| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,190,100 | T→G | I105M (ATT→ATG) | yjaZ → | stationary phase growth adaptation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,190,100 | 0 | T | G | 99.4% | 640.6 / NA | 179 | I105M (ATT→ATG) | yjaZ | stationary phase growth adaptation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (92/85); minor base A (1/0); total (94/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
CGCCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATTCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGGAAAA > NC_000913/4190003‑4190195 | gcCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCAt < 2:2806605/100‑1 (MQ=255) gcCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCAt < 1:2410172/100‑1 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc > 1:1047618/1‑100 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc > 2:3435298/1‑100 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc > 1:4751367/1‑100 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc < 1:4031236/100‑1 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc > 1:3802927/1‑100 (MQ=255) tAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGcc < 1:3261663/100‑1 (MQ=255) aaaGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCg > 1:3534681/1‑100 (MQ=255) aaGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCgg > 2:1676473/1‑100 (MQ=255) aGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCggg > 2:1284724/1‑100 (MQ=255) aGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCggg < 1:3542096/100‑1 (MQ=255) aGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCggg < 1:2946988/100‑1 (MQ=255) aaTCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTa < 1:1567645/100‑1 (MQ=255) aaTCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTa < 1:1694157/100‑1 (MQ=255) aTCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTAt > 2:4587033/1‑100 (MQ=255) ctcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATgg > 2:3584909/1‑100 (MQ=255) ctcGTCCCTTCTGCCAGAACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAACGCAAAGTTATGAATGCCGGGTATgg < 2:3898774/100‑1 (MQ=255) tcGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGt < 2:3158901/100‑1 (MQ=255) gTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAg < 1:5524739/100‑1 (MQ=255) tCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGc > 2:5444933/1‑100 (MQ=255) tCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGc < 1:1168649/100‑1 (MQ=255) tCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGc < 2:3436796/100‑1 (MQ=255) tGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCg > 1:2733948/1‑100 (MQ=255) gCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGt > 2:1843767/1‑100 (MQ=255) gCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGt > 2:4723297/1‑100 (MQ=255) gCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGt > 1:2664302/1‑100 (MQ=255) cACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTg < 1:3134240/100‑1 (MQ=255) ccGTGAGAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGACAGAAAGCAACGTTATACAAGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAg > 2:5182598/1‑100 (MQ=255) cGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAgg < 2:4380256/100‑1 (MQ=255) cGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAgg < 1:1886003/100‑1 (MQ=255) cGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAgg < 2:4035266/100‑1 (MQ=255) cGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAgg < 2:3768028/100‑1 (MQ=255) cGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAgg < 1:5241248/100‑1 (MQ=255) gTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGt > 2:4848981/1‑100 (MQ=255) ttATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTg > 2:2242660/1‑100 (MQ=255) ttATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTg < 1:717510/100‑1 (MQ=255) ttATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAAATATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTg < 2:5500809/100‑1 (MQ=255) tataACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTgg > 2:141631/1‑100 (MQ=255) ataACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGa > 2:2585010/1‑100 (MQ=255) taACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGAc > 2:2190216/1‑100 (MQ=255) taACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGAc < 2:2386712/100‑1 (MQ=255) taACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGAc > 2:3934184/1‑100 (MQ=255) aaCTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACt < 1:3439675/100‑1 (MQ=255) aCTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACtt > 1:4697886/1‑100 (MQ=255) aCTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACtt < 2:4441649/100‑1 (MQ=255) cTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTa < 1:1005648/100‑1 (MQ=255) aGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGAc < 1:496132/100‑1 (MQ=255) cgcACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACggag > 1:5147699/1‑100 (MQ=255) gcACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACggagg < 1:2910074/100‑1 (MQ=255) acacacTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGgaggag > 2:3303975/1‑100 (MQ=255) acacacTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGgaggag > 1:3172601/1‑100 (MQ=255) cacTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATa < 2:1561167/100‑1 (MQ=255) cacTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATACCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATa > 1:3639892/1‑100 (MQ=255) cTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCTTGCCGGGAATGGGAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAg > 2:755726/1‑100 (MQ=255) tAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGc > 2:3725630/1‑100 (MQ=255) aaaaaGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCa > 2:2949527/1‑100 (MQ=255) aGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCAtttt < 1:2042577/100‑1 (MQ=255) ccaTTTTGGCGCTCCAAGACAGCAACATTATGCATGGCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGCTTGAGGCGGTCTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACtt < 2:5262835/98‑1 (MQ=255) cTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACtt > 2:133517/1‑100 (MQ=255) cTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACtt < 2:1761974/100‑1 (MQ=255) tATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACttt > 2:1950285/1‑100 (MQ=255) tATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACttt > 1:5074897/1‑100 (MQ=255) aTTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttg < 1:3745068/100‑1 (MQ=255) ttttGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttgn < 2:204837/100‑2 (MQ=255) tttGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttgtt > 2:5001064/1‑100 (MQ=255) ttGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttgttg < 2:2764121/100‑1 (MQ=255) ttGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTttgttg < 2:3784072/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGc > 1:838763/1‑100 (MQ=255) tGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGc < 1:3209866/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGc > 1:3953070/1‑100 (MQ=255) cgcTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGtt < 1:2531350/100‑1 (MQ=255) cgcTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGtt > 1:2672976/1‑100 (MQ=255) cgcTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGtt > 1:3886339/1‑100 (MQ=255) cTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCa > 2:3127405/1‑100 (MQ=255) cTGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCa < 2:334334/100‑1 (MQ=255) cTGCCAGAAAGCAACGTTACGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCa < 1:4663711/100‑1 (MQ=255) tGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAg < 1:130469/100‑1 (MQ=255) tGCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAg < 1:2005440/100‑1 (MQ=255) gCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAgg < 1:4379199/100‑1 (MQ=255) gCCAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAgg > 1:1467218/1‑100 (MQ=255) ccAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAggg > 2:1543153/1‑100 (MQ=255) cAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGc < 1:1797650/100‑1 (MQ=255) cAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGc > 1:4821941/1‑100 (MQ=255) cAGAAAGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGc > 1:1732320/1‑100 (MQ=255) cAGAAAGCAACGTTATCCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGc > 1:4877296/1‑100 (MQ=255) aaGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTc > 2:5061792/1‑100 (MQ=255) aaGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTc > 2:5389218/1‑100 (MQ=255) aGCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCa > 2:1999078/1‑100 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg > 2:420411/1‑100 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg > 2:1031928/1‑100 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg < 1:3334908/100‑1 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg > 2:593122/1‑100 (MQ=255) gCAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAg > 1:2219251/1‑100 (MQ=255) cAACGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAgg > 2:4765029/1‑100 (MQ=255) aaCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAggg < 2:3073260/100‑1 (MQ=255) aCGTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGGGGTGGACTTAGTCGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGga < 1:4183455/100‑1 (MQ=255) gTTATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaa > 1:4535624/1‑100 (MQ=255) ttATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaaa < 2:3850797/100‑1 (MQ=255) ttATGCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGgaaaa < 2:933944/100‑1 (MQ=255) | CGCCTAAAGAATCTCGTCCCTTCTGCCAGCACCGTTATAACTTAGCGCGCACACACTTAAAAAGAACTATTTTGGCGCTGCCAGAAAGCAACGTTATTCATGCCGGGTATGGTAGCTATGCCGTGATTGAGGTGGACTTAGACGGAGGAGATAAGGCATTTTACTTTGTTGCGTTCAGGGCTTTCAGGGAAAA > NC_000913/4190003‑4190195 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |