| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,130,388 | G→A | A159V (GCA→GTA) | flgA ← | assembly protein for flagellar basal‑body periplasmic P ring |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,130,388 | 0 | G | A | 98.1% | 702.6 / ‑1.4 | 211 | A159V (GCA→GTA) | flgA | assembly protein for flagellar basal‑body periplasmic P ring |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (86/121); total (88/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGC > NC_000913/1130291‑1130483 | cGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTg > 1:5495294/1‑100 (MQ=255) ggCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTgg < 1:1835611/100‑1 (MQ=255) gCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGc < 2:2380324/100‑1 (MQ=255) gCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGc < 1:1926333/100‑1 (MQ=255) gCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGc > 1:1689936/1‑100 (MQ=255) cTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCg < 1:1012121/100‑1 (MQ=255) gCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGaa > 1:4933978/1‑100 (MQ=255) cATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGaaa > 1:274617/1‑100 (MQ=255) aTTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAAc < 1:3173959/100‑1 (MQ=255) gTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTgg > 2:936581/1‑100 (MQ=255) gTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTgg < 2:1501714/100‑1 (MQ=255) gTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTgg < 1:241387/100‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTggg > 1:664785/1‑100 (MQ=255) ttCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTggg < 2:1811050/100‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTggg < 2:4244688/100‑1 (MQ=255) ttCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTggg < 2:391847/100‑1 (MQ=255) cgcCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAAc < 1:1296353/100‑1 (MQ=255) cgcCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAAc > 2:4351453/1‑100 (MQ=255) ccTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTg < 1:1459532/100‑1 (MQ=255) cTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTgg > 2:1632395/1‑100 (MQ=255) cTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTgg < 1:2825985/100‑1 (MQ=255) gACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTACCTGGAt > 2:3858869/1‑100 (MQ=255) gACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGAt > 2:2531450/1‑100 (MQ=255) gACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCACCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTGGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGAt < 2:4861605/100‑1 (MQ=255) aCCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATa > 1:1502816/1‑100 (MQ=255) ccTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAg > 2:3754533/1‑100 (MQ=255) cTTCTGCGTTGGCGCGATACGCATCACCGCTGGCGATAACATTGACGCGTTGTCCGGCTTATACACGCCATACTTGGCGAAGCTTGGTTAACTGGATAgg > 2:442401/1‑100 (MQ=255) ttCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGt > 2:4160276/1‑100 (MQ=255) ttCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGt < 1:1608514/100‑1 (MQ=255) ttCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGt < 2:271978/100‑1 (MQ=255) tcggCGTTGGCGCTAACCCCATCACCCCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGtt < 2:2515368/97‑1 (MQ=255) cTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTg > 2:3818601/1‑100 (MQ=255) tGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTCACGATCACATTCACGCGTTGTCCCACTTTTACCCGCCATACCTGGCGAATCTGGGTTAACTGGATCGGTTGa > 1:5421455/1‑100 (MQ=255) tgTTGGCGCTAAACCCATCTCCGCGGGCGATCACATGGACGCTTGGTCCCGCTTGTCCCCGCCATACCTGGCGGAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATc < 1:4693074/99‑1 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATc < 2:834943/100‑1 (MQ=255) cGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATc < 1:3020169/100‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTAAACCTATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCg < 2:245949/100‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGGGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCg < 2:506381/100‑1 (MQ=255) gTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCg > 1:2336296/1‑100 (MQ=255) tGGCGCTAAACCCATCACCGCGGGCGATCACATTGTCGCGTTGGCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCggg < 2:3304028/100‑1 (MQ=255) ggCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGt < 1:3440702/100‑1 (MQ=255) gcgcTAACCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTg < 1:1135658/100‑1 (MQ=255) gcgcTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTg < 2:4727378/100‑1 (MQ=255) gcgcTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTg > 2:2079806/1‑100 (MQ=255) cTAAACCCTGCCCCGGGGGCGAGCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATa < 1:4191762/100‑1 (MQ=255) cTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATa > 2:4878729/1‑100 (MQ=255) aaaCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGa > 1:4353986/1‑100 (MQ=255) ccccATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATc < 1:5200434/99‑1 (MQ=255) aCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATc > 2:4740170/1‑100 (MQ=255) aCCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATc > 1:3586519/1‑100 (MQ=255) cccATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATcg < 2:264351/100‑1 (MQ=255) cccATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATcg < 1:719030/100‑1 (MQ=255) ccATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATcgc > 2:3477452/1‑100 (MQ=255) aTCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCgcgc > 2:3246904/1‑100 (MQ=255) aCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAgg < 1:1978133/100‑1 (MQ=255) aCCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAgg > 1:2231351/1‑100 (MQ=255) ggCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATg < 1:2164819/100‑1 (MQ=255) gCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATgg < 1:4830595/100‑1 (MQ=255) cGATCACATTGACGCGTTGACCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCACGCAGGCTAATGGc > 2:5032485/1‑100 (MQ=255) gATCACATTGGCGCGAGGTCCGGCTTTTCCCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCa < 2:1994095/100‑1 (MQ=255) aTCACATTGCCGCGTTGTCCCGCTTTTCCCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCAt < 1:3894398/100‑1 (MQ=255) aTCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCAt > 2:2778129/1‑100 (MQ=255) aTCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCAt > 1:1630965/1‑100 (MQ=255) aTCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCAt < 2:2601148/100‑1 (MQ=255) tCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGTCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATc < 2:3670944/100‑1 (MQ=255) tCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACATGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATc < 1:4525763/100‑1 (MQ=255) cacaTTGACGGGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATca < 2:4615837/100‑1 (MQ=255) cacaTTGACGCGTTGTCCCGCGTTTTCCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATca < 2:1304042/100‑1 (MQ=255) acaTTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATcaa > 1:3923336/1‑100 (MQ=255) caTTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATcaac > 2:2332143/1‑100 (MQ=255) ttGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATcaacaa > 1:4263940/1‑100 (MQ=255) ggACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTCGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAg < 1:5387079/99‑1 (MQ=255) gACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGt > 2:4109138/1‑100 (MQ=255) cgTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgat < 1:441437/100‑1 (MQ=255) cgTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgat < 2:1104703/100‑1 (MQ=255) gTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGTTCAAGTGATCGATCGCTCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgatt > 2:5245461/1‑100 (MQ=255) gTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgatt > 1:1706975/1‑100 (MQ=255) ttGTCCCGCTTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgattg < 2:49858/100‑1 (MQ=255) ttGTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGttgattg < 2:3152952/100‑1 (MQ=255) gTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTACTGGCATCAACAAGTtgattgat > 2:4337456/1‑100 (MQ=255) gTCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTtgattgat > 2:5448483/1‑100 (MQ=255) tCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGata < 2:1118714/100‑1 (MQ=255) tCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGata > 1:2086590/1‑100 (MQ=255) tCCCGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGata < 1:3852654/100‑1 (MQ=255) cccGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGatat > 1:2724267/1‑100 (MQ=255) cccGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGatat > 1:2557454/1‑100 (MQ=255) cccGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGAACGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGatat > 1:5249291/1‑100 (MQ=255) ccGCTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATc > 2:1854761/1‑100 (MQ=255) cTTTTACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAg > 1:324833/1‑100 (MQ=255) tACCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCAcc > 2:4038695/1‑100 (MQ=255) aCCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGTATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCg < 2:3975888/100‑1 (MQ=255) aCCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCg > 2:2016858/1‑100 (MQ=255) aCCCGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGCTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCg > 2:5366718/1‑100 (MQ=255) cccGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGGTCGCGCAGGCTAATGGCATCAGCAAGTTGATTGATATCCAGCACCGt < 1:4977759/100‑1 (MQ=255) cccGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGt > 1:3319517/1‑100 (MQ=255) ccGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTa > 2:2250250/1‑100 (MQ=255) cGCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTAc > 1:2490981/1‑100 (MQ=255) gCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTAcg < 2:4476608/100‑1 (MQ=255) gCCATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTAcg < 1:447310/100‑1 (MQ=255) ccATACCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTTATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTAcgc < 2:804767/100‑1 (MQ=255) | GACGGCTGCATTGTTCAGCGCCTGACCTTCTGCGTTGGCGCTAAACCCATCACCGCTGGCGATCACATTGACGCGTTGTCCCGCTTTTACCCGCCATGCCTGGCGAAACTGGGTTAACTGGATAGGTTGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGC > NC_000913/1130291‑1130483 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |