| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,738,276 | A→C | M145L (ATG→CTG) | purR → | transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,738,276 | 0 | A | C | 99.1% | 786.4 / ‑4.2 | 221 | M145L (ATG→CTG) | purR | transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (119/100); total (120/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
GCAAAAACGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCATGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAACGCG > NC_000913/1738179‑1738372 | gcAAAATCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTGTGTGTTCCTAGAGTCTTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTg < 2:520763/100‑1 (MQ=255) cAAAAACGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTgg < 1:673781/100‑1 (MQ=255) cAAAAACGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTgg > 1:3582691/1‑100 (MQ=255) cAAAAACGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTgg < 1:4396293/100‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGAc < 1:1422521/100‑1 (MQ=255) aaaaCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGAc < 1:4541398/100‑1 (MQ=255) aaaCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACt > 1:4638915/1‑100 (MQ=255) aaCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACtn < 1:4445217/100‑2 (MQ=255) aaCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTg > 1:3688201/1‑100 (MQ=255) aCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTgg < 2:2069558/100‑1 (MQ=255) aCGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTgg < 1:3030496/100‑1 (MQ=255) aCGCGTCGATGCTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCACAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTgg < 1:4919424/100‑1 (MQ=255) gcgTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTgggg < 1:4348487/100‑1 (MQ=255) gcgTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTgggg < 1:274462/100‑1 (MQ=255) cgTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGt > 2:4742552/1‑100 (MQ=255) gATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAg > 2:1306475/1‑100 (MQ=255) gTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCaaa > 1:1107470/1‑100 (MQ=255) gTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCaaa > 1:3378134/1‑100 (MQ=255) ctgctgGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAg > 1:872081/1‑100 (MQ=255) atctgGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGc < 1:3259375/98‑1 (MQ=255) ctgGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATTGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTg < 1:4464846/100‑1 (MQ=255) ctgGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTg < 2:3703116/100‑1 (MQ=255) ctgGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTg > 1:3127957/1‑100 (MQ=255) tgGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGccgc < 1:4604495/100‑4 (MQ=255) ggTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGcagat > 2:3229032/1‑96 (MQ=255) ggTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGAc < 2:3390921/100‑1 (MQ=255) ggTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGAc < 1:5380476/100‑1 (MQ=255) gTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACt < 2:4683372/100‑1 (MQ=255) gATGTGTTCTGAGTACCCAGATCCGTTGCTGGCGATGCGTGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTTGTCCTGGACTGTTGTGAAGCTAAAGCTGACTTc > 2:4411338/1‑100 (MQ=255) gATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGCCTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTc > 1:2794222/1‑100 (MQ=255) gATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTc > 2:1250607/1‑100 (MQ=255) gATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTc < 2:5436968/100‑1 (MQ=255) tgtgTTCTGGGTACCCAGGGCCGTTGCTGGCGATGCGGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCAc < 2:2016174/100‑1 (MQ=255) tgtgTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCAc < 2:1633559/100‑1 (MQ=255) gtgtTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCAcc < 1:1267432/100‑1 (MQ=255) tgtTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGATGGTCCGGGAGTGGGGTGGAGCAAGAGCTGACTTCACCg > 1:1381287/1‑100 (MQ=255) gtTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGa > 1:3889658/1‑100 (MQ=255) gtTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGa > 1:5096078/1‑100 (MQ=255) gtTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGa > 2:4515790/1‑100 (MQ=255) gtTCGGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGa > 2:1914059/1‑100 (MQ=255) ttCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGAt < 1:2507487/100‑1 (MQ=255) tCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATg > 2:2828171/1‑100 (MQ=255) cTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAGAAGCTGACTTCACCGATGc > 2:4917698/1‑100 (MQ=255) cTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCAGATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCGCCGATGc > 2:5113573/1‑100 (MQ=255) tGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCg > 2:74105/1‑100 (MQ=255) gAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCgg > 1:1646057/1‑100 (MQ=255) aCCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAATAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCAt < 1:3059404/100‑1 (MQ=255) aCCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCan < 1:847293/100‑2 (MQ=255) aCCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCAt > 2:1826691/1‑100 (MQ=255) aCCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCAt > 1:3956212/1‑100 (MQ=255) aCCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCAt > 2:2607135/1‑100 (MQ=255) cccAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCAtt < 2:888788/100‑1 (MQ=255) cccAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCAtt > 1:4022742/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTg > 2:3319869/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTg > 1:4113196/1‑100 (MQ=255) cAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGa < 1:1564458/100‑1 (MQ=255) cAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGa > 1:917094/1‑100 (MQ=255) agagCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGAt > 1:1195542/1‑100 (MQ=255) gagCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATa > 1:2909983/1‑100 (MQ=255) gCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCGCTGGTGGTACGGGTCTGGAGTGAAGCAAAAGCTGACTTCTCCGATGCGGTCATTGATAAc > 2:5341969/1‑100 (MQ=255) ccGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAAcg > 2:3080966/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAAcgcg < 1:484294/100‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAAcgcg > 1:2241041/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAAcgcg > 2:2241071/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTCAAGCAAAAGCTGACTTCACCGGTGCGGTCATTGATAAcgcg < 2:815045/100‑1 (MQ=255) tGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGtt > 1:3521988/1‑100 (MQ=255) gCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTc < 2:2421338/100‑1 (MQ=255) cTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCg < 2:4075977/100‑1 (MQ=255) tGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGa < 2:5025692/100‑1 (MQ=255) tGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCATGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGa > 2:2834978/1‑100 (MQ=255) ggCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGaa > 2:2780018/1‑100 (MQ=255) gCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAg > 2:85790/1‑100 (MQ=255) gATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTCAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAggc < 2:5414550/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAggcg > 2:2947013/1‑100 (MQ=255) aTGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAggcg < 2:4651731/100‑1 (MQ=255) tGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAggcgg < 2:418794/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCt < 2:60020/100‑1 (MQ=255) tGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTa > 2:559642/1‑100 (MQ=255) ggAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTAc < 1:1566598/100‑1 (MQ=255) aaGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACAt < 1:3321478/100‑1 (MQ=255) tATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCg < 1:4275617/100‑1 (MQ=255) tATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCg > 2:3809671/1‑100 (MQ=255) tATCGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCg < 1:315413/100‑1 (MQ=255) cGCCATATCCCAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGc < 1:2838995/100‑1 (MQ=255) cccAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTg > 2:180000/1‑100 (MQ=255) cccAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTg > 1:1747954/1‑100 (MQ=255) cAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGAt > 2:3759561/1‑100 (MQ=255) cAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGAt > 1:2138521/1‑100 (MQ=255) cAATGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGAt < 1:1847400/100‑1 (MQ=255) aaTGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGAtt < 1:2675874/100‑1 (MQ=255) aTGGTGGTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTg < 1:5357585/100‑1 (MQ=255) tggtggTCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGa < 1:566295/100‑1 (MQ=255) gtggtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAc > 2:1465427/1‑100 (MQ=255) gtggtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTGCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAc < 2:2322255/100‑1 (MQ=255) ggtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAcgc < 1:3844892/100‑1 (MQ=255) ggtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAcgc > 1:24005/1‑100 (MQ=255) ggtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAcgc > 1:2714145/1‑100 (MQ=255) gtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAcgcg > 2:3298573/1‑100 (MQ=255) gtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAcgcg > 2:1419523/1‑100 (MQ=255) gtCCTGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAAcgag > 2:157897/1‑98 (MQ=255) | GCAAAAACGCGTCGATGGTCTGCTGGTGATGTGTTCTGAGTACCCAGAGCCGTTGCTGGCGATGCTGGAAGAGTATCGCCATATCCCAATGGTGGTCATGGACTGGGGTGAAGCAAAAGCTGACTTCACCGATGCGGTCATTGATAACGCGTTCGAAGGCGGCTACATGGCCGGGCGTTATCTGATTGAACGCG > NC_000913/1738179‑1738372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |