Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 626,842 | A→C | D258A (GAT→GCT) | entE → | 2,3‑dihydroxybenzoate‑AMP ligase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 626,842 | 0 | A | C | 99.1% | 828.9 / ‑2.3 | 229 | D258A (GAT→GCT) | entE | 2,3‑dihydroxybenzoate‑AMP ligase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base C (120/106); total (123/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
ACCTGTGCGCGATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGATCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAGGTTAACGTTACCGCGCTGGTGCCACCCGCAGTCAGCCTGTGGTTGCAGGCGCTGAT > NC_000913/626746‑626941 | ccTGTGCGCGATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTccc > 1:3485231/1‑100 (MQ=255) gtgCGCGATCCCGGCTGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAgc < 2:4610006/100‑1 (MQ=255) gtgCGCGATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAgc < 2:4848287/100‑1 (MQ=255) gtgCGCGATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGATCCCAgc > 2:1548782/1‑100 (MQ=255) tgCGCGATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAgcg < 2:794445/100‑1 (MQ=255) cgcgATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGcc > 1:996185/1‑100 (MQ=255) cgcgATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGcc < 2:3567047/100‑1 (MQ=255) cgcgATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGcc > 1:3112674/1‑100 (MQ=255) cgcgATCCCGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGcc > 2:3181409/1‑100 (MQ=255) cccGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGctc > 1:5306644/1‑100 (MQ=255) cccGGCGGCTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGctc > 1:3350651/1‑100 (MQ=255) cggcggCTGATAACTACGCCATGAGTTTGCCAGGCTCGCTTGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGACCGCTCCCAGCGCCACGCTCTg < 2:5254651/100‑1 (MQ=255) cggcTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGttt < 2:3120371/100‑1 (MQ=255) cTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTccc > 1:21918/1‑100 (MQ=255) cTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTccc < 2:3459336/100‑1 (MQ=255) cTCATAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTccc < 2:4469693/100‑1 (MQ=255) tAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattg < 2:2537431/100‑1 (MQ=255) tAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattg > 1:2973160/1‑100 (MQ=255) tAACTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattg > 1:5484151/1‑100 (MQ=255) aaCTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattga < 2:2836837/100‑1 (MQ=255) aaCTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattga < 2:4097006/100‑1 (MQ=255) aaCTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattga > 1:1393718/1‑100 (MQ=255) aCTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattgat < 2:2240021/100‑1 (MQ=255) aCTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattgat < 1:3062368/100‑1 (MQ=255) cTACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattgatt > 1:1043286/1‑100 (MQ=255) tACGCCATGAGTTCTCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattgattg < 2:3776575/100‑1 (MQ=255) tACGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCattgattg > 1:1139782/1‑100 (MQ=255) aCGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCAttgattga > 2:1745349/1‑100 (MQ=255) cGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGaa < 1:3753054/100‑1 (MQ=255) cGCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGaa > 1:100414/1‑100 (MQ=255) gCCATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGaaa > 1:4368924/1‑100 (MQ=255) cATGAGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGaaaaa < 1:876894/100‑1 (MQ=255) aGTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATc > 1:2537948/1‑100 (MQ=255) gTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCa > 2:1815635/1‑100 (MQ=255) gTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCa > 1:619548/1‑100 (MQ=255) gTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCa > 2:3528363/1‑100 (MQ=255) gTTCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCa > 2:957044/1‑100 (MQ=255) ttCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAg < 1:5137970/100‑1 (MQ=255) gccGCCGGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAg < 2:1271253/98‑1 (MQ=255) tCGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCAAAAAAATAAAAAACATCAgg < 2:208114/100‑1 (MQ=255) ctccAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAGGt < 1:1144029/98‑1 (MQ=255) cGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAGGt < 2:4880087/100‑1 (MQ=255) cGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAGGt < 2:335076/100‑1 (MQ=255) cGCCAGGATCGCTGGGCGTCTTTCTTGCCGGAGGAACGGTTGTTCTGGCGGCCGCTCCCAGCGCCACGCTCTGTTTCCCATTGATTGAAAAACATCAGGt > 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |