| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 443,023 | 0 | T | C | 20.1% | 326.7 / 73.4 | 159 | intergenic (+26/+28) | thiI/yajL | tRNA s(4)U8 sulfurtransferase/oxidative‑stress‑resistance chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/65); new base C (22/10); total (84/75) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.57e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
GGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCC > NC_000913/442924‑443122 | gggTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGt > 2:1091339/1‑100 (MQ=255) gTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCa > 1:3058268/1‑100 (MQ=255) gTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCa < 1:405854/100‑1 (MQ=255) gTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCa < 2:1764714/100‑1 (MQ=255) atgaGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGAt < 2:3924838/100‑1 (MQ=255) atgaGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCACGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGAt > 2:1277188/1‑100 (MQ=255) tgaGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATg > 2:3935268/1‑100 (MQ=255) tgaGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATg < 1:3568091/100‑1 (MQ=255) gaGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGc > 1:353425/1‑100 (MQ=255) aGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGCTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCg < 1:3946756/100‑1 (MQ=255) gCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGa > 2:3303771/1‑100 (MQ=255) ccGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGAc < 1:2896510/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACg > 2:2114540/1‑100 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACg > 2:2426406/1‑100 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 1:940466/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 1:569142/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 1:3955344/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 2:2262383/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 2:2577872/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 2:3941560/100‑1 (MQ=255) cGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 1:1094084/100‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGAATATCGCCCGAAATTTGTGGTTTTTACGTAGCATCTCACTCGATGCGACGt > 2:2653564/1‑100 (MQ=255) tGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTg > 2:570384/1‑100 (MQ=255) gCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGc > 2:1971032/1‑100 (MQ=255) gCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGc > 2:178721/1‑100 (MQ=255) gcgcTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGAATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCa > 1:3915980/1‑100 (MQ=255) cgcTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCAt > 2:629989/1‑100 (MQ=255) ctctATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATcc < 1:2020333/100‑1 (MQ=255) tATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGac > 1:1523476/1‑100 (MQ=255) tATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGac < 2:2086890/100‑1 (MQ=255) tATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGac < 1:2990423/100‑1 (MQ=255) aTCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATAACGCCCGTAACTTGCGGTTTTTACGTCGCATCGGGCCAGATGCGACGCTTGCCGCATCCGaca > 2:1272827/1‑100 (MQ=255) tGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACacta > 1:1035090/1‑100 (MQ=255) tGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACacta > 2:405561/1‑100 (MQ=255) cgcgAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACactact > 1:2390441/1‑100 (MQ=255) cgcgAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACactact < 1:3119373/100‑1 (MQ=255) gcgAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTc > 2:3882352/1‑100 (MQ=255) gAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATATGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGt < 2:2793462/100‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGGATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTGACGTCGCATCTGGTCAGAGGCGACGTTTGCCGCATCCTACACTACTCGt < 2:2493194/100‑1 (MQ=255) gCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaa < 2:2498410/100‑1 (MQ=255) cAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaat < 2:2256603/100‑1 (MQ=255) aGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGtaata < 1:2316758/100‑1 (MQ=255) ggCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTaataat > 2:905417/1‑100 (MQ=255) ggCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTaataat < 1:252333/100‑1 (MQ=255) cTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAAttc < 2:1749854/100‑2 (MQ=255) cTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATta > 1:2910457/1‑100 (MQ=255) ttAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTGATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATtata > 1:2363773/1‑100 (MQ=255) ttAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATtata < 1:3930462/100‑1 (MQ=255) tAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATaa < 1:1980888/100‑1 (MQ=255) aaCAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATaaa < 1:1802896/100‑1 (MQ=255) aCAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAAt < 1:1142072/100‑1 (MQ=255) aTGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATccc < 1:2781114/100‑1 (MQ=255) tgAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTACTAATTATAAATCCCTgc > 2:1124609/1‑100 (MQ=255) tgAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgc < 1:2473137/100‑1 (MQ=255) gAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgcc < 1:695933/100‑1 (MQ=255) aaGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgccg > 1:1369683/1‑100 (MQ=255) ggTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgccgcc > 2:3491386/1‑100 (MQ=255) ggTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCCGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTgccgcc > 2:1734937/1‑100 (MQ=255) tatCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCa < 1:2137126/100‑1 (MQ=255) tCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCAcc < 1:3171449/100‑1 (MQ=255) ccGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCAcaactg > 2:77547/1‑95 (MQ=255) tgaTTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTtgtg < 2:2327439/98‑1 (MQ=255) aTTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGAt < 1:807174/100‑1 (MQ=255) aTTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGAt < 2:3910089/100‑1 (MQ=255) ttGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGc > 1:626118/1‑100 (MQ=255) ttGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACACGTAATAATTATACATCCCTGCCGCCGTCACCAGTTGtgctgc > 1:637192/1‑100 (MQ=255) tgtgGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGcc < 1:3226995/100‑1 (MQ=255) ggTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACAACTGGTGATggcggc < 2:2739432/100‑6 (MQ=255) gTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACtt > 1:797681/1‑100 (MQ=255) tttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCAt < 1:112287/100‑1 (MQ=255) tttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCAt < 1:2412354/100‑1 (MQ=255) caaaCGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCAt > 1:3840065/4‑100 (MQ=39) ttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGATACTACTCGTAATAATTATACATCCCTGCCGCCATCTCCAGTTTTGATGCCATTTCATg < 2:279814/100‑1 (MQ=255) ttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATg < 2:154729/100‑1 (MQ=255) ttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATg < 1:3340232/100‑1 (MQ=255) tACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATgg < 1:2147636/100‑1 (MQ=255) tACGCCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGTAGCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATgg < 1:1656085/100‑1 (MQ=255) aaCGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATgg > 1:1475650/2‑100 (MQ=255) aCGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACCCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATggg > 1:218053/1‑100 (MQ=39) ngTCGCAGCTGGCGAGATGCGACGTTTGCCGCAGTCCACACTACCGGTAATAATTATAACTCCCTAACGCCATCACCCGCTGGCGTGCCAATACATGGGc > 2:551152/2‑100 (MQ=255) cGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc < 1:2868565/100‑1 (MQ=255) cGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc > 1:2257763/1‑100 (MQ=255) cGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc > 1:3146346/1‑100 (MQ=255) cGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc > 1:3457333/1‑100 (MQ=255) cGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc > 1:2278374/1‑100 (MQ=255) cGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAACTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGc > 1:2488810/1‑100 (MQ=255) gTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCt > 1:3916238/1‑100 (MQ=255) gTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCt > 2:246736/1‑100 (MQ=255) gTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCt > 2:3159693/1‑100 (MQ=255) gTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCt > 2:2924477/1‑100 (MQ=255) gTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCt > 1:1710604/1‑100 (MQ=255) gTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCt > 2:863363/1‑100 (MQ=255) tCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCtt > 1:438862/1‑100 (MQ=255) cATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATACATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCttttt < 1:2313789/100‑1 (MQ=255) tCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTcn < 1:3233318/100‑2 (MQ=255) tCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCa < 1:1924178/100‑1 (MQ=255) ggTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTTATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGc > 2:3636810/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGc > 1:3345991/1‑100 (MQ=255) gTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGcc < 2:2172855/100‑1 (MQ=255) gTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTCTTTCACGcc > 2:2323145/1‑100 (MQ=255) | GGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCC > NC_000913/442924‑443122 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |