| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,738,006 | A→C | K55Q (AAG→CAG) | purR → | transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,738,006 | 0 | A | C | 98.5% | 688.1 / ‑5.6 | 197 | K55Q (AAG→CAG) | purR | transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base C (98/94); total (100/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CAACAAAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGAAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCTTCC > NC_000913/1737909‑1738102 | caacaaAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAg < 2:3572997/100‑1 (MQ=255) aacaaAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAgg > 1:2043446/1‑100 (MQ=255) acaaAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGt > 2:4899438/1‑100 (MQ=255) acaaAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGt > 1:2931881/1‑100 (MQ=255) acaaAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGt > 2:3830947/1‑100 (MQ=255) acaaAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGt > 1:489349/1‑100 (MQ=255) aaaaCACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTa > 1:1908725/1‑100 (MQ=255) aaaCACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTaa > 1:5261690/1‑100 (MQ=255) cacGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAAccn < 2:1579989/100‑2 (MQ=255) cacGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACca > 1:1704909/1‑100 (MQ=255) cacGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACca > 2:1638868/1‑100 (MQ=255) tttCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACAcc < 2:3307859/100‑1 (MQ=255) tttCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACAcc < 1:2285420/100‑1 (MQ=255) tttCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACAcc < 1:2846019/100‑1 (MQ=255) ttCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCa < 2:4978483/100‑1 (MQ=255) cgtcgCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTTTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCACGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAg > 2:4236494/1‑100 (MQ=255) cgtcgCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAg < 1:5176744/100‑1 (MQ=255) cgtcgCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAg < 1:1052882/100‑1 (MQ=255) gtcgCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGt < 2:2805238/100‑1 (MQ=255) tcgCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTc < 1:2209386/100‑1 (MQ=255) cgCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCt > 2:4809211/1‑100 (MQ=255) agCTGAAGAAACGCGCAACGGCGTGTGGGCAGAGATTAAAGAATTACACTACTCTCACAGAGCGGTGGAGCGTCGCATGAAGGTTATCCAAACAAActct > 2:5486838/2‑100 (MQ=255) gCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTa > 2:2153127/1‑100 (MQ=255) cTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTAt > 2:2980033/1‑100 (MQ=255) tGAAGAATCGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATc < 2:5108774/100‑1 (MQ=255) aagaaACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCgg < 1:4360015/100‑1 (MQ=255) agaaACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTCCAGGTTAACCACACGAAGTCTATGGGt > 2:5192197/1‑100 (MQ=255) gaaACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGtt > 1:4295432/1‑100 (MQ=255) aaCGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTg > 2:1286607/1‑100 (MQ=255) aaCGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAACCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTg > 2:2875574/1‑100 (MQ=255) cgcgCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCt < 1:3904715/100‑1 (MQ=255) cgcAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTgg < 1:604821/100‑1 (MQ=255) gcAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGc > 2:4308310/1‑100 (MQ=255) aCGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGAc < 1:4006311/100‑1 (MQ=255) cGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGAcc < 1:4877957/100‑1 (MQ=255) gCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACca > 1:563810/1‑100 (MQ=255) ccGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACcag > 1:2391424/1‑100 (MQ=255) cGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTAGACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCTGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACcagc < 2:2300443/100‑1 (MQ=255) cGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGagatcg > 2:570670/1‑95 (MQ=255) cGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACcagc > 2:986977/1‑100 (MQ=255) gtgGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCagcagc < 1:2170103/100‑1 (MQ=255) gggCAGCGATTAAAGAATTGCACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGa > 2:5037823/1‑100 (MQ=255) gggCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCCAGTCTATCGGTTTGCTGGCGGCCAGCAGCGa > 1:4632149/1‑100 (MQ=255) ggCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCGTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGaa > 2:5282021/1‑100 (MQ=255) ggCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTCTCGGTTTGCTGGCGACCAGCcgcgca > 1:2742375/1‑98 (MQ=255) ggCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGaa > 2:44317/1‑100 (MQ=255) ggCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGaa > 2:1238366/1‑100 (MQ=255) gCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAg > 1:771164/1‑100 (MQ=255) cGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGc < 2:3446327/100‑1 (MQ=255) gATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGcc > 1:3532389/1‑100 (MQ=255) aTTAAAGAATTACACTTCTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCt < 1:116790/100‑1 (MQ=255) aaaGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTAtt > 2:3351403/1‑100 (MQ=255) aaaGAATTACACTACGCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTAtt < 1:1549193/100‑1 (MQ=255) aaGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTAttt > 2:4355226/1‑100 (MQ=255) aGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTAtttt < 1:3970845/100‑1 (MQ=255) gAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTg < 1:3042088/100‑1 (MQ=255) gAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTg > 1:2346004/1‑100 (MQ=255) aaTTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGc < 2:3717783/100‑1 (MQ=255) aaTTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGc < 2:2471160/100‑1 (MQ=255) aaTTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGc < 1:5526972/100‑1 (MQ=255) aTTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGcc > 2:3147030/1‑100 (MQ=255) ttACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCg < 1:2692097/100‑1 (MQ=255) acacTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCgag > 2:4563718/1‑100 (MQ=255) acacTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCgag < 2:1327200/100‑1 (MQ=255) acacTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCgag < 2:3287502/100‑1 (MQ=255) cacTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCgaga < 2:811370/100‑1 (MQ=255) actactCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGAt < 2:2198948/100‑1 (MQ=255) ctactCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATc < 2:3525475/100‑1 (MQ=255) actCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCAt < 2:5190031/100‑1 (MQ=255) tCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTg < 2:4619174/100‑1 (MQ=255) tCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTg < 2:4056251/100‑1 (MQ=255) ccccTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGa > 2:1022885/1‑100 (MQ=255) ccccTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGa > 1:60708/1‑100 (MQ=255) cccTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGaa < 1:3422814/100‑1 (MQ=255) cccTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCAGTGaa > 2:205616/1‑100 (MQ=255) ccTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAg < 1:946259/100‑1 (MQ=255) ccTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAg < 1:4968897/100‑1 (MQ=255) tAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCa < 2:2904264/100‑1 (MQ=255) aGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAg > 2:4260743/1‑100 (MQ=255) aGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAg < 1:5354388/100‑1 (MQ=255) aGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAg < 2:2021573/100‑1 (MQ=255) gcgcGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGt < 1:3189895/100‑1 (MQ=255) gcgcGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGt < 1:4736163/100‑1 (MQ=255) gcgcGGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGt < 1:1387536/100‑1 (MQ=255) cgcgGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGtt > 1:2593276/1‑100 (MQ=255) gcgGTGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTg < 2:761220/100‑1 (MQ=255) tGGCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGaaaa < 1:5201125/100‑1 (MQ=255) ggCGCGTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCCGTTGaaaaa > 2:2424629/1‑100 (MQ=255) cgcgTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGaaaaaaa < 1:4885190/100‑1 (MQ=255) gcgTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAAt < 1:2552821/100‑1 (MQ=255) gcgTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAAt > 1:1592157/1‑100 (MQ=255) gcgTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTCCCGAGATCATTGAAGCAGGTGAAAAAAAt > 1:543294/1‑100 (MQ=255) gTAGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTg > 2:2811959/1‑100 (MQ=255) aGCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCt < 2:4175102/100‑1 (MQ=255) gCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGTAGTTGAAAAAAATTGCtt > 2:1784098/1‑100 (MQ=255) gCCTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCtt < 1:1833345/100‑1 (MQ=255) ccTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCTTc < 2:5414154/100‑1 (MQ=255) cTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCTTcc < 1:2504811/100‑1 (MQ=255) cTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCTTcc > 1:5509333/1‑100 (MQ=255) cTGCAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCTTcc < 1:1976279/100‑1 (MQ=255) | CAACAAAACACGTTTCGTCGCTGAAGAAACGCGCAACGCCGTGTGGGCAGCGATTAAAGAATTACACTACTCCCCTAGCGCGGTGGCGCGTAGCCTGAAGGTTAACCACACCAAGTCTATCGGTTTGCTGGCGACCAGCAGCGAAGCGGCCTATTTTGCCGAGATCATTGAAGCAGTTGAAAAAAATTGCTTCC > NC_000913/1737909‑1738102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |