| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,343,516 | A→C | intergenic (‑188/+81) | osmB ← / ← yciT | osmotically and stress inducible lipoprotein/global regulator of transcription; DeoR family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,343,516 | 0 | A | C | 99.5% | 771.7 / NA | 217 | intergenic (‑188/+81) | osmB/yciT | osmotically and stress inducible lipoprotein/global regulator of transcription; DeoR family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (98/118); minor base G (1/0); total (99/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CTGCTCGCGCGCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAACGACG > NC_000913/1343420‑1343612 | cTGCTCGCGCGCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAg < 2:467038/100‑1 (MQ=255)cTGCTCGCGCGCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAg < 2:2831890/100‑1 (MQ=255) cTCGCGCGCAGGGTTATATCTCGCAGGTCGTAATGACTTCCTGTTAAATCGCTGATAATAAGTTTACGTCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCt < 2:3434386/100‑1 (MQ=255) cTCGCGCGCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCt > 1:4334148/1‑100 (MQ=255) tCGCGCGCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCtt > 2:2372631/1‑100 (MQ=255) cgcgcgCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTa > 2:190849/1‑100 (MQ=255) cgcgcAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAAt < 2:463321/100‑1 (MQ=255) cgcAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTa < 1:4968605/100‑1 (MQ=255) gcAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTAt < 2:4681327/100‑1 (MQ=255) gcAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTAt > 2:1827130/1‑100 (MQ=255) cAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATc < 1:566148/100‑1 (MQ=255) gggTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCaa > 1:361535/1‑100 (MQ=255) ggTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAAc < 1:706575/100‑1 (MQ=255) gTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTATTAATTATTaaac > 2:915708/1‑98 (MQ=255) tataTCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAg > 1:1865482/1‑100 (MQ=255) tataTCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAg > 1:3508997/1‑100 (MQ=255) atatCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAgg < 2:1468027/100‑1 (MQ=255) tatCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGa > 1:1590579/1‑100 (MQ=255) tatCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCGTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGa > 2:5148345/1‑100 (MQ=255) tatCACGCAGGTAATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGGGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGa > 2:5294154/1‑100 (MQ=255) atCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGaa > 1:1156169/1‑100 (MQ=255) tCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAat > 1:3375952/1‑100 (MQ=255) cAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCt < 2:1189534/100‑1 (MQ=255) cAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCt < 1:2765237/100‑1 (MQ=255) ggTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTa > 2:2629546/1‑100 (MQ=255) gTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTag < 1:3885699/100‑1 (MQ=255) tGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTaga > 2:4303825/1‑100 (MQ=255) tGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCATGATAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTaga > 2:4242017/1‑100 (MQ=255) gATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTagag < 2:3830580/100‑1 (MQ=255) aTAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGGGc < 1:2566673/100‑1 (MQ=255) aTAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGc > 1:2448373/1‑100 (MQ=255) tAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCg > 1:584647/1‑100 (MQ=255) tAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCg > 2:2191793/1‑100 (MQ=255) tAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCg > 2:876333/1‑100 (MQ=255) aCTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGgatga < 2:414532/100‑1 (MQ=255) aCTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGgatga > 2:4586606/1‑100 (MQ=255) ttCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGAtt < 2:2992806/100‑1 (MQ=255) tCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGAttt < 2:4872708/100‑1 (MQ=255) ccTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTg < 1:2246123/100‑1 (MQ=255) ccTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTg < 1:3254520/100‑1 (MQ=255) cTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGc < 1:3415555/100‑1 (MQ=255) cTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGc < 2:555194/100‑1 (MQ=255) cTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGc < 2:4745400/100‑1 (MQ=255) cTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGc < 1:322334/100‑1 (MQ=255) cTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGc > 2:3501577/1‑100 (MQ=255) cTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGc > 1:2097045/1‑100 (MQ=255) nttATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCa > 1:4446975/2‑100 (MQ=255) atatCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAAc < 2:2724376/100‑1 (MQ=255) atatCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAAc < 1:3089713/100‑1 (MQ=255) atCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg < 1:5477082/100‑1 (MQ=255) atCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg > 1:1200974/1‑100 (MQ=255) atCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg > 1:1257085/1‑100 (MQ=255) atCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTg < 2:2067803/100‑1 (MQ=255) tCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGc < 1:3752523/100‑1 (MQ=255) cGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCa < 2:2188402/100‑1 (MQ=255) gCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCaa > 1:4084058/1‑100 (MQ=255) gCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCaa > 2:3815578/1‑100 (MQ=255) gATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAatc > 1:2968372/1‑100 (MQ=255) gATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAatc > 1:845409/1‑100 (MQ=255) taataaTTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAatcct > 2:1609103/1‑98 (MQ=255) aataatTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACGAGTCTTAATTATCAACCATGAATCATCTTAGAGCGGATGATTGGCCAAACTGCAAatcatc < 2:2522785/100‑1 (MQ=255) ataatTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATcc > 2:3098969/1‑100 (MQ=255) ataagTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTAGCAACCAGGAATCATCTTAGCACGGATGATTTGCCAAACTGAAAATCATcc > 2:5181091/1‑100 (MQ=255) aatTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGt < 1:5283317/100‑1 (MQ=255) tttATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCATATCATCCGTaga < 1:4799105/100‑1 (MQ=255) tttATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTaga < 2:2435304/100‑1 (MQ=255) tataTCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAgaga < 2:1140788/100‑1 (MQ=255) atCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAgg > 2:1108840/1‑100 (MQ=255) atCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAgg > 2:3680572/1‑100 (MQ=255) cTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGa < 1:4533268/100‑1 (MQ=255) cTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGa > 1:869333/1‑100 (MQ=255) cTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGa > 2:4077393/1‑100 (MQ=255) ttGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGaa < 1:208240/100‑1 (MQ=255) ttGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGaa > 2:4537421/1‑100 (MQ=255) tGAGAGTGTTAATAACAGGTGACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGaaa < 1:5219711/100‑1 (MQ=255) tGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGaaa > 2:1502074/1‑100 (MQ=255) tGAGAGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTCCAAATCATCCGTAGAGAAGGGaaa < 2:1982839/100‑1 (MQ=255) gagaGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAAt < 2:4047636/100‑1 (MQ=255) gagaGTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGAAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAAt > 2:803789/1‑100 (MQ=255) agagTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATg < 2:4986974/100‑1 (MQ=255) agagTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATg < 1:60579/100‑1 (MQ=255) gagTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATgg < 1:1911253/100‑1 (MQ=255) gagTGATAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGCTGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATgg > 2:4852050/1‑100 (MQ=255) agTGTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGt < 1:1607469/100‑1 (MQ=255) agTCTTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGTATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGt < 1:4243410/100‑1 (MQ=255) gtgtTAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGtt < 1:1342748/100‑1 (MQ=255) ttAATAACAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTaaa > 1:510663/1‑100 (MQ=255) taataaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAAt > 1:2593897/1‑100 (MQ=255) aataaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATg < 2:3960972/100‑1 (MQ=255) aataaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATg < 2:2424015/100‑1 (MQ=255) aataaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCACGAATCATCTTAGAGCGTATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATg < 2:3732120/100‑1 (MQ=255) ataaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGt < 1:4114618/100‑1 (MQ=255) aaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCa > 1:2338694/1‑100 (MQ=255) aaCAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCa < 2:1571286/100‑1 (MQ=255) cAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAac < 1:5139530/100‑1 (MQ=255) cAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAac < 1:476095/100‑1 (MQ=255) cAGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAac > 2:1740381/1‑100 (MQ=255) aGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGTGAAATGGTTAAATGTCAacg < 1:4355673/100‑1 (MQ=255) aGGTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAacg < 1:2830298/100‑1 (MQ=255) gTAACTAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAacgac < 2:5443721/100‑1 (MQ=255) | CTGCTCGCGCGCAGGGTTATATCACGCAGGTGATAATGACTTCCTGTTATATCGCTGATAATAATTTTATATCTTGAGAGTGTTAATAACAGGTAAATAGTCTTAATTATCAACCAGGAATCATCTTAGAGCGGATGATTTGCCAAACTGCAAATCATCCGTAGAGAAGGGAAATGGTTAAATGTCAACGACG > NC_000913/1343420‑1343612 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |