| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3943635 | NA (NA) | 75 (0.370) | 32/184 | 13.4 | 67.4% | intergenic (+125/‑69) | gltU/rrlC | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA of rrnC operon |
| ? | NC_000913 | = 4037446 | 39 (0.180) | intergenic (+111/‑73) | alaT/rrlA | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA of rrnA operon | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAgttgttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3943537‑3943635‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTAC < NC_000913/4037446‑4037341 CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG < 2:4564119/100‑1CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG > 2:881983/1‑100CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG < 1:260928/100‑1CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGAACAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAG > 2:2603789/1‑100 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT > 1:4663843/1‑100 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT > 1:2198704/1‑100 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT > 2:4762528/1‑100 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT < 2:408349/100‑1 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT < 1:1285476/100‑1 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT > 2:3735036/1‑100 TGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTGTAAAAATCTGGATCAAGCTGATAATTGAAACACTGAACAACGAAAGT < 1:4979608/100‑1 GCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTT < 2:4044441/100‑1 GCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTT < 1:5146976/100‑1 CCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTTATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTG < 1:5257109/100‑1 CCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTTCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTG > 2:2087468/1‑100 CCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTG > 1:298282/1‑100 CCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTG < 1:937603/100‑1 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT > 2:4031165/1‑100 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT > 1:743400/1‑100 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT < 2:3809167/100‑1 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT > 2:673266/1‑100 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT > 1:3179734/1‑100 CTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGT > 1:1190956/1‑100 TTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTT < 1:3806379/100‑1 TTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTT > 1:1916606/1‑100 TTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTT > 1:5437274/1‑100 TAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC < 2:3450843/100‑1 TAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC > 1:190800/1‑100 TAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC > 2:3471736/1‑100 TCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGT < 2:561506/100‑1 TCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGT < 1:2056970/100‑1 CAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACAC‑GAACAACTCTCGTTGTTCAGTGTTTCA < 1:1077808/100‑1 AAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGACCAAGCTGAAAATTGAAACACTGCTCAGCGAGAGTTGCTCAGTGTTTCAA > 1:3496277/1‑100 AACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAAT < 2:2246006/100‑1 CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTT < 1:2974757/100‑1 CATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACAC‑GAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCA > 2:2970769/1‑100 TTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACCGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCT < 1:2561409/100‑1 GGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACAC‑GAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATC < 1:2998843/100‑1 GAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTT < 2:4465683/100‑1 GATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAA > 1:3689667/1‑100 ATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTTGTTAAGTGTTTCAATTTTCAGCGTGATCCAGATTTTTAAAGA > 1:4675555/1‑100 GCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAGAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGCGCAA < 2:1518178/100‑1 CTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAta > 1:1519691/1‑98 TAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACAC‑GAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCG < 1:1030485/100‑1 AAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCG > 2:3357829/1‑100 AAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC‑GTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCA > 1:4070552/1‑100 GGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAAC > 1:176755/1‑100 GATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACTTTCGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACC < 2:1781764/100‑1 AGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC‑GTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCA > 2:4089054/1‑100 TTGAAACACTGAACAATGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACT > 1:1957889/1‑100 TGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTC > 1:3901678/1‑100 TGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTC > 1:3250757/1‑100 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GAACAACGAAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATT > 2:3182215/1‑100 AAAGTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTT < 2:1852377/100‑1 tccTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGCTTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTA < 1:5082157/97‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT < 2:3077259/100‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT < 1:1483411/100‑1 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT > 1:3381647/1‑100 GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGAACCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACATTTGAAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAa > 2:3302272/1‑99 GTTGTTCAGAGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATGTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGACCCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAAT > 2:3161889/1‑100 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CTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAgttgttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3943537‑3943635‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTGTTCAGTGTTTCAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTAC < NC_000913/4037446‑4037341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |