| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 546,173 | T→G | E64A (GAA→GCA) | allD ← | ureidoglycolate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 546,173 | 0 | T | G | 99.1% | 824.0 / ‑4.4 | 232 | E64A (GAA→GCA) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base G (114/116); total (115/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
TGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546077‑546269 | tGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTACAATTGCCGAGCACGGCCCTGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTgcgc > 2:2355014/1‑100 (MQ=255) gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:857669/1‑100 (MQ=255) gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:1092138/1‑100 (MQ=255) gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:3468101/1‑100 (MQ=255) gTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGcgcg > 1:2099406/1‑100 (MQ=255) ttCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCgg < 2:3206065/100‑1 (MQ=255) tCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGATTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGt > 2:5233940/1‑100 (MQ=255) cATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTg < 2:956824/100‑1 (MQ=255) tACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGt < 1:3502112/100‑1 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 1:126938/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:5200491/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:2207626/1‑100 (MQ=255) cccATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTgc > 2:2291267/1‑100 (MQ=255) ttCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCtt > 1:5193810/1‑100 (MQ=255) tCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCttt < 2:2433741/100‑1 (MQ=255) tCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCttt > 1:4863088/1‑100 (MQ=255) gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCAGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTg > 2:900709/1‑100 (MQ=255) gccgcGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACCGCCCGGCCTCCTCCAGACGACACTCCCGTGCGCGGGTGGTgccgcccggtg > 2:4577299/1‑95 (MQ=255) cgcgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGaa < 1:3704288/100‑1 (MQ=255) cgcgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGaa < 1:2043418/100‑1 (MQ=255) cgACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAt < 2:3797132/100‑1 (MQ=255) gACCTGTCCGGCGGCATTGTAGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATg > 1:4340975/1‑100 (MQ=255) aCCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGc < 1:417901/100‑1 (MQ=255) aCCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGc > 1:397982/1‑100 (MQ=255) cTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGt < 1:1919723/100‑1 (MQ=255) gTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTc > 1:350724/1‑100 (MQ=255) ccGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcg > 1:1936672/1‑100 (MQ=255) ggcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgcg < 1:701803/100‑1 (MQ=255) ggcggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCcgcg > 1:1571714/1‑100 (MQ=255) ggcATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGCGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtag < 1:245888/100‑1 (MQ=255) ggcATTGTCGGAAGGTAAAATTGGCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCGTTTGAAATGCGTTCCGCgtag < 2:4529891/100‑1 (MQ=255) cATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtagta > 1:640144/1‑100 (MQ=255) cATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCgtagta < 2:1578391/100‑1 (MQ=255) cATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGAGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGCTACGCgtagta > 2:3397661/1‑100 (MQ=255) aTTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATTCGTTCCGCGTAGTAt > 2:2414053/1‑100 (MQ=255) aTTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTAt > 1:1928224/1‑100 (MQ=255) gTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTcc > 1:2844655/1‑100 (MQ=255) tCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCa < 2:2772309/100‑1 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc < 1:3204178/100‑1 (MQ=255) cGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAc > 1:2646949/1‑100 (MQ=255) ggCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcg > 1:4947954/1‑100 (MQ=255) gCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAcgc > 1:4266234/1‑100 (MQ=255) aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAACTGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:4386963/1‑100 (MQ=255) aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 1:2392704/1‑100 (MQ=255) aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:5073383/1‑100 (MQ=255) aTGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACgcgc > 2:2097841/1‑100 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 1:927438/100‑1 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 2:3572615/100‑1 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:4496186/1‑100 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa < 1:3777635/100‑1 (MQ=255) tGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCa > 1:5444909/1‑100 (MQ=255) gTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCAc > 1:2487199/1‑100 (MQ=255) aaaaTTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACcg > 2:1936759/1‑100 (MQ=255) aTTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCgcgc < 2:1290667/100‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGcc < 1:3959384/100‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGcc < 2:1752727/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt < 2:2808810/100‑1 (MQ=255) gCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCAt > 2:676908/1‑100 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:1643657/100‑1 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 2:4451876/100‑1 (MQ=255) ccGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATg < 1:5450748/100‑1 (MQ=255) cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATga > 1:5342277/1‑100 (MQ=255) cGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAAGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCCCGCCATga > 2:4997929/1‑100 (MQ=255) aGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATgaga < 1:2598892/100‑1 (MQ=255) cACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGt < 1:3550110/100‑1 (MQ=255) aCGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTg < 2:1907081/100‑1 (MQ=255) aCGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTg < 2:268991/100‑1 (MQ=255) aCGGCCCGGGTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTg < 2:4769246/100‑1 (MQ=255) cGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCAAGCGCACCGCGCCATGAGAGTgg < 1:695097/100‑1 (MQ=255) ggCCCGGTTTCCTCAGTACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGACTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTACTACACGCACACCGCGCCATGAGAGAGGa < 2:1298612/100‑1 (MQ=255) gCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGAAGTATTCAACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGAt > 2:2879850/1‑100 (MQ=255) cccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATc < 2:5393333/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGCTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATcc < 2:1380355/100‑1 (MQ=255) cGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAAGGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATccc < 2:721930/100‑1 (MQ=255) tCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTgg < 1:2686765/100‑1 (MQ=255) tCCTCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTgg < 1:1725475/100‑1 (MQ=255) ccTCAAGACGAAACTCTGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGc < 2:3810246/100‑1 (MQ=255) tCAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCAt > 2:2559186/1‑100 (MQ=255) cAAGACGAAACTCCGGTGTGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc < 1:3438109/100‑1 (MQ=255) cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc < 2:4031940/100‑1 (MQ=255) cAAGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATc > 2:1539553/1‑100 (MQ=255) aaGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCg < 1:1477720/100‑1 (MQ=255) aGACGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAACTGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCTCGCCATGGGCGTTCATCCCTCTGGCATCgg < 2:4097068/100‑1 (MQ=255) gACGAAACTCCGGTGTGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGc > 1:5481443/1‑100 (MQ=255) aCGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCg < 1:2808136/100‑1 (MQ=255) aCGAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCg > 1:957878/1‑100 (MQ=255) gAAACTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTa > 1:5243291/1‑100 (MQ=255) gAAACTCCAGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTa > 2:5274814/1‑100 (MQ=255) aaCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTaaa > 1:1184451/1‑100 (MQ=255) aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 2:4182885/100‑1 (MQ=255) aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 2:1683468/100‑1 (MQ=255) aCTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAc < 2:1220324/100‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc > 1:2156995/1‑100 (MQ=255) cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc < 2:5314846/100‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAAcc > 2:3117084/1‑100 (MQ=255) ccGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCag > 1:2872330/1‑99 (MQ=255) ccGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCaa > 1:3919019/1‑100 (MQ=255) ccGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCaa < 1:5047122/100‑1 (MQ=255) cGGTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAAt < 2:3484661/100‑1 (MQ=255) ggTGCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATa > 1:1842369/1‑100 (MQ=255) | TGTTCCATACCCATTTTCGCCGCGACCTGTCCGGCGGCATTGTCGGCATGTAAAATTGCCGAGCACGGCCCGGTTTCCTCAAGACGAAACTCCGGTTCGCGGTTGGTGCCGCCTTTTGAAATGCGTTCCGCGTAGTATTCCACGCGCACCGCGCCATGAGAGTGGATCCCTCTGGCATCGGCGTAAACCAATA > NC_000913/546077‑546269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |