Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 111,051 | IS1 (–) +9 bp | coding (8‑16/390 nt) | mutT → | dGTP‑preferring nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 19796 = | NA (NA) | 230 (1.050) | 113/198 | 0.4 | 99.1% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 111059 | 2 (0.010) | coding (16/390 nt) | mutT | dGTP‑preferring nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 20563 | NA (NA) | 208 (0.950) | 108/198 | 0.6 | 99.0% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 111051 = | 2 (0.010) | coding (8/390 nt) | mutT | dGTP‑preferring nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
TTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_000913/19697‑19894 | ccGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTaa > 1:3661899/1‑100 (MQ=255) ctcTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAAt < 1:3219547/98‑1 (MQ=255) cTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGa > 1:3104480/1‑100 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGAc < 2:142463/100‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGAc < 2:2539454/100‑1 (MQ=255) ttGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGCGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTGCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGAc < 1:4828769/100‑1 (MQ=255) tGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACt < 2:3040378/100‑1 (MQ=255) agaCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTcc > 1:319612/1‑100 (MQ=255) agaCATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTcc > 2:4892044/1‑100 (MQ=255) cATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAAc > 2:1876569/1‑100 (MQ=255) tGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTa > 2:3804883/1‑100 (MQ=255) ttCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTg < 1:4786383/100‑1 (MQ=255) ttCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTg < 2:1377327/100‑1 (MQ=255) ccATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGAt > 2:1148385/1‑100 (MQ=255) ccATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGAt > 2:3961326/1‑100 (MQ=255) cATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 2:5311236/1‑100 (MQ=255) cATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 2:2485256/1‑100 (MQ=255) atatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 1:5479032/1‑100 (MQ=255) atatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAg > 2:1617838/1‑100 (MQ=255) tatGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgt > 2:2372435/1‑100 (MQ=255) atGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg < 1:5353214/100‑1 (MQ=255) tGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtgt > 2:3743606/1‑100 (MQ=255) aCGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 1:1176785/100‑1 (MQ=255) ngcgGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:2163854/2‑100 (MQ=255) cgcgGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa < 2:43084/100‑1 (MQ=255) cgcgGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa < 2:3397190/100‑1 (MQ=255) cgGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 2:1214331/100‑1 (MQ=255) ggCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt > 2:3569011/1‑100 (MQ=255) aataaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:3420778/1‑100 (MQ=255) ataaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:3301222/100‑1 (MQ=255) ataaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:498940/100‑1 (MQ=255) taaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa > 1:1811109/1‑100 (MQ=255) aaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:1004841/1‑100 (MQ=255) aaataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa > 1:4516162/1‑100 (MQ=255) agtaGAGGAATATGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTGGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt > 2:5106096/3‑100 (MQ=255) aataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 2:386344/100‑1 (MQ=255) ataGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATg < 1:3556910/100‑1 (MQ=255) agagGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc < 1:664476/100‑1 (MQ=255) ngAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 1:4412590/2‑100 (MQ=255) ggAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa < 1:400342/100‑1 (MQ=255) gAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 2:776094/100‑1 (MQ=255) aTCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa > 2:1664600/1‑100 (MQ=255) aTCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 1:3602271/100‑1 (MQ=255) cTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt < 1:2397987/100‑1 (MQ=255) cTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:4170482/1‑100 (MQ=255) atcttACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt < 1:4376716/97‑1 (MQ=255) gATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 2:3316026/1‑100 (MQ=255) gATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:5042888/1‑100 (MQ=255) aTTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 2:826438/100‑1 (MQ=255) aTTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 2:2812154/100‑1 (MQ=255) ttACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 1:2815381/100‑1 (MQ=255) ttACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 1:2763640/100‑1 (MQ=255) tACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc > 1:4814757/1‑100 (MQ=255) acttacttCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACGCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTct > 2:4649311/1‑99 (MQ=255) aCTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 2:5401919/1‑100 (MQ=255) aCTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa < 2:572394/100‑1 (MQ=255) cttccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt > 2:4365214/1‑100 (MQ=255) cttccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:1238659/100‑1 (MQ=255) ttccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg > 1:5522069/1‑100 (MQ=255) tccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATgn < 2:2141240/100‑2 (MQ=255) tccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc > 1:2709995/1‑100 (MQ=255) ccttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa > 1:1134910/1‑100 (MQ=255) cttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 2:4532083/1‑100 (MQ=255) cttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 1:2548262/1‑100 (MQ=255) ttcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc > 1:352440/1‑100 (MQ=255) tcATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGCTAGAGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCt > 2:5070000/1‑100 (MQ=255) 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1:1399461/100‑1 (MQ=255) cTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 2:2072441/1‑100 (MQ=255) cTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt < 1:1536825/100‑1 (MQ=255) tGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg < 1:1353670/100‑1 (MQ=255) tGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg < 1:1637469/100‑1 (MQ=255) tGAAAAGAGTAGTAANTGCTGGTAATGACNCCAACTTATTGATATTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg < 2:2448153/100‑1 (MQ=255) gAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 1:2035804/1‑100 (MQ=255) gAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga < 2:1046363/100‑1 (MQ=255) 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2:4040039/100‑1 (MQ=255) tagtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 2:433609/100‑1 (MQ=255) ngtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATTCAGCTCCACCGAGGTTGAGAACGagag > 1:4455574/2‑100 (MQ=14) gtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGATCAGATAATGCACGATGACTTTGTCATGCCGATCACCCGATTTTGAGAACGCCacc > 2:4239139/1‑98 (MQ=14) aaTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCTCCGATTTTGACAACGACAGCGa > 1:5068773/1‑100 (MQ=255) aaTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa > 1:3059935/1‑100 (MQ=38) aaTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa > 2:127444/1‑100 (MQ=38) aTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc > 1:4611282/1‑100 (MQ=37) ttGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACt > 2:1996343/1‑100 (MQ=35) tGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACtt > 1:4115865/1‑100 (MQ=34) cTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc > 1:1970588/1‑100 (MQ=32) tGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCg < 1:2505632/100‑1 (MQ=31) | TTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > NC_000913/19697‑19894 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |