| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 299,214 | A→C | F574C (TTC→TGC) | paoC ← | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 299,214 | 0 | A | C | 98.0% | 697.9 / 0.6 | 197 | F574C (TTC→TGC) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base C (113/80); total (114/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299117‑299310 | cGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTCCTCTTTGCTCAGTGTTCCGCAtt > 2:1582475/1‑100 (MQ=255) gCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTc > 1:3377879/1‑100 (MQ=255) ccGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCa < 1:3722879/100‑1 (MQ=255) ccGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCa < 2:2934565/100‑1 (MQ=255) ggACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAAt < 2:3939980/100‑1 (MQ=255) gcccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACACAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 1:4609253/99‑1 (MQ=255) aCCCGCACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 2:2465812/100‑1 (MQ=255) aCCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 1:5497560/100‑1 (MQ=255) aCCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 1:3213961/100‑1 (MQ=255) cccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGct > 2:876259/1‑100 (MQ=255) cccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGct > 1:5061615/1‑100 (MQ=255) ccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctc > 1:2105132/1‑100 (MQ=255) cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 1:3065643/1‑100 (MQ=255) ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTcc > 2:4362387/1‑100 (MQ=255) ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTcc < 2:1763746/100‑1 (MQ=255) tctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCg < 1:2841487/100‑1 (MQ=255) ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCga > 2:2814437/1‑99 (MQ=255) ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGc < 1:4967114/100‑1 (MQ=255) ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGc < 1:4074437/100‑1 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCgaga > 1:1624681/1‑97 (MQ=255) cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTg < 2:3553351/100‑1 (MQ=255) cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGTCAAAGGTCGACTCCTGCTACTCTTTGCTCATTGTTTCGCATTCAATGCTCGCTTCCGCTGTc > 2:1090375/1‑100 (MQ=255) cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTc < 2:596316/100‑1 (MQ=255) cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTc < 2:170373/100‑1 (MQ=255) tCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAg < 1:5567251/100‑1 (MQ=255) cgcgCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGt > 1:1845500/1‑100 (MQ=255) gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTg < 2:2917738/100‑1 (MQ=255) gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTg > 1:2674510/1‑100 (MQ=255) tGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgc > 2:2226228/1‑100 (MQ=255) gCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc > 2:4844028/1‑100 (MQ=255) gCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc < 2:3844054/100‑1 (MQ=255) cACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCt > 2:2650743/1‑100 (MQ=255) cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTgn < 1:1497140/100‑2 (MQ=255) aCCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTgg > 1:514696/1‑100 (MQ=255) ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc > 2:1190208/1‑100 (MQ=255) ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc < 1:2249357/100‑1 (MQ=255) cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt < 1:314619/100‑1 (MQ=255) cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt < 1:4565627/100‑1 (MQ=255) tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 1:48833/1‑100 (MQ=255) tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 1:2652883/1‑100 (MQ=255) ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 2:3086874/1‑100 (MQ=255) ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 1:1121367/1‑100 (MQ=255) ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 1:2977278/1‑100 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:1483590/100‑1 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:2529323/100‑1 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:2072025/100‑1 (MQ=255) cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:278940/100‑1 (MQ=255) acaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCAt > 1:494240/1‑100 (MQ=255) acaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCAt < 1:4163289/100‑1 (MQ=255) aaaaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGGTCAGTGTTACGCATTCAATGCTCTCTTACGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGt < 1:5180484/100‑1 (MQ=255) aaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAg < 1:1320095/100‑1 (MQ=255) gCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGt > 1:3189573/1‑100 (MQ=255) ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCCTGTAGCGTgg > 2:3010163/1‑100 (MQ=255) ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg < 2:428455/100‑1 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:48311/100‑1 (MQ=255) cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:3144778/100‑1 (MQ=255) ggCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcg > 1:2433334/1‑100 (MQ=255) ggCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcg < 2:3414950/100‑1 (MQ=255) gCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcgc > 1:1214552/1‑100 (MQ=255) cAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCt > 1:3294833/1‑100 (MQ=255) aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt > 1:3236002/1‑100 (MQ=255) aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt > 2:504999/1‑100 (MQ=255) tctgTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc < 1:5272815/97‑1 (MQ=255) aGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCg < 1:238938/100‑1 (MQ=255) aGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCg < 1:520981/100‑1 (MQ=255) ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 1:3509990/100‑1 (MQ=255) ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 2:4722619/100‑1 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:6479/100‑1 (MQ=255) gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:4801794/1‑100 (MQ=255) tCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGt < 1:1044501/100‑1 (MQ=255) gACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAc > 2:2017659/1‑100 (MQ=255) ctgctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCCATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCg < 2:1435745/100‑1 (MQ=255) gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt > 1:3737316/1‑100 (MQ=255) gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt > 1:191970/1‑100 (MQ=255) ctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg > 2:4823844/1‑100 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 1:2711743/100‑1 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 2:1802015/100‑1 (MQ=255) tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 2:3346497/100‑1 (MQ=255) ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt > 2:2311515/1‑100 (MQ=255) ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt < 2:3681985/100‑1 (MQ=255) tACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTaa > 1:2912115/1‑100 (MQ=255) tACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTaa > 1:355983/1‑100 (MQ=255) ctctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATc > 1:847864/1‑100 (MQ=255) ctctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATc > 2:1632681/1‑100 (MQ=255) tctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCt < 2:3833703/100‑1 (MQ=255) tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg < 2:2728119/100‑1 (MQ=255) tGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGcg < 1:2039509/100‑2 (MQ=255) gCTCGGTGTTCCGCCTTCCCTGCTCTCTTACGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCg < 2:251867/100‑1 (MQ=255) tCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTc < 1:2649819/100‑1 (MQ=255) cAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCg > 1:3948873/1‑100 (MQ=255) aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 2:4043802/100‑1 (MQ=255) aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 1:4933278/100‑1 (MQ=255) gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCTGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 2:5115879/1‑100 (MQ=255) gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 2:201957/1‑100 (MQ=255) gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 1:3727444/1‑100 (MQ=255) gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 2:659521/1‑100 (MQ=255) gtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCaa > 1:2008051/1‑100 (MQ=255) tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 1:1903741/1‑100 (MQ=255) tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc < 1:763987/100‑1 (MQ=255) ccGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGTGTGGCGCTTCGGGTACGGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAACCt > 2:1103011/1‑100 (MQ=255) | ACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299117‑299310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |