| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 246,246 | A→C | I86S (ATT→AGT) | dinJ ← | antitoxin of YafQ‑DinJ toxin‑antitoxin system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 246,246 | 0 | A | C | 98.8% | 856.1 / ‑2.3 | 240 | I86S (ATT→AGT) | dinJ | antitoxin of YafQ‑DinJ toxin‑antitoxin system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/3); new base C (121/116); total (121/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGATTA > NC_000913/246149‑246341 | atTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAAtt < 1:4920836/100‑1 (MQ=255) ttCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTcc > 2:5085579/1‑100 (MQ=255) gtggaTTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGGAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTcc < 2:4441442/96‑1 (MQ=255) cAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTa > 1:3292420/1‑100 (MQ=255) aTTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAAt > 1:333941/1‑100 (MQ=255) aTTTATTCATATCATTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAAt < 2:1070534/100‑1 (MQ=255) tttATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAAtt < 1:2943337/100‑1 (MQ=255) tttATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAAtt < 2:884594/100‑1 (MQ=255) ttATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAAttt < 2:828142/100‑1 (MQ=255) tATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTa > 1:1359333/1‑100 (MQ=255) tATTAAAATCCTTAAGATGCTTTAGTGCAAGTTTTACATCCTTGAAATAGTGTCACGATGATTCAATATCCGTTTAAGTCATATTTAAAATCCTAATTTa < 2:3498322/100‑1 (MQ=255) aTTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTAt < 1:1538253/100‑1 (MQ=255) ttCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATc > 2:411506/1‑100 (MQ=255) tCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCa < 1:1950763/100‑1 (MQ=255) tCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCa < 2:607592/100‑1 (MQ=255) tCAGATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCa < 2:3589667/100‑1 (MQ=255) cATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaa > 1:5005109/1‑100 (MQ=255) atatCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaa > 1:5036601/1‑100 (MQ=255) atatCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaa > 1:654117/1‑100 (MQ=255) tatCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaat > 1:442078/1‑100 (MQ=255) catCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGGCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaat < 2:5073791/99‑1 (MQ=255) atCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaata > 2:227679/1‑100 (MQ=255) atCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaata < 2:79328/100‑1 (MQ=255) atCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaata < 2:2152523/100‑1 (MQ=255) tCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaataa < 1:2750838/100‑1 (MQ=255) tCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaataa > 2:78383/1‑100 (MQ=255) ccTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaataaa < 1:4692609/100‑1 (MQ=255) cTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCaaataaat < 1:2171043/100‑1 (MQ=255) aTGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTAGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAatcat < 1:1647741/100‑1 (MQ=255) cTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCGATATCCCTTTTAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGt > 1:3895919/1‑100 (MQ=255) cTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGt > 2:3708757/1‑100 (MQ=255) ttttGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTc < 2:1486342/100‑1 (MQ=255) tttGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCt < 2:3272698/100‑1 (MQ=255) tttGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCt < 1:3470506/100‑1 (MQ=255) gtgCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTg > 1:4825313/1‑100 (MQ=255) tgCAAGTTGTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAACATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTATTTAACCAAATAAATCATCGGCATCTTTgg > 2:5227296/1‑100 (MQ=255) gCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGc < 1:3384258/100‑1 (MQ=255) gCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGc > 2:3068244/1‑100 (MQ=255) cAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGcc > 2:1335729/1‑100 (MQ=255) aGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCtt > 1:5374200/1‑100 (MQ=255) gTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTa > 2:3161180/1‑100 (MQ=255) gTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTa < 1:1435120/100‑1 (MQ=255) gTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTa > 1:3867564/1‑100 (MQ=255) ttttACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTAt < 2:2107742/100‑1 (MQ=255) tttACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATg < 1:5506283/100‑1 (MQ=255) tttACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATg < 1:3530155/100‑1 (MQ=255) tACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGaa > 1:2279213/1‑100 (MQ=255) cATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACa < 2:2289390/100‑1 (MQ=255) aTCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACAt > 1:4152781/1‑100 (MQ=255) tCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATc > 2:1666018/1‑100 (MQ=255) tCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATc < 2:5312868/100‑1 (MQ=255) ccTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCa > 2:3227038/1‑100 (MQ=255) ccTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCa > 1:810890/1‑100 (MQ=255) ccTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCa < 1:2077299/100‑1 (MQ=255) cTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCaa > 2:3153451/1‑100 (MQ=255) cTTTGAATATAGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCaa > 2:1810896/1‑100 (MQ=255) tttGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCATTGGCCTTATGAACATCAAt > 2:1997395/1‑100 (MQ=255) tttGAATATTGTCCCGAGTATTCAAGATCCCTTTGAATCATATTTACCTTCCTAATTTATCAAATTAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAAt < 1:5169754/100‑1 (MQ=255) tGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGc > 2:5395/1‑100 (MQ=255) gAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGcc > 1:236469/1‑100 (MQ=255) aaTATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCa > 2:3311029/1‑100 (MQ=255) gTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCg > 1:1275301/1‑100 (MQ=255) cccGAGTATTCAATATCCCTTTGATTCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGCCGTCTTTGTCCTTATGAACATCAATGCCCGCTTCGCt > 2:2321226/1‑100 (MQ=255) cccGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCt > 2:239728/1‑100 (MQ=255) cccGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCt > 2:1221580/1‑100 (MQ=255) ccGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTg > 2:3531015/1‑100 (MQ=255) ccGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTg > 1:114757/1‑100 (MQ=255) cGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGt > 2:516194/1‑100 (MQ=255) cGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGt > 1:976520/1‑100 (MQ=255) cGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGt > 1:3725789/1‑100 (MQ=255) tATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGttttt < 1:105196/100‑1 (MQ=255) tATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGttttt > 2:1861412/1‑100 (MQ=255) tATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGttttt < 1:4495452/100‑1 (MQ=255) tATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGtttta > 2:4570271/1‑99 (MQ=255) aTTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttg > 1:5255632/1‑100 (MQ=255) aTTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttg > 1:1245362/1‑100 (MQ=255) ttCAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttga < 2:4633879/100‑1 (MQ=255) tCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgat < 1:4193548/100‑1 (MQ=255) cAATATCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgatt > 2:667770/1‑100 (MQ=255) atCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgattgatt < 1:675968/100‑1 (MQ=255) atCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgattgatt > 1:22138/1‑100 (MQ=255) tCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgattgattg < 2:2804229/100‑1 (MQ=255) tCCCTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTttgattgattg > 1:2704405/1‑100 (MQ=255) ccTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGaa < 2:1657453/100‑1 (MQ=255) ccTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGaa > 1:4514986/1‑100 (MQ=255) cTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAAt > 1:3092581/1‑100 (MQ=255) cTTTGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAAt < 1:1672664/100‑1 (MQ=255) tttGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATg < 1:1714877/100‑1 (MQ=255) tttGAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATg > 1:2573949/1‑100 (MQ=255) gAATCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGtt > 2:1773977/1‑100 (MQ=255) aaTCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTa < 1:1888607/100‑1 (MQ=255) tCATATTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAAt < 1:229909/100‑1 (MQ=255) atatTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTg < 2:3860301/100‑1 (MQ=255) atatTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTg < 2:4966707/100‑1 (MQ=255) atatTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTg < 1:2821636/100‑1 (MQ=255) tatTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGa > 2:3897352/1‑100 (MQ=255) tatTTAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGa > 2:1881932/1‑100 (MQ=255) tttAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGAtt > 1:5279905/1‑100 (MQ=255) tttAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGAtt < 2:4348321/100‑1 (MQ=255) ttAACTTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGATTa < 1:2514209/100‑1 (MQ=255) | ATTTCAATTTATTCATATCCTTATGACGCTTTTGTGCAAGTTTTACATCCTTTGAATATTGTCCCGAGTATTCAATATCCCTTTGAATCATATTTAAATTCCTAATTTATCAAATAAATCATCGGCGTCTTTGGCCTTATGAACATCAATGCCAGCTTCGCTGTTTTTGATTGATTGAATGGTTAATTGATTA > NC_000913/246149‑246341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |