| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 921,236 | A→C | K297T (AAA→ACA) | macB → | macrolide ABC transporter peremase/ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 921,236 | 0 | A | C | 99.5% | 710.8 / NA | 198 | K297T (AAA→ACA) | macB | macrolide ABC transporter peremase/ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base C (98/98); minor base T (0/1); total (98/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
CTGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCAAACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATCAGC > NC_000913/921139‑921331 | cgggCCGCGAATAGAATGCGGACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGGATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCcacac < 2:2161123/98‑1 (MQ=255) tGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCcacaca > 1:1279515/1‑100 (MQ=255) tGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCcacaca < 1:2129496/100‑1 (MQ=255) cAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAAt > 1:4408921/1‑100 (MQ=255) gCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATgg > 1:3240615/1‑100 (MQ=255) gCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATgg < 2:1151435/100‑1 (MQ=255) cGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGt > 2:543451/1‑100 (MQ=255) aaTAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGc < 1:4071309/100‑1 (MQ=255) aaaaTGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGCGACGCCGCCACACAAATGGTGCTgg > 2:3007288/1‑100 (MQ=255) aaTGAGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCg > 2:4679222/1‑100 (MQ=255) aTGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCgg > 1:796516/1‑100 (MQ=255) tGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGa < 1:3746089/100‑1 (MQ=255) gTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGatat > 2:1158362/1‑100 (MQ=255) aCTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTc > 1:3430069/1‑100 (MQ=255) cTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCg > 1:338917/1‑100 (MQ=255) ttACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGtt > 2:3052739/1‑100 (MQ=255) ttACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGtt > 1:1166352/1‑100 (MQ=255) tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc > 2:877947/1‑100 (MQ=255) tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc < 1:4887692/100‑1 (MQ=255) tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc < 2:4027585/100‑1 (MQ=255) tACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTc < 2:4643214/100‑1 (MQ=255) aCTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCt > 2:3565694/1‑100 (MQ=255) aCTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCt < 1:1522802/100‑1 (MQ=255) cTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTa < 1:4926638/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTGGCGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAAGGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTAtt < 2:4381375/100‑1 (MQ=255) gACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTAtt > 2:2675644/1‑100 (MQ=255) gACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTAtt < 1:157848/100‑1 (MQ=255) aCCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTg < 2:2187739/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa > 1:2017789/1‑100 (MQ=255) aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa < 2:5218498/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa < 1:1677166/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTa < 2:3907854/100‑1 (MQ=255) tGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTAc < 1:3176712/100‑1 (MQ=255) gCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACg > 1:865906/1‑100 (MQ=255) gCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACg > 1:3530046/1‑100 (MQ=255) cTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGa > 2:2547663/1‑100 (MQ=255) tGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGaa > 2:1943154/1‑100 (MQ=255) gggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATa > 2:4772063/1‑100 (MQ=255) gggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATa < 2:3091571/100‑1 (MQ=255) ggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATAc < 1:5251989/100‑1 (MQ=255) ggATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATAc > 2:2088715/1‑100 (MQ=255) gATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACt < 2:2765015/100‑1 (MQ=255) gATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAAGACt > 1:4727511/1‑100 (MQ=255) attattATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTa > 2:4824934/1‑100 (MQ=255) ttattaTCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTAt > 2:759966/1‑100 (MQ=255) attatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg > 1:5096669/1‑100 (MQ=255) attatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg > 2:3162803/1‑100 (MQ=255) attatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGGGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg < 2:1687316/100‑1 (MQ=255) attatCGGTATTGCGTAAGTGGATTACAATGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTg < 2:2712619/100‑1 (MQ=255) ttatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTCACGCCGCCATACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGa < 2:5377485/100‑1 (MQ=255) tatCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGAt > 1:1169950/1‑100 (MQ=255) atCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATg > 2:1795927/1‑100 (MQ=255) atCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATg > 1:3160840/1‑100 (MQ=255) tCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGt > 1:1071539/1‑100 (MQ=255) tCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGt > 2:3230132/1‑100 (MQ=255) cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:685114/100‑1 (MQ=255) cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:2969531/100‑1 (MQ=255) cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 1:397284/100‑1 (MQ=255) cGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTc < 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cGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaa < 1:3199603/100‑1 (MQ=255) ggtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGTGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaaa > 2:63719/1‑100 (MQ=255) ggtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaan < 1:4604130/100‑2 (MQ=255) ggtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGCACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGaaa < 1:242669/100‑1 (MQ=255) gtggtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAg < 2:3210433/100‑1 (MQ=255) gtTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAtt > 1:4317614/1‑100 (MQ=255) tttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAttt < 1:1707948/100‑1 (MQ=255) tttCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGAttt > 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1:1926538/100‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGAc < 1:614116/100‑1 (MQ=255) cGTGGTGGGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGAc < 2:712377/100‑1 (MQ=255) tggtggGTGACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGa > 1:1309540/1‑100 (MQ=255) gtgggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATc > 2:4873519/1‑100 (MQ=255) gtgggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATc > 1:4195661/1‑100 (MQ=255) gggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCg > 1:5383674/1‑100 (MQ=255) gggtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCg > 1:1780825/1‑100 (MQ=255) gtgACGCCGCCACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCa > 2:1061804/1‑100 (MQ=255) acaccgccACACAAATGGTGATGGCGGATATTCGTTCTATTGGGACGAATACTATTGATGACTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCTGCAata < 2:3357596/97‑1 (MQ=255) gccgccACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATc < 1:4173211/100‑1 (MQ=255) ccgccACACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATca < 2:4475613/100‑1 (MQ=255) | CTGGCAGCGAATAAAATGCGTACTTTACTGACCATGCTGGGGATTATTATCGGTATTGCGTCGGTGGTTTCCATTGTCGTGGTGGGTGACGCCGCCAAACAAATGGTGCTGGCGGATATTCGTTCTATTGGTACGAATACTATTGATGTCTATCCCGGGAAAGATTTTGGCGATGACGATCCGCAATATCAGC > NC_000913/921139‑921331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |