| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,403,148 | A→C | N371H (AAC→CAC) | hflK → | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,403,148 | 0 | A | C | 99.6% | 850.5 / NA | 238 | N371H (AAC→CAC) | hflK | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (130/107); total (130/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGG > NC_000913/4403050‑4403244 | cccGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATaa > 2:2974361/1‑100 (MQ=255) cGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACg > 1:2229725/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACgg > 2:690232/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACgg > 2:2918904/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGAAACCTGATGGTTCTGACGTTAGACCAGATGATGAAAGGTGGTCACGCCCCTGCGGCGAAAAGCGATCACgg > 1:1380622/1‑100 (MQ=255) aaaGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTg < 1:4922373/100‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTg < 1:2641874/100‑1 (MQ=255) gTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCa > 1:591842/1‑100 (MQ=255) gTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCa > 1:133538/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 2:583599/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 1:238843/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 2:4715020/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 1:373378/1‑100 (MQ=255) ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGCTTCTGCCGTTAGACCAGAGGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGCCGAAGAGCGGTCACGGTGCCAGCAAt > 2:4067944/1‑100 (MQ=255) ttAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATct > 1:4087751/1‑100 (MQ=255) naaCGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctg > 1:309788/2‑100 (MQ=255) aaCGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgc < 2:62996/100‑1 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGCGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 2:4479554/1‑100 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg < 2:4994899/100‑1 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 1:3826199/1‑100 (MQ=255) cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 1:3776975/1‑100 (MQ=255) 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2:5478080/1‑98 (MQ=255) gTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgcc > 2:3159023/1‑100 (MQ=255) ggCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAACCTGCTGCGTCTgccgc > 1:65104/1‑100 (MQ=255) ggCAACCAAAAGGATCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTTCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCCGCAATCTGCTGCGTCTgccgc > 2:1637663/1‑100 (MQ=255) cAAGCTGATGGTTCCGCCGATAGCGCAGATGCTGAAAGGTTGCAGCGCCTCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTACCAGCAACCTGCTGCGTCTACCGCCa < 2:1015022/100‑1 (MQ=255) cAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCa > 1:1418243/1‑100 (MQ=255) aCCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGc > 2:5066129/1‑100 (MQ=255) ccTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGcc < 2:4965818/100‑1 (MQ=255) cTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCct > 2:760465/1‑100 (MQ=255) cTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCct > 1:1862630/1‑100 (MQ=255) tGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctc > 2:5387392/1‑100 (MQ=255) tGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctc < 2:3954976/100‑1 (MQ=255) gATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGACCCTGCGACGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctct > 1:5286764/1‑100 (MQ=255) aTGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCtt < 1:3961686/100‑1 (MQ=255) tGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtc > 1:3551398/1‑100 (MQ=255) ggTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcc < 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tGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcac < 2:2392345/100‑1 (MQ=255) gCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcaca < 1:205788/100‑1 (MQ=255) gTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAAcc < 1:473608/100‑1 (MQ=255) aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:96783/1‑100 (MQ=255) aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:4861798/1‑100 (MQ=255) aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:2792842/1‑100 (MQ=255) gACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTg > 1:5226394/1‑100 (MQ=255) ccAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGa < 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1:2898203/100‑1 (MQ=255) gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac > 2:3221035/1‑100 (MQ=255) aaaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAaca < 2:2284958/100‑1 (MQ=255) aaaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAaca < 2:3113695/100‑1 (MQ=255) aaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAacac > 1:4651323/1‑100 (MQ=255) aGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAacacn < 2:4178703/100‑2 (MQ=255) aGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcg < 1:937634/100‑1 (MQ=255) ggtggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgt > 2:678750/1‑100 (MQ=255) 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gCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGAtattat < 2:3335783/100‑1 (MQ=255) cGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACCACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATg > 2:1653384/1‑100 (MQ=255) cGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATg < 2:4852479/100‑1 (MQ=255) gATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGCCGATATTATgg > 1:4916785/1‑100 (MQ=255) | CCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGG > NC_000913/4403050‑4403244 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |