Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,127,751 | T→G | E188D (GAA→GAC) | gmd ← | GDP‑D‑mannose dehydratase, NAD(P)‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,127,751 | 0 | T | G | 97.0% | 678.4 / 2.7 | 197 | E188D (GAA→GAC) | gmd | GDP‑D‑mannose dehydratase, NAD(P)‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/3); new base G (81/110); total (84/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ATTGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCGCAT > NC_000913/2127655‑2127845 | atTGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCa < 1:2845635/100‑1 (MQ=255) tGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATg < 1:1381696/100‑1 (MQ=255) tGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATg < 2:3179824/100‑1 (MQ=255) ccGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGt > 2:3622537/1‑100 (MQ=255) cGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGtt < 2:2098939/100‑1 (MQ=255) gTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAag < 1:729420/100‑1 (MQ=255) tACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAaga > 1:1023293/1‑100 (MQ=255) cAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAgaga > 2:4577935/1‑100 (MQ=255) aGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGaa > 1:3918042/1‑100 (MQ=255) aGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGaa < 1:2905535/100‑1 (MQ=255) aGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGACGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGaa > 2:3311314/1‑100 (MQ=255) ggCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGTGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAt > 2:4717196/1‑100 (MQ=255) ggCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAt > 2:3382859/1‑100 (MQ=255) ggCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAt > 2:2261343/1‑100 (MQ=255) gCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAAtt > 1:5562847/1‑100 (MQ=255) cACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTc > 1:3961317/1‑100 (MQ=255) cGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCg < 1:3974451/100‑1 (MQ=255) cGACGCCAGCCCCTGTGCGATGTTGGCGATTGCGCTGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGATGAGAATTCCg < 2:5063304/100‑1 (MQ=255) gACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGt < 1:1517802/100‑1 (MQ=255) gACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGt < 2:4948340/100‑1 (MQ=255) gACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGt < 2:2856033/100‑1 (MQ=255) aCTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGtt < 2:2599492/100‑1 (MQ=255) aCTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGtt > 2:2430308/1‑100 (MQ=255) cTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTa > 1:267801/1‑100 (MQ=255) cTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTa < 1:12623/100‑1 (MQ=255) cTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTa < 2:1874444/100‑1 (MQ=255) tCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTAc < 2:3075637/100‑1 (MQ=255) tCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCCCGGCGCGGGGAGTCATTGTTGAAGAGAATTCCGTTat < 1:3193383/100‑2 (MQ=255) ccAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACa < 1:2510649/100‑1 (MQ=255) cAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAg > 1:3744403/1‑100 (MQ=255) aGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAgg < 2:4846664/100‑1 (MQ=255) gCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGc < 1:4573658/100‑1 (MQ=255) gCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGc > 2:877281/1‑100 (MQ=255) ccccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCg < 2:4096044/100‑1 (MQ=255) cccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCAGCGCGGGGGGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGt < 2:1502961/100‑1 (MQ=255) ccTGGGCTATGGTGGCGATTGCGCGGGGGATTTTGCTGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa < 2:4591216/100‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa < 1:4509361/100‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa > 1:4633282/1‑100 (MQ=255) ccTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTa < 2:2399648/100‑1 (MQ=255) tcggCGATGTTGGCGCCTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACCGGCGTACa < 2:1911286/98‑1 (MQ=255) tGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACa < 1:365028/100‑1 (MQ=255) ggggCGATGGTGGCGGTGTCGCGGCGGATTTTGCGGGGATTGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGACTTCCGTTACGGGCGTACa < 2:5388369/99‑1 (MQ=255) gggCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACAt < 2:4260043/100‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATg < 2:3365518/100‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATg > 2:2710769/1‑100 (MQ=255) gCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGc < 2:3730093/100‑1 (MQ=255) gCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGc < 2:4401862/100‑1 (MQ=255) cGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGcc < 1:4595244/100‑1 (MQ=255) gATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCg < 1:2062769/100‑1 (MQ=255) gTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAg > 1:676961/1‑100 (MQ=255) ttGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAgg < 2:2341641/100‑1 (MQ=255) ttGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAgg < 1:2426262/100‑1 (MQ=255) ggCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGAt < 2:1348765/100‑1 (MQ=255) ggCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGAt > 1:1807638/1‑100 (MQ=255) ggCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGAt > 2:343278/1‑100 (MQ=255) ggCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGAt < 1:3281022/100‑1 (MQ=255) aTTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGCAGGTTTCGCCGCGGCGCGGAGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCAc < 1:4223590/100‑1 (MQ=255) aTTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCAc < 1:2259541/100‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACg < 1:2040372/100‑1 (MQ=255) tGCGCGAGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACgg < 1:3535681/100‑1 (MQ=255) gcgcGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGt < 1:2654857/100‑1 (MQ=255) cgcgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTa < 2:3573873/100‑1 (MQ=255) gcgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAg < 2:2104848/100‑1 (MQ=255) gcgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAg < 2:2677558/100‑1 (MQ=255) gcgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGAATTCACGGTAg < 2:5330975/100‑1 (MQ=255) gcgGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGGCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGGACATGCCGTAGGATTCACGGTAg < 1:2372042/100‑1 (MQ=255) gggTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGtt > 1:1710938/1‑100 (MQ=255) gggTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGtt < 1:2348804/100‑1 (MQ=255) gggTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGCAGGATTCACGGTAGtt < 1:1155327/100‑1 (MQ=255) tGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAAc < 2:3882260/100‑1 (MQ=255) tGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGGACATGACGTAGGATTCACGGTAGTTAAc > 1:5072327/1‑100 (MQ=255) aTTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACgg > 2:296487/1‑100 (MQ=255) ttttGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGt < 1:5258617/100‑1 (MQ=255) gCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCATAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATc > 1:3688157/1‑100 (MQ=255) cGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATcc > 1:442768/1‑100 (MQ=255) cGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATcc > 1:1771573/1‑100 (MQ=255) cGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATcc < 2:3664984/100‑1 (MQ=255) ggTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCCCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAg < 1:4185152/100‑1 (MQ=255) gTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTTCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGt < 2:4984105/100‑1 (MQ=255) gTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGt < 1:2533172/100‑1 (MQ=255) tAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTa < 1:4535691/100‑1 (MQ=255) tAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTa > 1:5398488/1‑100 (MQ=255) aaCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAg > 2:490507/1‑100 (MQ=255) aaCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAg > 1:1044990/1‑100 (MQ=255) aaCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAg > 1:91402/1‑100 (MQ=255) aCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAgg < 2:3925208/100‑1 (MQ=255) aCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAgg < 1:5191625/100‑1 (MQ=255) aCGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAgg < 1:4095567/100‑1 (MQ=255) cGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGc > 1:4271734/1‑100 (MQ=255) gAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCg > 2:4475631/1‑100 (MQ=255) aGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCTGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTa > 1:2114049/1‑100 (MQ=255) ggTTTCGCCGCGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTAc < 1:3342420/100‑1 (MQ=255) tttCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAg > 1:1971563/1‑100 (MQ=255) cgccgcGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACGTGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGttt > 1:4760401/1‑100 (MQ=255) cgccgcGGCGCGGGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGttt < 1:299296/100‑1 (MQ=255) ccgcGGCGCGGCGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACTGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTgg < 1:4920471/100‑1 (MQ=255) cgcggcgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGc > 2:1183585/1‑100 (MQ=255) gcgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGAcc < 1:5386585/100‑1 (MQ=255) cgcggGGAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCg > 2:1049611/1‑100 (MQ=255) ggggAGTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCGCAt < 1:3574984/100‑1 (MQ=255) | ATTGCCGAGGTACAGGCACGACTCCAGCCCCTGGGCGATGTTGGCGATTGCGCGGGTGATTTTGCGGGTAACGAAGGTTTCGCCGCGGCGCGGGGATTCATGGTTGAAGAGAATTCCGTTACAGGCGTACATGCCGTAGGATTCACGGTAGTTAACGGTGATCCAGTAGGCGTACAGTTTGGCGACCGCAT > NC_000913/2127655‑2127845 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |