| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,291,923 | A→C | I138L (ATC→CTC) | nrfE → | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,291,923 | 0 | A | C | 99.5% | 726.0 / ‑4.2 | 201 | I138L (ATC→CTC) | nrfE | heme lyase (NrfEFG) for insertion of heme into c552, subunit NrfE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (92/108); total (92/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-01 | |||||||||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGC > NC_000913/4291827‑4292017 | ccGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCg < 1:4884372/100‑1 (MQ=255) cGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGa > 1:2905350/1‑100 (MQ=255) cTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAg > 2:863154/1‑100 (MQ=255) cTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAg < 2:5314323/100‑1 (MQ=255) tGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAgg < 1:3405487/100‑1 (MQ=255) gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGc < 1:1227576/100‑1 (MQ=255) gACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGc < 1:1920844/100‑1 (MQ=255) aGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCTCTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAt < 1:543907/100‑1 (MQ=255) aGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAt < 2:2674183/100‑1 (MQ=255) gCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAtc < 1:1314697/100‑1 (MQ=255) gCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAtc > 1:606797/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAtct > 1:4309510/1‑100 (MQ=255) gTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCa < 2:2295352/100‑1 (MQ=255) ttttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCaa > 1:3474356/1‑100 (MQ=255) ttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATc < 2:582581/100‑1 (MQ=255) ttATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATc < 2:3240014/100‑1 (MQ=255) tgtctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCGCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATcc < 2:5472859/98‑1 (MQ=255) tATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATcc < 1:3757174/100‑1 (MQ=255) tATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCAACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATcc > 1:5305189/1‑100 (MQ=255) ctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGGTCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAt > 2:1181203/1‑100 (MQ=255) ctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAt < 2:1494778/100‑1 (MQ=255) ctctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCCTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAt < 1:1146837/100‑1 (MQ=255) tctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtg > 2:5263144/1‑100 (MQ=255) tctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtg < 1:2142103/100‑1 (MQ=255) ctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgc < 2:3123377/100‑1 (MQ=255) ctcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgc > 1:1623099/1‑100 (MQ=255) tcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct > 2:472031/1‑100 (MQ=255) tcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct < 2:2998337/100‑1 (MQ=255) tcATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgct > 1:1701724/1‑100 (MQ=255) aTGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAtgctgc > 1:3566478/1‑100 (MQ=255) tGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCa > 1:10932/1‑100 (MQ=255) gCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCaa > 2:4792986/1‑100 (MQ=255) gCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCaa > 2:4271933/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCaan < 1:1391879/100‑2 (MQ=255) cTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAAc > 2:1715230/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAAc > 2:4473795/1‑100 (MQ=255) gccgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATc > 1:2293801/1‑100 (MQ=255) gccgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATc > 1:1688007/1‑100 (MQ=255) ccgcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATcc > 2:1710765/1‑100 (MQ=255) gcACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCg > 1:4087638/1‑100 (MQ=255) gcctccTACTGTTGGTGGGGCTGGGGTCGGTTCCCTACCTGCGGGTCTTTCCCCCGGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCgg < 2:4962117/95‑1 (MQ=255) cACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCgg < 1:964586/100‑1 (MQ=255) cACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCgg < 2:3513511/100‑1 (MQ=255) gCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCtt > 2:2569373/1‑100 (MQ=255) cTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTa < 1:1458265/100‑1 (MQ=255) cTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGAGGCCGCAACATCCCGGCCTTa > 2:1924295/1‑100 (MQ=255) aCTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATc > 2:1785365/1‑100 (MQ=255) cTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCt > 2:5382/1‑100 (MQ=255) tGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCtt < 1:1548995/100‑1 (MQ=255) tGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCtt < 1:3271693/100‑1 (MQ=255) gTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCttt > 1:1516000/1‑100 (MQ=255) gTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCttt > 1:4375483/1‑100 (MQ=255) tttGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTc < 1:564121/100‑1 (MQ=255) tttGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTc < 2:3533508/100‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCAt < 2:3998129/100‑1 (MQ=255) gtggtgCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATc > 2:491829/1‑100 (MQ=255) tgCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCAcc > 1:4811216/1‑100 (MQ=255) cTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgc < 1:3314329/100‑1 (MQ=255) cTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgc < 1:1302891/100‑1 (MQ=255) cTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgc > 1:843463/1‑100 (MQ=255) tgtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGGACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgct > 2:2037089/1‑100 (MQ=255) tgtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgct > 1:3861070/1‑100 (MQ=255) tgtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgct < 1:1485425/100‑1 (MQ=255) gtgGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctg > 2:654799/1‑100 (MQ=255) ggTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctgct > 2:3684182/1‑100 (MQ=255) ggTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCgctgct < 1:5527238/100‑1 (MQ=255) gTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCtt > 1:655589/1‑100 (MQ=255) gTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAACACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCtt > 1:889961/1‑100 (MQ=255) tCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCttt > 1:2240586/1‑100 (MQ=255) ccGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 1:2088119/100‑1 (MQ=255) ccGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 2:2830898/100‑1 (MQ=255) ccGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTa < 1:5415544/100‑1 (MQ=255) gATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTAcc > 1:1861752/1‑100 (MQ=255) aTCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCt < 1:2637763/100‑1 (MQ=255) tCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCtt < 2:2781402/100‑1 (MQ=255) tCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGAGCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCtt > 1:4747753/1‑100 (MQ=255) ccTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTgg < 1:34420/100‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTgg < 1:727964/100‑1 (MQ=255) ccTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTgg < 2:221831/100‑1 (MQ=255) cTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGc < 2:1372285/100‑1 (MQ=255) cTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGc < 2:2243590/100‑1 (MQ=255) cGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTAt < 1:3053999/100‑1 (MQ=255) cGTGCGGATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTAt < 1:27006/100‑1 (MQ=255) ggATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCgg > 2:769084/1‑100 (MQ=255) ggATATTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCgg < 2:2542480/100‑1 (MQ=255) ggATATTACCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATGCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCgg < 2:5115906/100‑1 (MQ=255) tatTTCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGttt > 1:3054601/1‑100 (MQ=255) tttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGa > 1:5187438/1‑100 (MQ=255) tttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGa < 2:3558244/100‑1 (MQ=255) tttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTACAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGa > 1:3595148/1‑100 (MQ=255) ttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGAt < 2:1603538/100‑1 (MQ=255) ttCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGAt < 2:3359940/100‑1 (MQ=255) tCCGCCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:1832965/100‑1 (MQ=255) tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 1:1355207/100‑1 (MQ=255) tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:3442088/100‑1 (MQ=255) tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:107433/100‑1 (MQ=255) tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 2:1664544/100‑1 (MQ=255) tCCACCAGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATATTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 1:1730805/100‑1 (MQ=255) tCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATg < 1:399114/100‑1 (MQ=255) caccaGCACTCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGt < 2:2734326/100‑1 (MQ=255) | CCGCTGACGTTAGCCGTTTTATCTCTCATGCTCGCCGCACTGCTACTGTTTGTGGTGCTGTGGTCCGATCCCTTCGTGCGGATATTTCCACCAGCAATCGAAGGCCGCGATCTCAATCCGATGCTGCAACATCCCGGTCTTATCTTTCATCCACCGCTGCTTTACCTTGGCTATGGCGGTTTGATGGTAGC > NC_000913/4291827‑4292017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |