| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,318,639 | A→C | F413C (TTT→TGT) | rcsC ← | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,318,639 | 0 | A | C | 98.9% | 640.3 / ‑1.9 | 179 | F413C (TTT→TGT) | rcsC | hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (83/94); total (84/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
ATCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACAAAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTAAAA > NC_000913/2318542‑2318735 | aTCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACacaa < 2:1686564/100‑1 (MQ=255) naccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTg > 1:5200371/2‑100 (MQ=255) caccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTg > 2:562149/1‑100 (MQ=255) caccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTg < 2:475584/100‑1 (MQ=255) caccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTg > 2:2198768/1‑100 (MQ=255) caccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTg < 1:2437201/100‑1 (MQ=255) accaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGa > 2:3386411/1‑100 (MQ=255) ccaGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGAc > 1:567478/1‑100 (MQ=255) caGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGAcc < 2:5050954/100‑1 (MQ=255) cacaAATGGGGAGGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGTACGAAGCTGCTTTGCAGATTGGTATTGTTTCTGGTCAGGGCATCTACACAGTTGACctgctg > 2:5381680/1‑100 (MQ=255) cacaAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACctgctg > 2:3722192/1‑100 (MQ=255) aaTGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCca > 2:645217/1‑100 (MQ=255) aTGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCcac < 2:3957954/100‑1 (MQ=255) tGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCcaca < 1:1011796/100‑1 (MQ=255) gCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGa < 1:4101580/100‑1 (MQ=255) gCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGa > 1:3642679/1‑100 (MQ=255) ccACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGAt > 1:3002503/1‑100 (MQ=255) cACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATa < 1:5256607/100‑1 (MQ=255) cACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATa > 1:3883753/1‑100 (MQ=255) gTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAAtt > 2:4679795/1‑100 (MQ=255) tttCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTg < 1:979554/100‑1 (MQ=255) tttCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTg < 2:2116032/100‑1 (MQ=255) ttCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGc < 1:4517866/100‑1 (MQ=255) tCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTTCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCg > 2:3093913/1‑100 (MQ=255) cATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGt > 2:1620234/1‑100 (MQ=255) cATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGt > 1:1632574/1‑100 (MQ=255) nttACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTc > 2:4653577/2‑100 (MQ=255) aTTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTc > 2:1184572/1‑100 (MQ=255) tACGATAGCGCGATTGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTAGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAg < 1:5024636/100‑1 (MQ=255) aCGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGt < 2:1846920/100‑1 (MQ=255) cGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTc > 2:2883356/1‑100 (MQ=255) gATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCg > 1:347339/1‑100 (MQ=255) aTAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGt > 1:4238638/1‑100 (MQ=255) gcgcGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTgg > 1:3326838/1‑100 (MQ=255) gcgcGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTgg < 2:2190435/100‑1 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc < 1:625637/100‑1 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc > 2:1384777/1‑100 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc < 2:3533316/100‑1 (MQ=255) cgcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGc > 2:3675540/1‑100 (MQ=255) gcgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCg < 2:2024838/100‑1 (MQ=255) cgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCgg > 2:3505948/1‑100 (MQ=255) cgAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCgg < 1:2231008/100‑1 (MQ=255) gAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGt < 1:3531224/100‑1 (MQ=255) aTGGACGAAGCTCATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTcc > 2:175915/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTAATGTTGCCGGTCATTACGTCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCt < 2:5247353/100‑1 (MQ=255) aaGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCg < 2:4200045/100‑1 (MQ=255) aGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGt > 2:2450811/1‑100 (MQ=255) cTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTaa > 2:1959940/1‑100 (MQ=255) aTTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCa > 1:3985779/1‑100 (MQ=255) ttGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCata < 2:1135802/100‑1 (MQ=255) tGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCatat < 1:4700614/100‑1 (MQ=255) gCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATAtt > 2:2667138/1‑100 (MQ=255) cAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTg > 1:5005303/1‑100 (MQ=255) cAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTg < 1:1778436/100‑1 (MQ=255) aGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTga < 1:2877754/100‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTgag < 1:527400/100‑1 (MQ=255) gATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTgag > 1:1192939/1‑100 (MQ=255) gATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTgag > 2:2362196/1‑100 (MQ=255) ttGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGAt > 2:3288506/1‑100 (MQ=255) ttGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGAt < 2:3144991/100‑1 (MQ=255) tGGTATTGTTGCTGGTCATGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGCCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATa > 2:1018768/1‑100 (MQ=255) tGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATa > 2:4496214/1‑100 (MQ=255) ggTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAg > 1:1296758/1‑100 (MQ=255) ggTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAg > 2:481263/1‑100 (MQ=255) ggTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAg < 1:1396981/100‑1 (MQ=255) gTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAgn < 1:4434165/100‑2 (MQ=255) gTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAgg > 2:5162002/1‑100 (MQ=255) gTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAgg < 1:1672128/100‑1 (MQ=255) tATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGt < 2:1032800/100‑1 (MQ=255) aTTGTTGCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTa < 2:4935578/100‑1 (MQ=255) ttgttgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTAt < 1:4286958/100‑1 (MQ=255) tgttgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATg > 1:1616434/1‑100 (MQ=255) tgttgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATg < 1:4566677/100‑1 (MQ=255) gttgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATgc > 2:372777/1‑100 (MQ=255) gttgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATgc > 2:3914362/1‑100 (MQ=255) tgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATgcgc > 1:1596154/1‑100 (MQ=255) tgCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATgcgc > 1:2116564/1‑100 (MQ=255) gCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGcc < 1:4154469/100‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGcc > 1:124107/1‑100 (MQ=255) cTGGTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCa > 2:2355118/1‑100 (MQ=255) ggTCAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGt > 2:2222081/1‑100 (MQ=255) cAGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCg > 1:3431152/1‑100 (MQ=255) aGGACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGt < 2:2005662/100‑1 (MQ=255) ggACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGtt < 1:722857/100‑1 (MQ=255) ggACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGtt < 2:3848223/100‑1 (MQ=255) ggACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGtt < 1:2221405/100‑1 (MQ=255) ggACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGtt < 1:237187/100‑1 (MQ=255) gACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTa < 2:728129/100‑1 (MQ=255) gACATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTa < 1:3783002/100‑1 (MQ=255) aCATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTAc < 2:1576683/100‑1 (MQ=255) cATCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACt > 1:3543256/1‑100 (MQ=255) aTCAACACAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATGTTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACtt > 2:2960065/1‑100 (MQ=255) caacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaa > 2:2312540/1‑100 (MQ=255) caacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaa > 1:3627249/1‑100 (MQ=255) aacacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaa < 1:788759/100‑1 (MQ=255) aacacAATTGACCTGCTGCCCACACATAATTTGCGTCAGTCGTTGTCGGTCCTCATGCGTCAGCATATTGAGAAAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaac > 2:4542733/1‑99 (MQ=255) acacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaca > 1:5408254/1‑98 (MQ=255) acacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaaa > 2:1637931/1‑100 (MQ=255) acacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaaa > 2:123163/1‑100 (MQ=255) acacAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTaaaa > 1:1034509/1‑100 (MQ=255) | ATCCACCAGCACACAAATGGCCACGTTTTCATTACGATAGCGCGAATGGACGAAGCTGATTTGCAGATTGGTATTGTTGCTGGTCAGGACATCAACAAAATTGACCTGCTGCCCACAGATAATTTGCGTCAGTCGTTGGCGGTCCTCATGCGTAAGCATATTGAGATAGGTATGCGCCAGTTCGTTACTTAAAA > NC_000913/2318542‑2318735 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |