAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCCTg > 1:1992739/1‑100 (MQ=255) tAACTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 1:2265348/100‑1 (MQ=255) aaCTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCt > 1:1407872/1‑100 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGAATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtg > 2:5239970/1‑100 (MQ=255) cTTTAGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtgg > 2:4007510/1‑100 (MQ=255) aGTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt < 1:1131979/100‑1 (MQ=255) gTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 2:3284203/1‑100 (MQ=255) gTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 1:5371100/1‑100 (MQ=255) gTCGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggcggcg > 1:2193662/1‑98 (MQ=255) cGCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGTCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTggtggtggt < 1:4538208/100‑1 (MQ=255) gCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTTCCGATTTAACCCTTCGGATGGATAGCCTCTCGGCCTTTATTGTGCTGGTTATTTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 1:1238169/1‑100 (MQ=255) gCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 1:1875856/1‑100 (MQ=255) gCCCGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt < 2:3625638/100‑1 (MQ=255) cccGTTTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGttt > 1:2897287/1‑100 (MQ=255) cccGATTTGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCCGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCCTGCTGGTGGTGGttt > 2:778633/1‑100 (MQ=255) cctttttGC‑C‑CCCCCCTTTTTAACTTGCCGATTTAGCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGCTTTg < 2:4646042/97‑1 (MQ=255) ttttGC‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAGCCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTtc < 2:5496352/100‑1 (MQ=255) | ATTAAGCTTTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑‑C‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTTTGTTC > NC_000913/2601911‑2602104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |