Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 623,458 | T→G | L387V (TTG→GTG) | entS → | enterobactin exporter, iron‑regulated |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 623,458 | 0 | T | G | 99.5% | 789.4 / ‑4.3 | 218 | L387V (TTG→GTG) | entS | enterobactin exporter, iron‑regulated |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (103/114); total (104/114) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCT > NC_000913/623361‑623554 | cAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGgtgtgt > 1:1000466/1‑100 (MQ=255) cAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGgtgtgt > 2:1972671/1‑100 (MQ=255) cAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGgtgtgt > 1:3389065/1‑100 (MQ=255) aGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgtt < 2:4345014/100‑1 (MQ=255) gAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTgtgttg > 2:2652606/1‑100 (MQ=255) cGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGAtt > 2:3160091/1‑100 (MQ=255) gTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTa < 2:679725/100‑1 (MQ=255) tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 2:3466123/1‑100 (MQ=255) tGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGACCGGTTTTGGTGTGTTGATTAt > 1:5193457/1‑100 (MQ=255) cGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCgg < 1:2519514/100‑1 (MQ=255) cGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCgg < 1:2412127/100‑1 (MQ=255) ggCGATGCCATAGGCGCGGAGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGATTTTGGTGAGTTGATTATCGGCg > 2:5029378/1‑100 (MQ=255) gCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCgt < 1:1734839/100‑1 (MQ=255) aTGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgtt < 1:3025236/100‑1 (MQ=255) gtcATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGGTTGGGCGCGATGAGGACACCGGTTACTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGtgttgt < 2:5464850/98‑1 (MQ=255) ccATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTgttgtt < 2:4896831/100‑1 (MQ=255) cctAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGAGGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 2:5443768/3‑100 (MQ=255) cATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTa > 1:5551607/1‑100 (MQ=255) aTAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAt < 2:397637/100‑1 (MQ=255) aTAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAt > 1:2203216/1‑100 (MQ=255) tAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAtt < 1:2746383/100‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTAttag > 1:282813/1‑98 (MQ=255) gcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgct < 2:3365669/100‑1 (MQ=255) gcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgct < 2:1767198/100‑1 (MQ=255) gcgcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgct < 2:4595355/100‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg < 1:3659022/100‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctgg > 1:1464495/1‑100 (MQ=255) ggcgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGGTGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGATTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGATATtgctggtg > 1:4905945/1‑100 (MQ=255) cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATtgctggtgct > 2:2793595/1‑100 (MQ=255) cgcTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGCTGTTATtgctggtgct > 2:4559374/1‑100 (MQ=255) tgctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt < 1:2092838/100‑1 (MQ=255) tactgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTgctggtgctggt < 1:2633817/98‑1 (MQ=255) gctgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGctggtgctggtg < 1:1227814/100‑1 (MQ=255) ctgGGTGGTTGGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCGAGCGCAAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCtggtgg < 2:653740/100‑1 (MQ=255) tgGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGa > 1:2473994/1‑100 (MQ=255) gggTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAg < 1:1815682/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt < 1:3501769/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGt > 1:4362191/1‑100 (MQ=255) ggtTTGGGCGCGATGATGACACCTGTTGCTTCCGCAAGCGCGTGCGGTTTTGGTGTGTTGTTTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc < 1:4856726/100‑1 (MQ=255) ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc < 1:5028390/100‑1 (MQ=255) ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc > 2:1417812/1‑100 (MQ=255) ggtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGc > 1:381292/1‑100 (MQ=255) gtTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCg < 1:1620578/100‑1 (MQ=255) tttGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGa > 1:3298554/1‑100 (MQ=255) ttGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGAc < 2:2845669/100‑1 (MQ=255) ggCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtt > 1:1178645/1‑100 (MQ=255) ggCGCGATGATGACACCGGTTGCTGCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGGTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtt > 2:3625191/1‑100 (MQ=255) gcgcGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGagatcg > 2:3843699/1‑95 (MQ=255) gcgcGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAttt < 2:1853737/100‑1 (MQ=255) gagggattatGACTCGTGTTGCTTGCGCGAGCGGGGGTGGTTTTGGTGTGTTGGTTATCGGCGTGTTGTTATTTCTGGTGCTGGGGGAGTTGCGACAttt < 2:4694270/96‑1 (MQ=255) cgcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACAtttt > 2:83847/1‑100 (MQ=255) gcgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTc > 2:1172033/1‑100 (MQ=255) cgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCg < 1:3885293/100‑1 (MQ=255) cgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCg < 2:4737735/100‑1 (MQ=255) cgATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCg < 1:13351/100‑1 (MQ=255) gatgatGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGc < 2:3091323/100‑1 (MQ=255) gatgatGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGc < 1:1363169/100‑1 (MQ=255) atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc > 1:1257598/1‑100 (MQ=255) atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 2:2083758/100‑1 (MQ=255) atgatgACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGcc < 1:2866070/100‑1 (MQ=255) atgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGa > 1:3476329/1‑100 (MQ=255) tgaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAc < 2:4205757/100‑1 (MQ=255) gaCACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcg > 2:4295681/1‑100 (MQ=255) acacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgc < 2:2392610/100‑1 (MQ=255) cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 2:394369/1‑100 (MQ=255) cacCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgcc > 1:3150052/1‑100 (MQ=255) acCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccg < 1:3618038/100‑1 (MQ=255) ggTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGAcgccgccg > 1:3753542/1‑100 (MQ=255) tGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAg < 1:5244554/100‑1 (MQ=255) tGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGATTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGATGTTATTGCTGGTGCTGGTGGCGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCAGCCGCAg > 2:5106985/1‑100 (MQ=255) cTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGt > 2:3339791/1‑100 (MQ=255) ttCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTg < 2:1500649/100‑1 (MQ=255) tCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGAGCGAGTGGATTTGCGATATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGa > 2:5249547/1‑100 (MQ=255) ccGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGAc > 2:493340/1‑100 (MQ=255) cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 1:4965914/1‑100 (MQ=255) cGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACa > 2:5413503/1‑100 (MQ=255) gCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAg < 2:1339346/100‑1 (MQ=255) cAAGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGc < 1:4764655/100‑1 (MQ=255) aaGCGCGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCg > 1:778149/1‑100 (MQ=255) gcgcGAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTc < 2:124463/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACTCTGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:4751748/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:3548255/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:3962177/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 1:909650/100‑1 (MQ=255) cgcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTcc < 2:1577853/100‑1 (MQ=255) gcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCg < 1:4234662/100‑1 (MQ=255) gcgAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCg < 1:4561724/100‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGAc < 1:4599759/100‑1 (MQ=255) gAGCGGTTTGGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCACGTGACAGCGTCCGAc < 2:4186973/100‑1 (MQ=255) gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 2:1145558/100‑1 (MQ=255) gCGGTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAg < 2:2554281/100‑1 (MQ=255) gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 1:4692972/100‑1 (MQ=255) gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa > 1:4523846/1‑100 (MQ=255) gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa < 1:5089621/100‑1 (MQ=255) gTTTTGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTa > 1:3361387/1‑100 (MQ=255) ttttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTaa < 2:3719088/100‑1 (MQ=255) tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 2:3282256/100‑1 (MQ=255) tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 1:3189588/100‑1 (MQ=255) tttGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAAt < 1:1593016/100‑1 (MQ=255) tGGTGTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGc > 2:1811874/1‑100 (MQ=255) | GCAGAACGTGACGGGCGATGCCATAGGCGCGGCGCTGCTGGGTGGTTTGGGCGCGATGATGACACCGGTTGCTTCCGCAAGCGCGAGCGGTTTTGGTTTGTTGATTATCGGCGTGTTGTTATTGCTGGTGCTGGTGGAGTTGCGACATTTTCGCCAGACGCCGCCGCAGGTGACAGCGTCCGACAGTTAATGCT > NC_000913/623361‑623554 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |