| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,438,864 | T→G | R89S (AGA→AGC) | zntR ← | zntA gene transcriptional activator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,438,864 | 0 | T | G | 99.0% | 720.6 / ‑5.5 | 201 | R89S (AGA→AGC) | zntR | zntA gene transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base G (103/96); total (103/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CTGCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAATCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAACC > NC_000913/3438769‑3438959 | cTGCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCttt > 2:1898658/1‑100 (MQ=255)cTGCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCttt > 2:1928061/1‑100 (MQ=255)cTGCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCttt > 2:446241/1‑100 (MQ=255) gCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTcc < 1:4055362/100‑1 (MQ=255) gCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTcc < 1:356788/100‑1 (MQ=255) gCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTcc > 2:2553596/1‑100 (MQ=255) gCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTcc > 1:2120875/1‑100 (MQ=255) aTGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGc < 1:1949424/100‑1 (MQ=255) tGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGca > 2:500970/1‑100 (MQ=255) gAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGcac < 1:1062642/100‑1 (MQ=255) gAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGcac < 2:5053795/100‑1 (MQ=255) aGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGcaca > 1:5313989/1‑100 (MQ=255) cAGTCCCACAACGGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAAt < 1:4706290/100‑1 (MQ=255) aGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATGCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATg > 2:3514808/1‑100 (MQ=255) gTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGc > 1:4270204/1‑100 (MQ=255) gTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGc > 1:4858654/1‑100 (MQ=255) gTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGc > 1:500849/1‑100 (MQ=255) gTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGc > 2:165637/1‑100 (MQ=255) gTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGc > 2:919300/1‑100 (MQ=255) tCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGcc > 1:2473901/1‑100 (MQ=255) cccACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCt > 1:5192722/1‑100 (MQ=255) ccACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCtt > 1:3345283/1‑100 (MQ=255) ccACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCtt > 2:2289362/1‑100 (MQ=255) cacaACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCttt > 2:5379710/1‑100 (MQ=255) ctacaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTg < 1:951955/98‑1 (MQ=255) caacaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTg < 2:1387588/100‑1 (MQ=255) caacaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTg < 1:1019124/100‑1 (MQ=255) caacaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTg < 2:4053110/100‑1 (MQ=255) aacaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGa < 2:391769/100‑1 (MQ=255) acaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGag > 2:939340/1‑99 (MQ=255) acaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGAc < 1:2863723/100‑1 (MQ=255) acaGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGAc < 1:3166753/100‑1 (MQ=255) cATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTg < 2:758759/100‑1 (MQ=255) cGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACa < 1:323427/100‑1 (MQ=255) cGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACa < 2:3161197/100‑1 (MQ=255) ttAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAgg > 2:4323215/1‑100 (MQ=255) ttAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAgg < 1:416985/100‑1 (MQ=255) ttAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAgg > 1:310646/1‑100 (MQ=255) tAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGt > 1:903087/1‑100 (MQ=255) ggCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATg < 1:1394506/100‑1 (MQ=255) gCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATgg < 1:1734320/100‑1 (MQ=255) gCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATgg < 1:3594991/100‑1 (MQ=255) gTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGgtg > 1:2941987/1‑100 (MQ=255) gTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGgtg > 2:1699035/1‑100 (MQ=255) gTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGgtg < 2:1601883/100‑1 (MQ=255) gTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGgtg > 1:2702495/1‑100 (MQ=255) gCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTc > 1:2837244/1‑100 (MQ=255) gCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTc > 1:5040902/1‑100 (MQ=255) cAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCa > 2:4882152/1‑100 (MQ=255) cAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCa < 1:2527368/100‑1 (MQ=255) aaGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAg < 1:632516/100‑1 (MQ=255) gAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGAt > 1:1793815/1‑100 (MQ=255) aaCGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATc > 1:701037/1‑100 (MQ=255) cGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGa > 2:4419806/1‑100 (MQ=255) tGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGc < 2:4559338/100‑1 (MQ=255) tGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGc < 1:3484649/100‑1 (MQ=255) gCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCATGATCGATGCg < 1:4959067/100‑1 (MQ=255) gCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCg < 2:3883552/100‑1 (MQ=255) aCTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATc < 1:1176559/100‑1 (MQ=255) ctctGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCg > 1:3949721/1‑100 (MQ=255) ctctGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCg > 1:4202656/1‑100 (MQ=255) tctGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGa > 1:1079401/1‑100 (MQ=255) tctGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGa > 1:1319682/1‑100 (MQ=255) tGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACa < 1:3447539/100‑1 (MQ=255) tGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACa > 2:4078305/1‑100 (MQ=255) cAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGc > 2:2157716/1‑100 (MQ=255) cAACTCGCCTATCCGTGGTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGc < 1:5116777/100‑1 (MQ=255) ncTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCaa > 1:4425031/2‑100 (MQ=255) cTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAAc < 2:5208963/100‑1 (MQ=255) cTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAAc < 2:2856922/100‑1 (MQ=255) cTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAAc < 2:307727/100‑1 (MQ=255) tCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACt > 1:3738620/1‑100 (MQ=255) cGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTc > 2:3892332/1‑100 (MQ=255) ggCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTGCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTcg < 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gCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGTAACTCGCGGATCGACt > 1:1467296/1‑100 (MQ=255) gCTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACt > 1:236621/1‑100 (MQ=255) cTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTc < 2:1773412/100‑1 (MQ=255) cTTCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTc > 2:2025027/1‑100 (MQ=255) ttCGACTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTcc < 2:3269175/100‑1 (MQ=255) gACTTCCTGCAAGCTTTCATGCACAATCCCTTTTGATTCCTTACAGGCATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCCGACCGACCCCAGa > 1:5025490/1‑100 (MQ=255) aCTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGAc < 2:3420489/100‑1 (MQ=255) cTTCCTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACt > 1:3825967/1‑100 (MQ=255) ccTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGaa < 2:1814398/100‑1 (MQ=255) ccTGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGaa > 1:4564384/1‑100 (MQ=255) cTGCAAGCTTTCCTGGACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCACCTCGCGGATCGACTCCAGACTGaaa > 2:4184894/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAc > 1:744814/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAc > 1:4307506/1‑100 (MQ=255) tGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAc < 1:1098072/100‑1 (MQ=255) tGCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCAGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGGTCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAc > 1:5254370/1‑100 (MQ=255) gCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAcc < 2:2267444/100‑1 (MQ=255) gCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAcc < 2:1206740/100‑1 (MQ=255) gCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAcc > 2:3348248/1‑100 (MQ=255) gCAAGCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAAcc > 1:1580507/1‑100 (MQ=255) | CTGCTATGAGCAGTCCCACAACAGGCATCGTTAAGGCGTTGCAAGGAACGCTGCATACTCTGCAACTCGGCTATCCGTGCTTCGACTTCCTGCAATCTTTCCTGCACAATGCCTTTTGACTCCTGACAGGTATGGTGTTCAGGATCGATGCGGATCGACAGCAACTCGCGGATCGACTCCAGACTGAAACC > NC_000913/3438769‑3438959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |