| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,958,272 | 0 | T | G | 22.7% | 503.2 / 141.3 | 238 | intergenic (‑140/+248) | torY/cutC | TMAO reductase III (TorYZ), cytochrome c‑type subunit/copper homeostasis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (97/87); new base G (26/28); total (123/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
TAATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCA > NC_000913/1958174‑1958370 | taATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAtt < 2:4433540/100‑1 (MQ=255) aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGc < 2:1650897/100‑1 (MQ=255) aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGc < 1:1404949/100‑1 (MQ=255) aTTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGc > 2:310038/1‑100 (MQ=255) ttAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCt > 1:3719824/1‑100 (MQ=255) aaaTATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTaa > 1:5133058/1‑100 (MQ=255) aaTATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAg < 2:3788872/100‑1 (MQ=255) tataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACATTCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGa > 2:4972782/1‑100 (MQ=255) ataCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGaa < 1:2906986/100‑1 (MQ=255) taCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAAt > 1:4350166/1‑100 (MQ=255) taCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAAt > 2:5264911/1‑100 (MQ=255) aCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATa > 1:3752367/1‑100 (MQ=255) aCAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATa < 2:4114969/100‑1 (MQ=255) cAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATaa > 1:1726654/1‑100 (MQ=255) cAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATaa > 2:969126/1‑100 (MQ=255) aaCGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAAc > 1:2124220/1‑100 (MQ=255) ctaaTTAACCGCCTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGATACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAAccc < 2:1510006/98‑1 (MQ=255) cGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAAccc < 2:3539675/100‑1 (MQ=255) aaTTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAg < 1:3967949/100‑1 (MQ=255) aaTTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAg < 1:1320371/100‑1 (MQ=255) ttAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGtt < 1:5220096/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTg < 2:1678603/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTg < 1:3241766/100‑1 (MQ=255) aaCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGCTAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGc > 1:4740387/1‑100 (MQ=255) aaCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGc < 1:16649/100‑1 (MQ=255) aCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCt > 2:1884955/1‑100 (MQ=255) aCCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCt > 2:5099967/1‑100 (MQ=255) ttGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTa < 1:1260819/100‑1 (MQ=255) ttGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTa < 1:1900884/100‑1 (MQ=255) tGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAg < 1:1175572/100‑1 (MQ=255) tGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAg > 2:858271/1‑100 (MQ=255) tGCATAATTAGGCACAACAATCCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAAGGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAg > 1:4754947/1‑100 (MQ=255) cATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGaa > 2:2099685/1‑100 (MQ=255) aTAATTAGGCACGACACTGCCTGAAACAATGGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAat < 2:4518954/100‑1 (MQ=255) aTAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAat > 2:1308775/1‑100 (MQ=255) aTAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAat < 2:4013666/100‑1 (MQ=255) aTAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAAGCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAat < 2:1799879/100‑1 (MQ=255) aaTTAGGCACAACACCGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGTatat < 2:4655289/100‑1 (MQ=255) tAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAatatata < 1:5042743/100‑1 (MQ=255) tAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAatatata < 1:1821614/100‑1 (MQ=255) tAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAatatata < 1:3771892/100‑1 (MQ=255) ggCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATAtt > 2:2289803/1‑100 (MQ=255) cacaACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTa < 2:2406178/100‑1 (MQ=255) acaacgCTGGCTGGAGCAATCGGTAGAGAATGTTGGTTATGACAATGTATTCATTAATTGCGAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAttatttatttat > 2:1099807/1‑100 (MQ=255) acaacaCTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTAt > 2:1398337/1‑100 (MQ=255) caacaCTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATc > 2:2018230/1‑100 (MQ=255) caacaCTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATc < 2:3881960/100‑1 (MQ=255) acTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtt < 1:1479002/100‑1 (MQ=255) cTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAACGAATAGCCCGGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGttt < 2:3484644/100‑1 (MQ=255) tGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGtttt < 1:56502/100‑1 (MQ=255) gCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTa > 2:4574652/1‑100 (MQ=255) gCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTa > 2:2375930/1‑100 (MQ=255) gCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTa > 1:1333750/1‑100 (MQ=255) gCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTa > 2:3797862/1‑100 (MQ=255) gCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTa > 1:1014307/1‑100 (MQ=255) gCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTa > 2:1792214/1‑100 (MQ=255) ccTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAg > 1:4975774/1‑100 (MQ=255) ccTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAg < 2:145838/100‑1 (MQ=255) ccTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAg < 1:3003768/100‑1 (MQ=255) tGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTa > 1:3402517/1‑100 (MQ=255) tGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTa > 2:2943776/1‑100 (MQ=255) aaaCAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAAt < 1:4101583/100‑1 (MQ=255) cAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAAtttn < 1:4436222/100‑2 (MQ=255) aaTCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTaa > 2:3604386/1‑100 (MQ=255) tCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAAt < 2:5317535/100‑1 (MQ=255) gATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATcc > 2:4344795/1‑100 (MQ=255) gATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATcc > 1:2650864/1‑100 (MQ=255) gATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATcc < 2:589451/100‑1 (MQ=255) gATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATcc < 2:1000872/100‑1 (MQ=255) aaaGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAt > 1:4845603/1‑100 (MQ=255) aaGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGCATAACCCAGTTGCTATTTAGAAAATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAta > 1:3337877/1‑100 (MQ=255) aaGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAta > 1:1526455/1‑100 (MQ=255) aaGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAta < 1:2811233/100‑1 (MQ=255) gAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaat < 2:82312/100‑1 (MQ=255) tatGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaattaa < 2:1474359/100‑1 (MQ=255) tatGATTTATTACAATGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaattaa < 1:5498527/100‑1 (MQ=255) atGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCAtaattaat > 2:3394322/1‑100 (MQ=255) tGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATNTATANTTATCAGNTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtg < 1:3527500/100‑1 (MQ=255) gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt > 2:4842018/1‑100 (MQ=255) gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt < 1:2313349/100‑1 (MQ=255) gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt > 2:3240337/1‑100 (MQ=255) gATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAAtgt < 1:2563694/100‑1 (MQ=255) ttattaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAGATCCCATAATTAATGTGaa < 2:5033646/100‑1 (MQ=255) attaCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTACTTTAAATCCCATAATTAATGTGAata > 1:2068396/1‑100 (MQ=255) taCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata > 2:4078742/1‑100 (MQ=255) taCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatata < 2:5465449/100‑1 (MQ=255) aCAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAatatat > 2:1763950/1‑100 (MQ=255) cAATGTAATTATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAAtatata < 2:2113868/100‑1 (MQ=255) cAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAAtatata < 1:2931831/100‑1 (MQ=255) tGTAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACaa > 2:427505/1‑100 (MQ=255) tAATCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAata < 1:669772/100‑1 (MQ=255) aaTCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAatat < 2:713579/100‑1 (MQ=255) tCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATAttt > 2:271075/1‑100 (MQ=255) tCATTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATAttt < 2:2602394/100‑1 (MQ=255) aTTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATAttttt > 1:5392596/1‑100 (MQ=255) aTTAAGTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATAttttt < 1:2172276/100‑1 (MQ=255) ttAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTa < 2:1066287/100‑1 (MQ=255) ttAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTa < 2:2875808/100‑1 (MQ=255) aaTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGc > 2:2158129/1‑100 (MQ=255) aTTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGca < 2:5401286/100‑1 (MQ=255) | TAATTAAATATACAACGAATTAACCGCTTGCATAATTAGGCACAACACTGCCTGAAACAATCGATAAAGAATATGATTTATTACAATGTAATCATTAATTGCTAAGGAATAACCCAGTTGCTATTTAGAATATATATTTATCAGTTTTAGTAATTTAAATCCCATAATTAATGTGAATATATACAATATTTTTAGCA > NC_000913/1958174‑1958370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |