| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,291,339 | T→G | I288M (ATT→ATG) | nrfD → | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,291,339 | 0 | T | G | 96.9% | 781.4 / 8.0 | 229 | I288M (ATT→ATG) | nrfD | formate‑dependent nitrite reductase, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/3); new base G (114/107); total (119/110) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAA > NC_000913/4291242‑4291432 | gCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGcc < 2:1099672/100‑1 (MQ=255)gCGGTTTCGGGACGTGGTGGTTCTGGCTGGGTGGCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGcc < 1:183255/100‑1 (MQ=255) cGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCt > 1:371268/1‑100 (MQ=255) cGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCt < 2:1223527/100‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTg < 1:3141326/100‑1 (MQ=255) tttCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCAtgcctgcc < 2:3684820/100‑1 (MQ=255) cTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTg < 1:5390932/100‑1 (MQ=255) cTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTg > 2:2031403/1‑100 (MQ=255) tGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGc < 1:1867684/100‑1 (MQ=255) ggACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCt > 1:1652011/1‑100 (MQ=255) gACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTg > 2:1742412/1‑100 (MQ=255) gACGTGGTGGTTCTGGCCTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAAAGCTGCTCAAAACGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGTCTGCCCTGCtc > 2:3005393/1‑99 (MQ=255) cGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggc > 2:4288672/1‑100 (MQ=255) cGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggc < 1:2226357/100‑1 (MQ=255) gtggtgGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcg < 1:1081733/100‑1 (MQ=255) tggtggTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcgg < 1:388555/100‑1 (MQ=255) ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcggc > 1:2764938/1‑100 (MQ=255) ggtggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTggcggc > 2:2636429/1‑100 (MQ=255) ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:847639/100‑1 (MQ=255) ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:688294/100‑1 (MQ=255) ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 2:477392/1‑100 (MQ=255) ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg < 1:3654821/100‑1 (MQ=255) ggtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtg > 1:3541292/1‑100 (MQ=255) gtTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCgtgt < 2:4128958/100‑1 (MQ=255) cTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTggg > 1:5054439/1‑100 (MQ=255) cTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTggg > 2:3032796/1‑100 (MQ=255) tGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTgggg < 1:2042515/100‑1 (MQ=255) cTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCa > 1:4638932/1‑100 (MQ=255) cTTGGTGTCACCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCa > 2:2880312/1‑100 (MQ=255) tGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGt > 1:1162974/1‑100 (MQ=255) tGGTGTCGCCGGGCTGGGACTGATTGGGGCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGTCAGt < 2:4656543/100‑1 (MQ=255) ggTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTc < 1:2581042/100‑1 (MQ=255) gtgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGtgt > 2:108300/1‑98 (MQ=255) tgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTg > 1:1764184/1‑100 (MQ=255) tgtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTg > 1:3936796/1‑100 (MQ=255) gtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTgg > 1:1115924/1‑100 (MQ=255) gtCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTgg > 1:2720734/1‑100 (MQ=255) cGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTc > 2:2145048/1‑100 (MQ=255) cGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTc < 1:4164704/100‑1 (MQ=255) cGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTc > 1:2861411/1‑100 (MQ=255) gCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCg < 1:5307269/100‑1 (MQ=255) gggctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCg < 2:490602/100‑1 (MQ=255) gggctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCg < 1:2394546/100‑1 (MQ=255) ggctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCgt > 1:5519415/1‑100 (MQ=255) gctggggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCgtg < 2:4719383/100‑1 (MQ=255) ggggctgCTTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTGCCGGCATGGCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTg < 2:3138323/100‑1 (MQ=255) gggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGa < 1:3033684/100‑1 (MQ=255) ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt < 2:628139/100‑1 (MQ=255) ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt > 2:1323513/1‑100 (MQ=255) ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt > 1:2534924/1‑100 (MQ=255) ggctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGCGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAt > 2:2849581/1‑100 (MQ=255) ctgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgc > 1:4226728/1‑100 (MQ=255) tgATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgct < 1:320419/100‑1 (MQ=255) gATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgctg > 2:2928293/1‑100 (MQ=255) aTTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGAtgctgc < 2:258278/100‑1 (MQ=255) tgtgCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTgcgc > 2:3427564/1‑100 (MQ=255) gtgCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCt < 2:2802424/100‑1 (MQ=255) tgCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCtt < 1:3269104/100‑1 (MQ=255) gCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttt < 2:1266851/100‑1 (MQ=255) gCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttt < 1:1131041/100‑1 (MQ=255) cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt > 1:557938/1‑100 (MQ=255) cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt > 2:2110147/1‑100 (MQ=255) cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt < 1:4996288/100‑1 (MQ=255) cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt < 1:1893390/100‑1 (MQ=255) cAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCttttt < 1:4712171/100‑1 (MQ=255) aaTGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTc < 1:4881415/100‑1 (MQ=255) aTGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCa > 1:1349971/1‑100 (MQ=255) gctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCAtt > 2:355054/1‑100 (MQ=255) cgatctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCAtt < 1:1530483/96‑1 (MQ=255) ctgctCGAACCGGGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGGCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc < 2:2499977/100‑1 (MQ=255) ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc > 2:713261/1‑100 (MQ=255) ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc < 2:3972712/100‑1 (MQ=255) ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc < 1:4401760/100‑1 (MQ=255) ctgctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtc > 1:557045/1‑100 (MQ=255) tgctCAAACCGTGGGTCAATCGCCGTTGCGGCATGCCTGCCGTCCTGGCAAGATGTGGTGCCACTCTGTTCGGCGTGTTTATGCTGCTCTTTTACATtct < 2:1029993/100‑1 (MQ=255) gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtctc > 1:1042906/1‑100 (MQ=255) gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtctc > 1:3332007/1‑100 (MQ=255) gctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATtctc > 1:3820078/1‑100 (MQ=255) ctCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTctct > 2:4326124/1‑100 (MQ=255) tCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTa > 2:3369380/1‑100 (MQ=255) cAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTAc > 2:1934974/1‑100 (MQ=255) aaCCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATACCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGc > 2:5086737/1‑100 (MQ=255) ccGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTATGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCg < 1:923473/100‑1 (MQ=255) cGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCgg < 1:4296262/100‑1 (MQ=255) cGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCgg > 2:4193707/1‑100 (MQ=255) tGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGGCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGACGCTGCGCGGTTTCATTCTCTACGCCGGAc < 2:3754190/100‑1 (MQ=255) tGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGAc < 2:1983823/100‑1 (MQ=255) tGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGACGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGan < 1:4446762/100‑2 (MQ=255) gggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACa > 2:5222164/1‑100 (MQ=255) ggTCAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGCCAg > 1:2063407/1‑100 (MQ=255) cAATCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTg > 1:2952527/1‑100 (MQ=255) aTCGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGAc > 1:3299171/1‑100 (MQ=255) cGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACgg < 2:1186107/100‑1 (MQ=255) cGCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACgg > 2:1500650/1‑100 (MQ=255) tctgTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGt < 1:1422846/97‑1 (MQ=255) gCAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGt > 1:5228317/1‑100 (MQ=255) cAGTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTg > 2:604027/1‑100 (MQ=255) gTTCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGtaga > 2:1404110/1‑97 (MQ=255) ttCCGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCg < 1:2167682/100‑1 (MQ=255) ccGGCATGCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTa < 2:1864784/100‑1 (MQ=255) | GCGGTTTCTGGACGTGGTGGTTCTGGCTTGGTGTCGCCGGGCTGGGGCTGATTGTGCCAATGCTGCTCAAACCGTGGGTCAATCGCAGTTCCGGCATTCCTGCCGTGCTGGCGGCGTGTGGGGCCAGTCTGGTCGGCGTGTTGATGCTGCGCTTTTTCATTCTCTACGCCGGACAGTTGACGGTGGCGTAA > NC_000913/4291242‑4291432 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |