| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,670,038 | T→G | C114G (TGT→GGT) | ynfM → | putative arabinose efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,670,038 | 0 | T | G | 96.6% | 693.7 / 5.5 | 206 | C114G (TGT→GGT) | ynfM | putative arabinose efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/4); new base G (104/93); total (109/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
CGGCGATGTTGGCTATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTTGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCA > NC_000913/1669940‑1670134 | gCGATGTTGGCTATTTGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTa > 1:3093229/1‑100 (MQ=255) gCGATGTTGGCTATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTa < 2:3827743/100‑1 (MQ=255) cGATGTTGGCTATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTAc < 2:3986274/100‑1 (MQ=255) gtGTTGGCTTTTGGTTTTCTGTGTACTGGCCAGCTATCCGATGCCATTGGTTGCAAACTAGTGATGGTCACGGCGCTACAGTTGGCTTCCATTTGCACGt < 2:431536/99‑1 (MQ=255) gTTGGCTATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTa < 2:1643827/100‑1 (MQ=255) ggCTATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACtt < 2:725115/100‑1 (MQ=255) cTATTGGTTTGCTGTCTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTTGTGTCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGTCTCCATTGGTACGTTACTTTc < 2:5238434/100‑1 (MQ=255) tATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTGCTTTCg > 2:1623085/1‑100 (MQ=255) tATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCg > 1:3053235/1‑100 (MQ=255) tATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCg < 1:2916558/100‑1 (MQ=255) tATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCg > 2:4699359/1‑100 (MQ=255) tATTGGTTTGCTGTTCACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGATCACAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTTCTTTCg < 2:5241795/100‑1 (MQ=255) aTTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACATTCGa > 1:5270754/1‑100 (MQ=255) ttGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGAc < 1:5360921/100‑1 (MQ=255) ttGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGAc < 1:2861255/100‑1 (MQ=255) ttGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGAc < 2:5205443/100‑1 (MQ=255) ggTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACaa > 2:333447/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACaa > 1:413427/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCAGTAGTACGTTACTTTCGACaa > 1:5219578/1‑100 (MQ=255) gTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAat > 2:4070655/1‑100 (MQ=255) gTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAat > 1:2027443/1‑100 (MQ=255) gTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAat > 2:2428009/1‑100 (MQ=255) gTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGGCGCAAACCAGTTATGGGCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAat < 2:1382031/100‑1 (MQ=255) gCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAatgatg > 2:3609450/1‑100 (MQ=255) gCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAatgatg > 2:477246/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAAtgatga > 2:261956/1‑100 (MQ=255) cTGTTTACTGGCCCGCGATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAAtgatga < 1:4574780/100‑1 (MQ=255) tGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGAc > 1:352975/1‑100 (MQ=255) gTTTACGGGCCCGCTACCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGAcc < 2:3094647/100‑1 (MQ=255) naCTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGc > 1:4418490/2‑100 (MQ=255) cTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTg > 1:4662650/1‑100 (MQ=255) cTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTg > 2:1091854/1‑100 (MQ=255) cTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTg < 2:2947117/100‑1 (MQ=255) cTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTg > 2:3242013/1‑100 (MQ=255) ggCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGc > 1:1911732/1‑100 (MQ=255) ggCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGc > 1:1223332/1‑100 (MQ=255) gCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCa > 1:1580008/1‑100 (MQ=255) cccGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGTCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCAc > 2:837202/1‑100 (MQ=255) ccGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACg > 1:5102613/1‑100 (MQ=255) cGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACgg < 2:4677370/100‑1 (MQ=255) cGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACgg < 2:1960851/100‑1 (MQ=255) cTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCa < 1:57953/100‑1 (MQ=255) ccGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGCCAATGATGACCAGCTGCCACGGCAtttt > 2:4394737/1‑100 (MQ=255) ccGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCAtttt < 2:4979131/100‑1 (MQ=255) ccGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCAtttt > 1:3432047/1‑100 (MQ=255) cGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTg > 2:3751784/1‑100 (MQ=255) cGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTg > 1:2876525/1‑100 (MQ=255) gATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGGTGGCACGGCATTTTGa < 2:5318903/100‑1 (MQ=255) gATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGa < 1:1988426/100‑1 (MQ=255) tGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGAtt > 1:1505791/1‑100 (MQ=255) tGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGAtt < 2:4233466/100‑1 (MQ=255) cATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATg > 1:1054906/1‑100 (MQ=255) ttGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATgcg > 1:439762/1‑100 (MQ=255) ggTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATgcgcg > 1:4705559/1‑100 (MQ=255) ggTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATgcgcg > 2:1044487/1‑100 (MQ=255) gTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATgcgcgc > 2:2321109/1‑100 (MQ=255) tCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGcc < 2:5474448/100‑1 (MQ=255) cGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCt > 2:1257096/1‑100 (MQ=255) cGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCt > 2:2452911/1‑100 (MQ=255) gCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCtt < 2:349637/100‑1 (MQ=255) gCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCtt > 1:3856265/1‑100 (MQ=255) aaaCCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGa < 2:2005653/100‑1 (MQ=255) aaCCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTTGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGAt < 1:4267881/100‑1 (MQ=255) aaCCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTTGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGAt < 1:1455264/100‑1 (MQ=255) aCCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGAtt < 1:1785274/100‑1 (MQ=255) ccAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTg > 2:4420169/1‑100 (MQ=255) ccAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTg < 1:2772712/100‑1 (MQ=255) cAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTgg > 2:3524793/1‑100 (MQ=255) gTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGc < 2:3388195/100‑1 (MQ=255) aTGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCttt > 2:5255044/1‑100 (MQ=255) aTGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCttt > 1:2750238/1‑100 (MQ=255) aTGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGCACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCttt > 2:4949305/1‑100 (MQ=255) tGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTc < 1:51208/100‑1 (MQ=255) ggTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCg < 1:3218422/100‑1 (MQ=255) tCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGtt > 1:2965685/1‑100 (MQ=255) tCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGtt > 1:1591779/1‑100 (MQ=255) cGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAg < 2:5032175/100‑1 (MQ=255) ggCGCTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgt < 2:4197391/100‑1 (MQ=255) ggCGCGACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgt < 1:2233103/100‑1 (MQ=255) gcgcTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgtg < 1:3748986/100‑1 (MQ=255) cTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgtggcg > 1:2371886/1‑100 (MQ=255) cTACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgtggcg > 1:2045724/1‑100 (MQ=255) tACTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgtggcgt < 1:3969676/100‑1 (MQ=255) cTGTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAgtggcgtgg > 1:5399580/1‑100 (MQ=255) gTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTCAGTGGCGTGGCa > 1:4854185/1‑100 (MQ=255) gTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCa > 1:4816024/1‑100 (MQ=255) gTTGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCa > 2:1502425/1‑100 (MQ=255) ttGGCCTCCTTTGGTACGTCACTCTCGACAATGATGACCAGCTGGAACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAg < 2:5445101/100‑1 (MQ=255) ttGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCan < 1:2260183/100‑2 (MQ=255) ttGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAg < 1:721432/100‑1 (MQ=255) tGGCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGc < 1:5373220/100‑1 (MQ=255) ggCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCt > 2:3776346/1‑100 (MQ=255) gCCTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTg > 2:655769/1‑100 (MQ=255) cTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCATGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTGAGTGGCGTGGCAGCTGtt > 2:1874123/1‑100 (MQ=255) cTCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGtt > 1:4674563/1‑100 (MQ=255) tCCATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTg > 2:1784244/1‑100 (MQ=255) ccATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTgg < 1:4082598/100‑1 (MQ=255) ccATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTgg < 1:2604142/100‑1 (MQ=255) ccATTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTgg < 1:1273979/100‑1 (MQ=255) aTTGGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCa > 1:3927897/1‑100 (MQ=255) | CGGCGATGTTGGCTATTGGTTTGCTGTTTACTGGCCCGCTATCCGATGCCATTGGTCGCAAACCAGTGATGGTCACGGCGCTACTGTTGGCCTCCATTTGTACGTTACTTTCGACAATGATGACCAGCTGGCACGGCATTTTGATTATGCGCGCCTTGATTGGGCTTTCGTTAAGTGGCGTGGCAGCTGTTGGCA > NC_000913/1669940‑1670134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |